La réactivité des résidus d'acides aminés dans les protéines joue un rôle crucial dans la régulation de la fonction des protéines et dans le développement de médicaments. En prenant comme exemple la cystéine, bien qu’elle ne constitue que 1,4 % du protéome, sa distribution est relativement uniforme. En raison de son groupe thiol hautement chimiquement réactif, on le trouve principalement dans les liaisons disulfure, les sites actifs enzymatiques, les sites de liaison des ligands métalliques et les poches de liaison aux médicaments à petites molécules. En conséquence, de nombreux médicaments covalents ciblent les résidus de cystéine, tels que les médicaments covalents à petites molécules kinases (lien). La plupart des conjugués anticorps-médicament (ADC) utilisent également des résidus de cystéine pour conjuguer des médicaments à petites molécules à la surface de l'anticorps. Il existe diverses modifications post-traductionnelles sur les résidus cystéine, telles que la S-nitrosylation, la sulfinylation et la thioestérification, qui régulent la structure et les interactions des protéines. De plus, les résidus de lysine, sérine, méthionine, tyrosine et histidine présents dans les protéines présentent également une réactivité chimique unique, ce qui les rend applicables dans le développement de médicaments covalents et le marquage sélectif des protéines.

Les produits représentatifs sont les suivants :