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Proteomica chimica: cisplatino

[Articolo collaborativo] | Utilizzo della strategia di proteomica chimica per svelare la rete proteica bersaglio del cisplatino e migliorare la comprensione del suo meccanismo antitumorale

Con i rapidi progressi della medicina moderna, sono stati raggiunti progressi significativi nella ricerca e nello sviluppo di farmaci antitumorali. Tra questi, il cisplatino si distingue per la sua potente efficacia antitumorale nel trattamento di diversi tumori solidi, fungendo da faro di speranza per numerosi malati di cancro. Nonostante il suo ampio uso clinico, la comprensione dei meccanismi interni dell'azione del cisplatino rimane un argomento centrale attivamente perseguito dalla comunità scientifica. In questo contesto, un gruppo di ricerca del Tongji College of Pharmacy, Huazhong University of Science and Technology, ha pubblicato un articolo intitolato "Molecular Targets of Cisplatin in HeLa Cells Explored Through Competitive Activity-Based Protein Profiling Strategy" sul Journal of Inorganic Biochemistry ( Fattore di impatto 3.9). Sfruttando la tecnologia di analisi chimica proteomica competitiva basata su sonde specifiche per la cisteina (ABPP competitivo), lo studio identifica accuratamente i bersagli del cisplatino e i loro siti d'azione nelle cellule HeLa.

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Con i rapidi progressi della medicina moderna, sono stati raggiunti progressi significativi nella ricerca e nello sviluppo di farmaci antitumorali. Tra questi, il cisplatino si distingue per la sua potente efficacia antitumorale nel trattamento di diversi tumori solidi, fungendo da faro di speranza per numerosi malati di cancro. Nonostante il suo ampio uso clinico, la comprensione dei meccanismi interni dell'azione del cisplatino rimane un argomento centrale attivamente perseguito dalla comunità scientifica. In questo contesto, un gruppo di ricerca del Tongji College of Pharmacy, Huazhong University of Science and Technology, ha pubblicato un articolo intitolato "Molecular Targets of Cisplatin in HeLa Cells Explored Through Competitive Activity-Based Protein Profiling Strategy" sul Journal of Inorganic Biochemistry ( Fattore di impatto 3.9). Sfruttando la tecnologia di analisi chimica proteomica competitiva basata su sonde specifiche per la cisteina (ABPP competitivo), lo studio identifica accuratamente i bersagli del cisplatino e i loro siti d'azione nelle cellule HeLa.

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Un metodo competitivo di profilazione della cisteina è stato utilizzato per identificare la cisteina legante il cisplatino nei proteomi delle cellule HeLa utilizzando la sonda iodoacetamide destiobiotina.

In questo articolo, Chomix ha fornito il supporto di esperti nella preparazione dei campioni di proteomica chimica e nell'identificazione e analisi tramite spettrometria di massa durante il processo di scoperta del target. Sfruttando apparecchiature per spettrometria di massa ad alta risoluzione e tecnologia di proteomica chimica, i campioni di cellule HeLa trattati con cisplatino sono stati sottoposti a una serie di analisi tra cui l'etichettatura della sonda reattiva alla cisteina (DBI), la separazione della precipitazione delle proteine, la digestione con trypsin, l'etichettatura degli isotopi, l'arricchimento di peptidi marcati con la sonda, e LC-MS/MS. Questo approccio completo ha identificato con successo 3571 peptidi, corrispondenti a 1871 proteine, con 46 proteine ​​identificate come potenziali bersagli del cisplatino. Queste proteine ​​​​bersaglio sono prevalentemente associate al metabolismo dei folati, alla deubiquitinazione delle proteine, alla sintesi della tetraidrobiopterina, al metabolismo del tetraidrofolato e ad altri percorsi. Il servizio professionale di identificazione dei target di Chomix garantisce l'affidabilità e l'accuratezza dei dati, migliorando significativamente la credibilità e il valore scientifico dei risultati della ricerca.

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Figura 2: Analisi funzionale delle proteine ​​bersaglio del cisplatino

Oltre alla preparazione dei campioni mediante proteomica chimica e all'identificazione mediante spettrometria di massa, i servizi di identificazione dei target forniti da Chomix includono anche l'identificazione dei siti di legame farmaco-proteina, fondamentale per rivelare il meccanismo d'azione dei farmaci. Per convalidare ulteriormente l'effetto legante tra il cisplatino e i suoi bersagli proteici appena scoperti, è stato scelto per la convalida il CAPN 1 ad alta confidenza. La proteina è stata incubata con cisplatino in un rapporto molare di 1:10 ed è stato osservato un nuovo picco di prodotto oltre al picco di massa originale della proteina, con la differenza di massa corrispondente a quella di 10 molecole di cisplatino. Questo risultato dimostra chiaramente l'interazione tra CAPN 1 e cisplatino. Precedenti studi hanno dimostrato che l’apoptosi indotta dal cisplatino nelle cellule HeLa è inibita, indicando una correlazione positiva tra la proteina e l’attività antitumorale del cisplatino. Questo studio fornisce nuove informazioni per esplorare ulteriormente il meccanismo d’azione e la tossicità del cisplatino.

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Figura 3: Prima e dopo la reazione tra la proteina CAPN 1 e il cisplatino.

In sintesi, questo articolo chiarisce con successo gli obiettivi del cisplatino nelle cellule HeLa utilizzando il metodo ABPP competitivo, identificando il nuovo bersaglio CAPN 1. Questa scoperta fornisce informazioni cruciali sui meccanismi alla base dell'azione e della tossicità del cisplatino. Questo studio non solo arricchisce la nostra comprensione del meccanismo d'azione del cisplatino, ma fornisce anche un potente strumento per futuri sforzi di ricerca in questo campo.

Nota speciale: questo articolo ha partecipato al "ChomiX Paper Publication Award Program" e ha ricevuto un generoso premio da Chomix. Estendiamo un caloroso invito a più ricercatori a partecipare al "ChomiX Paper Publication Award Program". Riconoscendo i prodotti o servizi ChomiX (ad esempio, "Ringraziamo ChomiX Biotech Co., Ltd. (Nanjing, Cina) per il suo inestimabile contributo ai nostri esperimenti di proteomica chimica"), i ricercatori possono potenzialmente partecipare a questo programma di incentivi, promuovendo l'innovazione e facilitando lo scambio dei risultati della ricerca. Chomix resta impegnato ad essere un partner costante nella comunità della ricerca scientifica, promuovendo attivamente il progresso scientifico globale e collaborando alla ricerca all'avanguardia sui meccanismi d'azione dei farmaci. Prevediamo con impazienza di collaborare con più team di ricerca scientifica per inaugurare una nuova era di scoperte scientifiche.