Analisi omica delle modifiche post-traduzionali della cisteina

La cisteina, con la sua notevole reattività, svolge un ruolo fondamentale nella struttura e nella funzione delle proteine. Fungendo da reagente nucleofilo, centro catalitico redox, ligando di ioni metallici e sito chiave per i cambiamenti conformazionali, partecipa ampiamente e influenza profondamente l'attività proteica e i meccanismi regolatori. Vale la pena notare che i residui di cisteina sono inclini a subire vari tipi di modifiche post-traduzionali (PTM), che non solo regolano finemente le proprietà funzionali delle proteine, ma possono anche portare a compromissioni funzionali. Data la stretta associazione di tali modifiche con numerose importanti malattie umane, l'analisi qualitativa e quantitativa dei PTM della cisteina nelle proteine è di fondamentale importanza. Ciò ha un valore indispensabile per una comprensione approfondita delle funzioni biologiche delle proteine rilevanti e dei loro meccanismi d'azione negli stati di salute e di malattia.

Chomix ha una vasta esperienza nell'identificazione delle modificazioni della cisteina, come la persulfidazione della cisteina. Utilizzando in modo innovativo sonde universali per cisteina basate sulla differenza di pKa tra -SH e -SSH, regoliamo il pH per ridurre l'interferenza di fondo da -SH, consentendo alle sonde di etichettare prevalentemente -SSH e quindi identificare efficacemente i siti di solfenilazione.

Chomix possiede una tecnologia avanzata di spettrometria di massa in grado di risolvere direttamente e accuratamente vari tipi di modifiche post-traduzionali delle proteine e i loro siti specifici. Attraverso l'integrazione intelligente delle tecniche di separazione e arricchimento con l'etichettatura isotopica e altri metodi avanzati, consentiamo analisi qualitative e quantitative su larga scala e ad alto rendimento di varie modifiche, fornendo un solido supporto tecnico per la ricerca approfondita sulle modifiche post-traduzionali delle proteine.

I nostri vantaggi

1. Competenza professionale: con una vasta esperienza e pubblicazioni su riviste leader, offriamo servizi su misura per risultati ottimali.

2. Gestione rigorosa della qualità: i nostri sistemi di qualità maturi aderiscono agli standard ISO9001, garantendo rapporti affidabili.

3. Servizio completo: dalla progettazione della sonda all'analisi bioinformatica, forniamo consulenza tutto in uno fino alla consegna, con aggiornamenti tempestivi sui progressi.

4. Attrezzature avanzate: dotati di spettrometri di massa all'avanguardia come Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 e Bruker timsTOF, supportiamo la ricerca rivoluzionaria.

Il nostro servizio

Progetto	Analisi omica delle modifiche post-traduzionali della cisteina
Campione	Proteine pure, lisato cellulare, cellule vive, tessuto malato, sangue, batteri, tessuto vegetale
Piattaforma hardware	Polverizzatore di cellule ad ultrasuoni senza contatto, sistema di imaging ChemiDoc MP, spettrometro di massa Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2
Durata del progetto	4-8 settimane
Risultati finali	Rapporto di progetto (comprese procedure sperimentali, grafici di analisi dei dati, risultati di analisi bioinformatica)
Prezzo	Clicca per consultare

Caso di studio

La tiolazione si riferisce all'accoppiamento di un gruppo tiolico (-SSH) ai residui di cisteina nelle proteine, mediato dall'idrogeno solforato (H2S). Per studiare ulteriormente questo processo, interi proteomi possono essere estratti da campioni di cellule o tessuti ed etichettati utilizzando un metodo con sonda chimica (sonda specifica per la cisteina). A differenza dell'interferenza tiolica, questo metodo consente un'efficace marcatura dei gruppi tiolici regolando con precisione il pH. Successivamente, con l'aiuto della spettrometria di massa ad alta risoluzione, i ricercatori possono identificare con precisione i siti di tiolazione, chiarendo così ulteriormente l'importante ruolo di questa modificazione post-traduzionale in vivo.

Utilizzando modelli di cellule HeLa, è stato prima estratto l'intero proteoma. Successivamente, la modellazione con NaHS e la regolazione del pH hanno consentito un'accurata etichettatura dei gruppi tiolici mediante una sonda universale per cisteina. Attraverso una serie di passaggi tra cui arricchimento, digestione enzimatica e rilevamento mediante spettrometria di massa, sono stati identificati 180 peptidi contenenti modifiche -SSH, insieme a 120 proteine correlate, inclusi i siti di tiolazione segnalati GAPDH_C152 e C247.