Nuestra plataforma científica,Pantalla ChomiX, que se basa en DIA-ABPP (Perfil de proteínas basado en actividad y adquisición independiente de datos), es una parte importante de nuestra metodología líder en ABPP. A través de nuestroPantalla ChomiXplataforma tecnológica, podemos detectar compuestos de plomo covalentes en busca de objetivos no farmacológicos. El proceso específico incluye el tratamiento con moléculas covalentes de células vivas, la separación y el enriquecimiento de péptidos marcados con sondas químicas, la detección por espectrometría de masas de alta resolución y la construcción de una red de unión al sitio objetivo del fármaco. Esto nos permite evaluar la capacidad de unión y la selectividad de los fármacos para bolsas de residuos de aminoácidos específicos en múltiples dianas proteicas simultáneamente, generando compuestos candidatos. En la actualidad, hemos creado una biblioteca completa de dianas de proteínas, incluida la biblioteca nacional más grande de compuestos covalentes dirigidos a cisteína. , basado en nuestra biblioteca de sondas químicas y otros módulos principales característicos.
La tasa de ocupación del sitio de unión (sitio Protein_Cys) para cada compuesto se determina utilizando las intensidades de espectrometría de masas de péptidos marcados con sonda cuantificados. En esencia, la sonda específica de cisteína compite con compuestos por unirse a una determinada bolsa de unión. Cuanto menor sea la señal del péptido marcado con sonda, mayor será la capacidad de ocupación del compuesto. Para cada sitio de cisteína de la proteína de interés (POI), se realiza la determinación de relaciones de participación objetivo dependientes de la dosis (TE50) para compuestos seleccionados. Luego, los candidatos acertados se confirman mediante la clasificación de sus valores TE50. Cuanto más bajo es el TE50, más fuerte ocupa el compuesto el sitio de cisteína del POI en las células vivas.
