Analyse protéomique ciblée

La recherche en protéomique peut être classée en deux branches selon qu'elle se concentre ou non sur une certaine classe de protéines : la protéomique ciblée et la protéomique non ciblée. La protéomique ciblée met l'accent sur l'étude précise et approfondie de protéines cibles prédéfinies, tandis que la protéomique non ciblée vise à détecter de manière exhaustive toutes les protéines de l'échantillon, dans le but de découvrir des types de protéines inconnus et des biomarqueurs potentiels, et est donc souvent appelée protéomique de découverte. . Le développement de la protéomique non ciblée est antérieur à celui de la protéomique ciblée et est particulièrement adapté à l’exploration initiale de biomarqueurs.

Lorsque des protéines spécifiques ou des biomarqueurs de valeur sont identifiés dans le cadre d’une recherche protéomique non ciblée, les chercheurs peuvent utiliser davantage la technologie protéomique ciblée pour valider et étudier de manière approfondie ces protéines cibles dans un échantillon de population plus large. Par rapport à la protéomique non ciblée, la protéomique ciblée démontre des performances supérieures en termes de précision, de sensibilité et de reproductibilité, fournissant ainsi des outils plus précis et plus fiables pour une recherche protéomique approfondie.

Plateforme technique

Nous fournissons des services d'analyse protéomique ciblés et non ciblés basés sur la technologie de spectrométrie de masse, dans le but d'offrir à nos clients un soutien complet et approfondi pour la recherche sur les protéines.

Dans le domaine de la protéomique non ciblée, Chomix propose diverses méthodes, notamment la protéomique de quantification sans étiquette, la protéomique de quantification basée sur SILAC et la protéomique de quantification basée sur TMT/IBT, toutes dédiées à la révélation et à la quantification systématiques d'autant de composants protéiques que possible dans l'échantillon. .

Dans le domaine de la protéomique ciblée, Chomix utilise la surveillance des réactions parallèles (PRM) comme technologie de base. Le PRM peut détecter avec sensibilité des fragments peptidiques de faible abondance, éliminer efficacement les interférences protéiques de fond et réaliser une quantification de haute précision, validant et confirmant ainsi efficacement les protéines biologiquement différentielles révélées par la protéomique non ciblée.

Par rapport aux méthodes traditionnelles de quantification ciblée des protéines telles que le Western blot, les approches protéomiques ciblées ne nécessitent pas le développement d’anticorps et peuvent détecter simultanément plusieurs protéines, avec la possibilité d’une quantification absolue si nécessaire.

Nos avantages

1. Excellence professionnelle : Notre équipe possède une vaste expérience et des publications dans les meilleures revues, offrant des services techniques de pointe.

2. Solutions efficaces : nous utilisons des méthodes fiables pour faire avancer les projets rapidement, en fournissant des solutions sans souci.

3. Gestion rigoureuse de la qualité : Adhérant aux normes ISO 9001, notre système de gestion de la qualité mature garantit l'authenticité et la fiabilité de nos rapports.

4. Gestion de projet systématique : de la consultation à la livraison du rapport, nous fournissons des mises à jour en temps opportun, garantissant la satisfaction du client et une exécution efficace du projet.

5. Équipement de pointe : Équipés de spectromètres de masse avancés comme le Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 et le Bruker timsTOF, nous facilitons des recherches révolutionnaires.

Notre service

Projet	Ensemble d'analyse protéomique quantitative ciblée/non ciblée
Échantillon	Tissus, pellets cellulaires, lysats
Plateforme matérielle	VanquishNeo UPLC couplé au spectromètre de masse Orbitrap Exploris 480 (Thermo Fisher Scientific) EASY-nLC1200 UPLC couplé au spectromètre de masse Q Exactive HF-X (Thermo Fisher Scientific)
Durée du projet	4 semaines
Livrables	Rapport de projet (y compris tableaux de données qualitatives/quantitatives sur les protéines, analyse bioinformatique, analyse de contrôle qualité, etc.)
Prix	Cliquez pour consulter

Étude de cas

Pour approfondir les sites de liaison de certaines protéines cibles dans les échantillons cellulaires traités avec le médicament par rapport au groupe témoin, afin de révéler les mécanismes moléculaires liés au phénotype du médicament, nous avons utilisé une approche protéomique quantitative ciblée basée sur la PRM (Parallel Reaction Technologie de surveillance). Chaque groupe a été traité avec deux répétitions biologiques, permettant une identification précise et une analyse quantitative des sites de liaison différentiels.