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Im Bereich der Arzneimittelforschung und -entwicklung spielen niedermolekulare Arzneimittel eine wichtige Rolle. Die derzeit von der FDA zugelassenen Medikamente zielen auf insgesamt 812 verschiedene menschliche Proteine ​​ab. Unter den Arzneimitteln, die gegen die oben genannten Ziele gerichtet sind, handelt es sich bei 84 % um niedermolekulare Arzneimittel. Darüber hinaus wurden nur 639 dieser Proteine ​​mit niedermolekularen Medikamenten ins Visier genommen. Die Wechselwirkung zwischen niedermolekularem Wirkstoff und Proteinziel umfasst nichtkovalente und kovalente Modi, wobei ersterer derzeit vorherrschend ist.

Nichtkovalente Wechselwirkungen wie Wasserstoffbrückenbindungen und π-π-Stapelung können durch Proteindenaturierung gestört werden. Um dieser Herausforderung zu begegnen, nutzt unsere Plattform die Photoaffinitätsmarkierung, eine bewährte Technik zur präzisen Anbringung „chemischer Markierungen“ an der aktiven Stelle eines Proteins. Darüber hinaus wandelt unsere innovative In-situ-Strategie zur chemischen Vernetzung vorübergehende nichtkovalente Proteininteraktionen in kovalente und dauerhafte chemische Bindungen um. Durch die Verwendung einer chemischen Sonde, die sowohl mit Photoaffinität als auch mit bioorthogonalen Einheiten funktionalisiert ist, hat die Chemoproteomik-Plattform von ChomiX ihre Wirksamkeit beim erfolgreichen Herausfischen von Proteinzielen in Zelllysaten, Geweben und lebenden Zellen unter Beweis gestellt. Das Spektrum der in der Plattform eingesetzten bioaktiven niedermolekularen Arzneimittel umfasst eine Vielzahl von Verbindungen, darunter endogene Metaboliten, Naturstoffe und nichtkovalente synthetische Moleküle.