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Zielidentifizierung und Selektivitätsanalyse gezielter Proteinabbauer
Das Medikament Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) ist ein bifunktionales Molekül, das an das Zielprotein binden und die Ubiquitin-E3-Ligase für den Abbau rekrutieren kann. Daher haben neuartige Modalitäten wie PROTAC und molekularer Kleber die Fähigkeit, die Häufigkeit endogener Proteine unbeabsichtigt zu verändern, was eine neue therapeutische Methode für Proteinziele, insbesondere für nicht behandelbare Proteine, darstellt. Die umfassende Quantifizierung der Häufigkeit von On-Target- und Off-Target-Proteinen gehört zu den Standardexperimenten für die Forschung und Entwicklung von TPD-Arzneimitteln.
Technische Plattform
ChomiX hat innovative quantitative chemische Proteomikplattformen entwickelt, die eine präzise Analyse von über 5.000 Proteinen in einer einzelnen Zelllinie ermöglichen und umfassende Studien zur Zielselektivität unterstützen. Beispielsweise extrahiert und verarbeitet die Tandem Mass Tag (TMT)-Plattform Proteome aus Zellen, die mit Proteinabbaumitteln behandelt wurden, und nutzt dabei enzymatischen Aufschluss, Markierung und Flüssigkeitschromatographie für eine umfassende Proteomabdeckung. Anschließend analysiert die Massenspektrometrie die Unterschiede in der Proteinhäufigkeit und liefert wichtige Ziel- und Selektivitätsdaten für die Entwicklung von Proteinabbauern. Darüber hinaus quantifiziert die Data Independent Acquisition (DIA)-Plattform von ChomiX effizient Proteine mit geringer Häufigkeit in komplexen Proben und identifiziert subtile Unterschiede im gesamten Proteom.
Unsere Vorteile
1. Technische Exzellenz: Erfahrenes Team, erstklassige Fachzeitschriftenpublikationen und maßgebliche Branchendienstleistungen.
2. Kernpatenttechnologie: Exklusive Patente und fortschrittliche Hardware zur Unterstützung der frühen Arzneimittelentwicklung.
3. One-Stop-Service: Umfasst Sondendesign, Synthese, Zielerkennung, bioinformatische Analyse und zeitnahes Fortschrittsfeedback zur Kundenzufriedenheit.
4. Strenges Qualitätsmanagement: Die ISO9001-Zertifizierung gewährleistet vertrauenswürdige und authentische Berichte.
Unser Service
| Projekt | Identifizierung und Selektivitätsanalyse von Proteinabbauzielen |
| Probe | Zelllysat, lebende Zellen |
| Hardwareplattform | Berührungsloser Ultraschall-Zellpulverisierer, ChemiDoc MP-Bildgebungssystem, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 Massenspektrometer |
| Projektdauer | 3-4 Wochen |
| Leistungen | Projektbericht (einschließlich experimenteller Verfahren, Datenanalysediagramme, Ergebnisse der bioinformatischen Analyse) |
| Preis | Klicken Sie hier, um sich zu beraten |
Fallstudie
Projektziel: Zwei PROTAC-Moleküle wurden entworfen und synthetisiert. Zum Vergleich der Selektivität müssen die On- und Off-Target-Proteine analysiert werden.
Experimentelle Methode: Für die Proteomanalyse wurde eine TMT-basierte quantitative MS-Methode verwendet.
Projektergebnisse:
Insgesamt wurden 5900 Proteine in Tumorzelllinien quantifiziert und ON- und OFF-Ziele für PROTAC1- und 2-Moleküle identifiziert (Orbitrap Exploris 480-Massenspektrometer, TMT10plex und Datenanalyse durch PD 2.5).
