Productos
Identificación de dianas farmacológicas de moléculas pequeñas no covalentes basadas en sondas de fotoafinidad.
Plataforma Técnica
La plataforma de identificación de objetivos de proteómica química basada en sondas de fotoafinidad implica varios pasos clave, incluido el diseño de sondas, la síntesis, la evaluación de la actividad, el etiquetado, el enriquecimiento de proteínas y el análisis de datos. Los fármacos de molécula pequeña no covalentes, como compuestos sintéticos, extractos de hierbas, productos naturales y metabolitos, se pueden modificar en sondas de fotoafinidad. Una vez que estas sondas se unen a sus objetivos dentro de las células, forman interacciones covalentes estables, lo que permite el enriquecimiento selectivo y la identificación de proteínas objetivo de baja abundancia.
Nuestras ventajas
1. Excelencia técnica: equipo experimentado, publicaciones en revistas de primer nivel y servicios industriales autorizados.
2. Tecnología central de patentes: patentes exclusivas y hardware avanzado para respaldar el desarrollo temprano de fármacos.
3. Servicio integral: cubre el diseño de sondas, la síntesis, el descubrimiento de objetivos, el análisis bioinformático y la retroalimentación oportuna del progreso para la satisfacción del cliente.
4. Gestión de calidad rigurosa: la certificación ISO9001 garantiza informes auténticos y confiables.
Nuestro Servicio
| Proyecto | Identificación de objetivos directos para fármacos de molécula pequeña no covalentes |
| Muestra | Proteína recombinante, lisado celular, células vivas, tejido enfermo, sangre, bacterias, tejido vegetal |
| Plataforma de hardware | Pulverizador de células ultrasónico sin contacto, sistema de imágenes ChemiDoc MP, espectrómetro de masas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Duración del proyecto | 4-8 semanas |
| Entregables | Informe del proyecto (incluidos procedimientos experimentales, cuadros de análisis de datos, resultados de análisis bioinformáticos) |
Estudio de caso
Durante el proceso de detección de fármacos, utilizando tecnología de detección de viabilidad celular, se descubrió que el compuesto A exhibía efectos inhibidores significativos sobre las células diana. Para identificar mejor sus proteínas objetivo a nivel molecular, descifrar su mecanismo de acción y explorar nuevos objetivos potenciales, nuestra empresa diseñó y sintetizó la sonda fotorreactiva Sonda A (que incorpora grupos fotorreactivos y bioortogonales) basada en las características de estructura y actividad del compuesto A. Aprovechando la plataforma de tecnología de proteómica química, empleamos técnicas de espectrometría de masas y etiquetado de fluorescencia para la identificación de proteínas diana en líneas celulares relevantes para la actividad. Combinado con métodos de análisis bioinformático, profundizamos en el mecanismo de acción del compuesto A y sus nuevas proteínas diana asociadas.
Según el análisis del gel de fluorescencia del experimento de etiquetado, la sonda A marca eficazmente las proteínas y la señal de etiquetado puede competir significativamente con el compuesto A. Esto indica que la sonda A tiene una cobertura objetivo similar a la del compuesto A, lo que la convierte en una herramienta de sonda química adecuada para posterior descubrimiento del objetivo.
El gráfico del volcán ilustra los resultados del experimento Sonda A versus DMSO (Directo), donde 114 proteínas (resaltadas en rojo en el gráfico superior) fueron enriquecidas significativamente por la Sonda A. En el experimento Sonda A versus (A+Sonda A) (Competencia) En el experimento, la sonda A marcó 38 proteínas (resaltadas en rojo en el gráfico inferior) y compitieron significativamente con el compuesto A original. Estos dos experimentos generaron 32 proteínas con una unión de alta confianza al compuesto A. (n = 3, ratio ≥ 2, valor p ≤ 0,05). El análisis de la vía biológica GO de las 32 proteínas con unión de alta confianza al compuesto A reveló un enriquecimiento significativo en las vías de señalización como el flujo de salida de fosfolípidos, la regulación negativa de la actividad de la lipasa y la regulación del transporte de esteroles, alineándose con el fenotipo.
