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Identification des cibles et analyse de sélectivité des dégradeurs de protéines ciblés
Le médicament PROTAC (Proteolysis Targeting Chimeras) est une molécule bifonctionnelle qui peut se lier à la protéine ciblée et recruter l’ubiquitine E3 ligase pour la dégradation. Par conséquent, de nouvelles modalités telles que PROTAC et la colle moléculaire ont la capacité de modifier par inadvertance l’abondance des protéines endogènes, ce qui constitue une nouvelle méthode thérapeutique pour les cibles protéiques, en particulier les protéines non médicamentables. La quantification complète de l’abondance des protéines ciblées et non ciblées a été l’une des expériences standards pour la R&D sur les médicaments TPD.
Plateforme technique
ChomiX a développé des plateformes innovantes de protéomique chimique quantitative, permettant une analyse précise de plus de 5 000 protéines dans une seule lignée cellulaire, prenant en charge des études complètes de sélectivité des cibles. Par exemple, la plateforme Tandem Mass Tag (TMT) extrait et traite les protéomes de cellules traitées avec des dégradateurs de protéines, en utilisant la digestion enzymatique, le marquage et la chromatographie liquide pour une couverture protéomique approfondie. La spectrométrie de masse analyse ensuite les différences d’abondance des protéines, fournissant ainsi des données critiques sur les cibles et la sélectivité pour le développement de dégradeurs de protéines. De plus, la plateforme Data Independent Acquisition (DIA) de ChomiX quantifie efficacement les protéines en faible abondance dans des échantillons complexes, identifiant ainsi les différences subtiles à travers le protéome.
Nos avantages
1. Excellence technique : équipe expérimentée, publications de revues de premier plan et services industriels faisant autorité.
2. Technologie brevetée de base : Brevets exclusifs et matériel avancé pour le développement précoce de médicaments.
3. Service à guichet unique : couvrant la conception de sondes, la synthèse, la découverte de cibles, l'analyse bioinformatique et les commentaires sur les progrès en temps opportun pour la satisfaction du client.
4. Gestion rigoureuse de la qualité : la certification ISO9001 garantit des rapports fiables et authentiques.
Notre service
| Projet | Identification et analyse de sélectivité des cibles de dégradeurs de protéines |
| Échantillon | Lysat cellulaire, cellules vivantes |
| Plateforme matérielle | Pulvérisateur de cellules ultrasoniques sans contact, système d'imagerie ChemiDoc MP, spectromètre de masse Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Durée du projet | 3-4 semaines |
| Livrables | Rapport de projet (y compris les procédures expérimentales, les graphiques d'analyse des données, les résultats de l'analyse bioinformatique) |
| Prix | Cliquez pour consulter |
Étude de cas
Objectif du projet : Deux molécules PROTAC ont été conçues et synthétisées. Les protéines cibles et hors cible doivent être analysées pour comparer la sélectivité.
Méthode expérimentale : la méthode MS quantitative basée sur le TMT a été utilisée pour l’analyse protéomique.
Résultats du projet :
Un total de 5900 protéines ont été quantifiées dans les lignées de cellules tumorales et des cibles ON & OFF ont été identifiées pour PROTAC1 et 2 molécules (spectromètre de masse Orbitrap Exploris 480, TMT10plex et analyse des données par PD 2.5)
