Una comprensión profunda de la estructura de las proteínas y sus interacciones es crucial para revelar sus funciones biológicas. Sin embargo, debido a la complejidad y diversidad en el campo de las proteínas, una sola técnica de investigación a menudo tiene dificultades para dilucidar completamente sus misterios. Por lo tanto, los biólogos suelen adoptar una estrategia de integración de múltiples enfoques técnicos para explorar colectivamente la estructura tridimensional y los comportamientos de interacción dinámica de las proteínas. Entre ellas, la tecnología de espectrometría de masas de reticulación XL-MS ha demostrado un valor de investigación excepcional en este campo debido a sus ventajas únicas. Puede proporcionar con precisión información sobre la distancia espacial entre residuos de aminoácidos y tiene muchas ventajas, como requerir pequeñas cantidades de muestra, bajos requisitos ambientales para las proteínas, ausencia de limitaciones de peso molecular, facilidad de entrecruzamiento in situ, simplicidad de operación y obtención de una gran cantidad de proteínas. cantidad de información.
Después de más de veinte años de desarrollo continuo e innovación tecnológica, la tecnología XL-MS ha logrado avances significativos en el diseño experimental, análisis de datos y otros aspectos, y ahora se ha convertido en una herramienta central indispensable en la biología estructural integrada. La tecnología XL-MS empleada por Coalesce Bio utiliza diferentes combinaciones de agentes químicos reticulantes. Estos agentes reaccionan con diferentes residuos de aminoácidos, como grupos carboxilo, amino y sulfhidrilo, lo que permite un entrecruzamiento preciso de las interacciones proteína-proteína y anticuerpo-antígeno, resolviendo así con precisión las regiones de interacción.
Los reticulantes químicos comunes (como se muestra en la figura siguiente) pueden entrecruzar covalentemente residuos de aminoácidos específicos cuando se agregan a sistemas de proteínas. Después de la digestión enzimática, se generan péptidos entrecruzados, que representan las regiones de interacción entre proteínas. Mediante la identificación por espectrometría de masas y el análisis preciso de las secuencias peptídicas, se puede obtener información sobre las regiones de interacción.
Reticulante de amino a tiol BS3
Reticulante aminosulfhidrilo EMCS
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Proyecto | Identificación de regiones de interacción para interacciones proteína-proteína y anticuerpo-antígeno. |
Muestra | Proteína pura, complejo anticuerpo-antígeno. |
Plataforma de hardware | Pulverizador de células ultrasónico sin contacto, sistema de imágenes ChemiDoc MP, espectrómetro de masas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
Duración del proyecto | 2-4 semanas |
Entregables | Informe del proyecto (incluidos procedimientos experimentales, cuadros de análisis de datos, resultados de análisis bioinformáticos) |
Precio | Haga clic para consultar |
En este caso, la proteína del suero BSA se entrecruzó usando el reticulante reactivo con amina BS3 para construir una estructura dimérica de la proteína del suero BSA. El análisis de espectrometría de masas de la estructura dimérica identificó segmentos de péptidos entrecruzados que coincidían con los datos de la literatura existente, validando así la precisión y confiabilidad del experimento.