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Zielidentifizierung

  • Target Discovery Platform: Entschlüsselung der Mechanismen von Naturstoffen

    Target Discovery Platform: Entschlüsselung der Mechanismen von Naturstoffen

    Die aWirkstoffinnerhalbChinesische Medizin ist eineeine Reihe vonVerbindungSDas havetherapeutische oder physiologische Aktivitäties.Chinesische Arzneimittel sind vielfältig, komplex in der Zusammensetzung und verfügen über ein breites Spektrum an Wirkstoffen.konstituierendein wichtigerWeg zum ErwerbWirkstoffe, Bleiverbindungen und MakingMedikamente.

    UnserChemoproteomik-Plattformzeichnet sich ausentdeckeningProteinzielefür nNaturprodukte in der chinesischen Medizin.Es ist genialverwandelnDas sind dieseNaturstoffe in multifunktionale chemische Sonden, was ihre Biografie widerspiegeltAktivitäten.Diese Sonden können, wenn sie in lebenden Zellen oder erkrankten Geweben eingesetzt werdendirekt erfassenNaturstoffbindende Proteine.Mit Hilfe bioorthogonaler KopplungsreaktionenWir isolieren und reichern diese Zielproteine ​​präzise an. Nutzenhochauflösendes MassenspektrometerDurch die Ometrie erreichen wir eine punktgenaue Genauigkeit bis in die Bindungstaschen.Es rüstet uns ausumfassendere und genauere Informationen, bereit zur EnthüllungDiekompliziertMechanismuszugrunde liegenWirkstoffe in der chinesischen Medizin.

  • Identifizierung nichtkovalenter Bindungstaschen für kleine Moleküle in Zellen

    Identifizierung nichtkovalenter Bindungstaschen für kleine Moleküle in Zellen

    Identifizierung nichtkovalenter Bindungstaschen für kleine Moleküle in Zellen Technische Merkmale der Plattform Für die Arzneimittelforschung und -entwicklung ist es von entscheidender Bedeutung, den Bindungsmodus zwischen kleinen Molekülen und ihren Proteinzielen zu bestimmen.Eine umfassende Analyse dieser Wechselwirkungen sowohl auf struktureller als auch auf physikalisch-chemischer Ebene könnte unser Verständnis der Proteinfunktionen erheblich vertiefen und die Entwicklung und Optimierung von Arzneimitteln erleichtern.Strukturbiologische Techniken, einschließlich Röntgen, Kryo-Elektronen-M...
  • Proteomweites Profiling für Medikamente zum gezielten Proteinabbau (TPD).

    Proteomweites Profiling für Medikamente zum gezielten Proteinabbau (TPD).

    Das Medikament Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) ist ein bifunktionales Molekül, das an das Zielprotein binden und die Ubiquitin-E3-Ligase für den Abbau rekrutieren kann.Daher haben neuartige Modalitäten wie PROTAC und molekularer Kleber die Fähigkeit, die Häufigkeit endogener Proteine ​​unbeabsichtigt zu verändern, was eine neue therapeutische Methode für Proteinziele, insbesondere für nicht behandelbare Proteine, darstellt.Die umfassende Quantifizierung der Häufigkeit von On- und Off-Target-Proteinen gehört zu den Standardexperimenten für die Forschung und Entwicklung von TPD-Arzneimitteln.

  • Identifizierung von Proteinzielen durch differenzielle Proteomik

    Identifizierung von Proteinzielen durch differenzielle Proteomik

    Identifizierung von Proteinzielen durch die Plattform „Differenzielle Proteomik“. Technische Merkmale: Die differenzielle Proteomik untersucht die Veränderungen des Proteoms unter verschiedenen physiologischen oder pathologischen Zuständen, wie z. B. Arzneimittelbehandlungen oder Genregulation, durch den Vergleich von zwei oder mehr Proben.Dieser Ansatz beleuchtet wichtige Lebensprozesse oder schwere Krankheiten, um die wichtigsten verschiedenen Proteine ​​herauszufinden, die als Marker für qualitative und funktionelle Analysen gelten.Tausende Proteine...
  • Chemoproteomisches Profiling von Proteinzielen für nichtkovalente niedermolekulare Arzneimittel

    Chemoproteomisches Profiling von Proteinzielen für nichtkovalente niedermolekulare Arzneimittel

    Nichtkovalente Wechselwirkungen wie Wasserstoffbrückenbindungen und π-π-Stapelung können durch Proteindenaturierung gestört werden.Um dieser Herausforderung zu begegnen, nutzt die ChomiX-Plattform die Photoaffinitätsmarkierung, eine bewährte Technik zur präzisen Anbringung „chemischer Markierungen“ an der aktiven Stelle eines Proteins.Darüber hinaus wandelt die innovative chemische In-situ-Vernetzungsstrategie von ChomiX vorübergehende nichtkovalente Proteininteraktionen in kovalente und dauerhafte chemische Bindungen um.Durch die Verwendung einer chemischen Sonde, die sowohl mit Photoaffinität als auch mit bioorthogonalen Einheiten funktionalisiert ist, hat die Chemoproteomik-Plattform von ChomiX ihre Wirksamkeit beim erfolgreichen Herausfischen von Proteinzielen in Zelllysaten, Geweben und lebenden Zellen unter Beweis gestellt.Das Spektrum der in der Plattform eingesetzten bioaktiven niedermolekularen Arzneimittel umfasst eine Vielzahl von Verbindungen, darunter endogene Metaboliten, Naturstoffe und nichtkovalente synthetische Moleküle.

  • Kompetitive chemoproteomische Profilierung von Proteinzielen für kovalente niedermolekulare Arzneimittel

    Kompetitive chemoproteomische Profilierung von Proteinzielen für kovalente niedermolekulare Arzneimittel

    Ähnlich wie bei nichtkovalenten Arzneimitteln wurde die direkte Pulldown-Strategie unter Verwendung chemischer Sonden, die mit Reportergruppen funktionalisiert sind, auch für kovalente niedermolekulare Arzneimittel erfolgreich demonstriert.Es ist jedoch zu beachten, dass einige kovalente Arzneimittel aufgrund des Verlusts der Bioaktivität oder der Unzugänglichkeit für die Synthese chemische Modifikationen nicht vertragen.Darüber hinaus ist die gebildete kovalente Bindung während der MS-Detektion normalerweise instabil.

    Die kompetitive chemoproteomische Strategie ist eine ideale Alternative, die eine universelle aktivitätsbasierte Sonde zur Proteinmarkierung verwendet.Es wurden spezielle chemische Sonden entwickelt, die mit Cystein-, Lysin-, Serin- und Histidinresten reagieren.Im Prinzip kann der Aminosäurerest, sobald er von einem kovalenten kleinen Molekül besetzt ist, nicht mehr durch die Sonde markiert werden.Dadurch konnten die ON- und OFF-Targets durch diese kompetitive Strategie mit der Aminosäureauflösung umfassend identifiziert werden.