En el campo del desarrollo de fármacos, los científicos se han dedicado a explorar terapias innovadoras para enfermedades específicas. El análisis diferencial de proteínas se ha convertido en una herramienta clave para comprender mejor los mecanismos moleculares de las enfermedades, identificar objetivos terapéuticos eficaces y proporcionar pistas fundamentales y evidencia científica para el descubrimiento y desarrollo de nuevos fármacos. Esta tecnología permite a los investigadores detectar sistemáticamente cambios en la expresión de proteínas, descubrir proteínas diana relacionadas con enfermedades y guiar el diseño de nuevos fármacos y estrategias de tratamiento personalizadas.
Con el desarrollo y la aplicación de tecnologías de vanguardia, como la secuenciación de alto rendimiento y la espectrometría de masas, la precisión y la cobertura del análisis diferencial de proteínas han mejorado significativamente. Este avance permite a los investigadores profundizar y evaluar meticulosamente posibles objetivos farmacológicos en la progresión de la enfermedad basándose en datos a gran escala. Por lo tanto, en la investigación biomédica moderna, el análisis diferencial de proteínas no es sólo un enfoque clave para desentrañar los complejos procesos biológicos de las enfermedades, sino también un motor esencial que impulsa el progreso en el desarrollo de nuevos fármacos.
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Proyecto | Análisis proteómico cualitativo/cuantitativo |
Muestra | Tejido, precipitado celular, lisado, proteína purificada. |
Plataforma de hardware | VanquishNeo UPLC junto con el espectrómetro de masas Orbitrap Exploris 480 (Thermo Fisher Scientific); UPLC EASY-nLC1200 acoplado con espectrómetro de masas Q Exactive HF-X (Thermo Fisher Scientific) |
Duración del proyecto | 4-8 semanas |
Entregables | Informe del proyecto (incluidas listas de proteínas identificadas cualitativamente/cuantitativamente, análisis bioinformáticos, análisis de control de calidad, etc.) |
Precio | Haga clic para consultar |
Introducción del proyecto: Análisis comparativo de los cambios en los niveles completos del proteoma entre el grupo tratado con el fármaco y el grupo de control para investigar los mecanismos moleculares subyacentes al fenotipo del fármaco.
Tipos de muestras: muestras celulares sometidas a tratamientos farmacológicos y de control, cada una de las cuales comprende tres réplicas biológicas.
Método experimental: identificación cuantitativa de proteínas expresadas diferencialmente a nivel de proteoma completo utilizando una metodología proteómica de etiquetado de isótopos múltiples basada en TMT.
1. Como se muestra en el gráfico del volcán de abundancia diferencial de proteínas, se cuantificaron un total de 5987 proteínas en los seis grupos de muestra. Se realizaron pruebas estadísticas sobre la proporción de cada proteína. En el grupo tratado con el fármaco, 560 proteínas mostraron una regulación positiva, mientras que 363 proteínas mostraron una regulación negativa en abundancia. La información de intensidad correspondiente también se visualizó mediante mapas de calor.
2. Se realizaron análisis de la ruta KEGG y de ontología genética (GO) en las proteínas expresadas diferencialmente, incluidas GOTERM_Proceso biológico, GOTERM_Componente celular y GOTERM_Función molecular. Al evaluar el nivel de importancia del enriquecimiento del término GO, identificamos categorías funcionales y vías significativamente enriquecidas por las proteínas expresadas diferencialmente, contribuyendo así a la exploración de los mecanismos moleculares de los fármacos.
3. Como lo ejemplifica la figura anterior, se observaron proteínas reguladas positivamente enriquecidas significativamente en vías de señalización como la segregación de cromosomas nucleares, la segregación de cromátidas hermanas mitóticas y la segregación de cromátidas hermanas. Esto indica que el fármaco, a nivel molecular, influye en el proceso de separación de la cromatina dentro del núcleo.