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Plateforme de découverte Target : Démêler les mécanismes des produits naturels
Le Aingrédient actifdansLa médecine chinoise est uneséries decomposésça haveactivité thérapeutique ou physiologiqueies.Les médicaments chinois sont riches en variété, de composition complexe et contiennent une large gamme d'ingrédients actifs,constituantun importantpossibilité d'acquériringrédients actifs, composés de plomb et makingmédicaments.
Notreplateforme de chimioprotéomiqueexcelle dansdécouvriringcibles protéiquespour nproduits naturels en médecine chinoise.C'est ingénieuxtransformerc'est çaproduits naturels en sondes chimiques multifonctionnelles, reflétant leur biographieactivités.Ces sondes, lorsqu'elles sont appliquées à des cellules vivantes ou à des tissus malades, peuventcapturer directementprotéines naturelles liant les produits.À l'aide de réactions de couplage bioorthogonales, nous isolons et enrichissons précisément ces protéines cibles. Utiliserspectre de masse haute résolutionométrie, nous obtenons une précision extrême jusque dans les pochettes de reliure.Il nous équipe dedes informations plus complètes et précises, prêt à dévoilerlecomplexemécanismesous-tendant leingrédients actifs de la médecine chinoise.
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Identification de poches de liaison non covalentes pour petites molécules dans les cellules
Identification de poches de liaison non covalentes à petites molécules dans les cellules Caractéristiques techniques de la plate-forme Il est essentiel de déterminer le mode de liaison entre les médicaments à petites molécules et leurs cibles protéiques pour la R&D de médicaments.Une analyse complète de ces interactions aux niveaux structurel et physico-chimique pourrait approfondir considérablement notre compréhension des fonctions des protéines et faciliter la conception et l’optimisation des médicaments.Techniques de biologie structurale, notamment les rayons X, la cryoélectronique... -
Profilage à l’échelle du protéome pour les médicaments contre la dégradation ciblée des protéines (TPD)
Le médicament PROTAC (Proteolysis Targeting Chimeras) est une molécule bifonctionnelle qui peut se lier à la protéine ciblée et recruter l’ubiquitine E3 ligase pour la dégradation.Par conséquent, de nouvelles modalités telles que PROTAC et la colle moléculaire ont la capacité de modifier par inadvertance l’abondance des protéines endogènes, ce qui constitue une nouvelle méthode thérapeutique pour les cibles protéiques, en particulier les protéines non médicamentables.La quantification complète de l’abondance des protéines cibles et non ciblées a été l’une des expériences standards pour la R&D sur les médicaments TPD.
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Identification de cibles protéiques par protéomique différentielle
Identification de cibles protéiques par plate-forme de protéomique différentielle Caractéristiques techniques La protéomique différentielle étudie les modifications du protéome sous différents états physiologiques ou pathologiques, tels que les traitements médicamenteux ou la régulation génique, en comparant deux échantillons ou plus.Cette approche met en lumière des processus vitaux importants ou des maladies majeures afin de déterminer les différentes protéines clés considérées comme des marqueurs pour l'analyse qualitative et fonctionnelle.Des milliers de protéines... -
Profilage chimioprotéomique des cibles protéiques pour les médicaments à petites molécules non covalentes
Les interactions non covalentes, telles que les liaisons hydrogène et l'empilement π-π, peuvent être perturbées en raison de la dénaturation des protéines.Pour relever ce défi, la plateforme ChomiX utilise le marquage par photoaffinité, une technique bien établie pour attacher avec précision des « marqueurs chimiques » au site actif d'une protéine.De plus, la stratégie innovante de réticulation chimique in situ de ChomiX transforme les interactions protéiques non covalentes transitoires en liaisons chimiques covalentes et permanentes.En utilisant une sonde chimique fonctionnalisée avec des fragments de photoaffinité et de bioorthogonaux, la plate-forme chimioprotéomique de ChomiX a démontré son efficacité pour détecter avec succès des cibles protéiques dans les lysats cellulaires, les tissus et les cellules vivantes.Le spectre des médicaments bioactifs à petites molécules appliqués dans la plateforme englobe une variété de composés, notamment des métabolites endogènes, des produits naturels et des molécules synthétiques non covalentes.
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Profilage chimioprotéomique compétitif des cibles protéiques pour les médicaments covalents à petites molécules
Semblable aux médicaments non covalents, la stratégie d’extraction directe utilisant des sondes chimiques fonctionnalisées avec des groupes rapporteurs a également été démontrée avec succès pour les médicaments covalents à petites molécules.Cependant, il convient de noter que certains médicaments covalents ne tolèrent pas les modifications chimiques en raison d’une perte de bioactivité ou d’une inaccessibilité synthétique.De plus, la liaison covalente formée est généralement instable lors de la détection MS.
Une stratégie chimioprotéomique compétitive constitue une alternative idéale, qui utilise une sonde universelle basée sur l’activité pour le marquage des protéines.Des sondes chimiques spécifiques se sont développées pour réagir avec les résidus de cystéine, de lysine, de sérine et d'histidine.En principe, une fois occupé par une petite molécule covalente, le résidu acide aminé ne peut plus être marqué par la sonde.En conséquence, les cibles ON et OFF ont pu être identifiées de manière globale grâce à cette stratégie compétitive avec la résolution des acides aminés.
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Découverte chimioprotéomique de nouvelles structures principales pour des cibles non médicamenteuses
Découverte chimioprotéomique de nouvelles structures principales pour des cibles non médicamentables Contexte technique Actuellement, environ 800 protéines seulement ont été ciblées par des médicaments approuvés par la FDA, et un grand nombre de cibles liées à des maladies sont « non médicamentables ».Car, à l’heure actuelle, la plupart des technologies reposent sur des protéines purifiées.L’avènement de la chimprotéomique a révolutionné la découverte de médicaments, depuis les protéines purifiées jusqu’aux cellules vivantes.Il est capable d'analyser quantitativement les interactions entre les petites mol...
