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Identifizierung von Protein-Protein-, Antikörper-Antigen-Interaktionsregionen: Chemische Vernetzung
Um ihre biologischen Funktionen aufzudecken, ist es wichtig, die Struktur und Wechselwirkungen von Proteinen zu verstehen. Aufgrund der Komplexität des Proteoms kann keine einzelne Technik diese Aspekte vollständig aufdecken. Biologen verwenden häufig eine Kombination verschiedener Methoden, wobei die vernetzende Massenspektrometrie (XL-MS) durch ihre einzigartigen Vorteile hervorsticht.
XL-MS liefert präzise räumliche Abstandsinformationen zwischen Aminosäureresten und bietet zahlreiche Vorteile: minimaler Probenbedarf, geringe Umweltanforderungen, keine Molekulargewichtsbeschränkungen, In-situ-Vernetzung, Benutzerfreundlichkeit und umfangreiche Datenausgabe.
Die XL-MS-Technologie von ChomiX nutzt verschiedene chemische Vernetzer, um auf bestimmte Aminosäurereste abzuzielen, Protein-Protein- und Antikörper-Antigen-Wechselwirkungen präzise zu vernetzen und zu analysieren.
Technische Plattform
Gängige chemische Vernetzer (wie in der Abbildung unten gezeigt) können bestimmte Aminosäurereste kovalent vernetzen, wenn sie Proteinsystemen hinzugefügt werden. Nach der enzymatischen Verdauung entstehen vernetzte Peptide, die die Interaktionsbereiche zwischen Proteinen darstellen. Durch massenspektrometrische Identifizierung und genaue Analyse der Peptidsequenzen können Informationen über die Interaktionsregionen gewonnen werden.
Amino-zu-Thiol-Vernetzer BS3
Amino-Sulfhydryl-Vernetzer EMCS
Unsere Vorteile
1. Professionelle Exzellenz: Unser Team verfügt über umfangreiche Erfahrung und Veröffentlichungen in Top-Zeitschriften und bietet branchenführende technische Dienstleistungen.
2. Effiziente Lösungen: Wir setzen zuverlässige Methoden ein, um Projekte schnell voranzutreiben und sorgenfreie Lösungen zu liefern.
3. Strenges Qualitätsmanagement: Durch die Einhaltung der ISO 9001-Standards gewährleistet unser ausgereiftes Qualitätsmanagementsystem die Authentizität und Zuverlässigkeit unserer Berichte.
4. Systematisches Projektmanagement: Von der Beratung bis zur Berichterstellung sorgen wir für zeitnahe Fortschrittsaktualisierungen und stellen so die Kundenzufriedenheit und eine effiziente Projektabwicklung sicher.
5. Modernste Ausrüstung: Ausgestattet mit fortschrittlichen Massenspektrometern wie dem Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 und Bruker timsTOF ermöglichen wir bahnbrechende Forschung.
Unser Service
| Projekt | Identifizierung von Interaktionsregionen für Protein-Protein- und Antikörper-Antigen-Interaktionen |
| Probe | Reines Protein, Antikörper-Antigen-Komplex |
| Hardwareplattform | Berührungsloser Ultraschall-Zellpulverisierer, ChemiDoc MP-Bildgebungssystem, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 Massenspektrometer |
| Projektdauer | 2-4 Wochen |
| Leistungen | Projektbericht (einschließlich experimenteller Verfahren, Datenanalysediagramme, Ergebnisse der bioinformatischen Analyse) |
| Preis | Klicken Sie hier, um sich zu beraten |
Fallstudie
In diesem Fall wurde das BSA-Serumprotein mit dem aminreaktiven Vernetzer BS3 vernetzt, um eine dimere Struktur des BSA-Serumproteins aufzubauen. Die massenspektrometrische Analyse der dimeren Struktur identifizierte vernetzte Peptidsegmente, die mit vorhandenen Literaturdaten übereinstimmten, und bestätigte so die Genauigkeit und Zuverlässigkeit des Experiments.
Die tatsächlich nachgewiesenen vernetzten Peptide stimmen mit den in der folgenden Literatur dargestellten vernetzten Peptiden überein:Charakterisierung der Proteinentfaltung durch schnelle Vernetzungsmassenspektrometrie unter Verwendung von Di-ortho-Phthalaldehyd-Vernetzern. Nature Communications, 13(1), 1468.
