Produits
Identification de cibles médicamenteuses à petites molécules non covalentes basée sur des sondes de photoaffinité
Plateforme technique
La plateforme d'identification de cibles de protéomique chimique basée sur des sondes de photoaffinité implique plusieurs étapes clés, notamment la conception de sondes, la synthèse, l'évaluation de l'activité, le marquage, l'enrichissement en protéines et l'analyse des données. Les médicaments à petites molécules non covalentes, tels que les composés synthétiques, les extraits de plantes, les produits naturels et les métabolites, peuvent être modifiés en sondes de photoaffinité. Une fois que ces sondes se lient à leurs cibles dans les cellules, elles forment des interactions covalentes stables, permettant l’enrichissement sélectif et l’identification de protéines cibles en faible abondance.
Nos avantages
1. Excellence technique : équipe expérimentée, publications de revues de premier plan et services industriels faisant autorité.
2. Technologie brevetée de base : Brevets exclusifs et matériel avancé pour le développement précoce de médicaments.
3. Service à guichet unique : couvrant la conception de sondes, la synthèse, la découverte de cibles, l'analyse bioinformatique et les commentaires sur les progrès en temps opportun pour la satisfaction du client.
4. Gestion rigoureuse de la qualité : la certification ISO9001 garantit des rapports fiables et authentiques.
Notre service
| Projet | Identification de cibles directes pour les médicaments non covalents à petites molécules |
| Échantillon | Protéine recombinante, lysat cellulaire, cellules vivantes, tissus malades, sang, bactéries, tissus végétaux |
| Plateforme matérielle | Pulvérisateur de cellules ultrasoniques sans contact, système d'imagerie ChemiDoc MP, spectromètre de masse Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Durée du projet | 4-8 semaines |
| Livrables | Rapport de projet (y compris les procédures expérimentales, les graphiques d'analyse des données, les résultats de l'analyse bioinformatique) |
Étude de cas
Au cours du processus de criblage de médicaments, utilisant la technologie de criblage de la viabilité cellulaire, le composé A s'est avéré présenter des effets inhibiteurs significatifs sur les cellules cibles. Pour identifier davantage ses protéines cibles au niveau moléculaire, déchiffrer son mécanisme d'action et explorer de nouvelles cibles potentielles, notre société a conçu et synthétisé la sonde photoréactive Probe A (incorporant des groupes photoréactifs et bioorthogonaux) sur la base des caractéristiques de structure et d'activité du composé A. En tirant parti de la plate-forme technologique de protéomique chimique, nous avons utilisé des techniques de marquage par fluorescence et de spectrométrie de masse pour l'identification des protéines cibles dans les lignées cellulaires pertinentes pour l'activité. En combinaison avec des méthodes d'analyse bioinformatique, nous avons approfondi le mécanisme d'action du composé A et ses nouvelles protéines cibles associées.
Sur la base de l'analyse sur gel de fluorescence de l'expérience de marquage, la sonde A marque efficacement les protéines et le signal de marquage peut être significativement concurrencé par le composé A. Cela indique que la sonde A a une couverture cible similaire à celle du composé A, ce qui en fait un outil de sonde chimique approprié pour découverte ultérieure de la cible.
Le tracé Volcano illustre les résultats de l'expérience Probe A vs DMSO (Direct), où 114 protéines (surlignées en rouge dans le tracé supérieur) ont été enrichies de manière significative par la sonde A. Dans l'expérience Probe A vs (A+Probe A) (Concurrence) Dans l'expérience, 38 protéines (surlignées en rouge dans le graphique du bas) ont été marquées par la sonde A et ont été significativement en compétition avec le composé A d'origine. Ces deux expériences ont généré 32 protéines avec une liaison avec un niveau de confiance élevé au composé. A (n = 3, rapport ≥ 2, valeur p ≤ 0,05). L'analyse de la voie biologique GO des 32 protéines se liant avec un niveau de confiance élevé au composé A a révélé un enrichissement significatif des voies de signalisation telles que l'efflux de phospholipides, la régulation négative de l'activité de la lipase et la régulation du transport des stérols, en s'alignant sur le phénotype.
