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Identificazione del target e analisi della selettività dei degradatori proteici mirati
Il farmaco Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) è una molecola bifunzionale che può legarsi alla proteina bersaglio e reclutare l'ubiquitina E3 ligasi per la degradazione. Pertanto, nuove modalità come PROTAC e la colla molecolare hanno la capacità di alterare inavvertitamente l'abbondanza di proteine endogene, il che fornisce un nuovo metodo terapeutico per i bersagli proteici, in particolare le proteine non drogabili. La quantificazione completa dell'abbondanza di proteine sul bersaglio e fuori bersaglio è stato uno degli esperimenti standard per la ricerca e lo sviluppo dei farmaci TPD.
Piattaforma tecnica
ChomiX ha sviluppato innovative piattaforme di proteomica chimica quantitativa, consentendo l'analisi precisa di oltre 5.000 proteine in una singola linea cellulare, supportando studi completi sulla selettività del target. Ad esempio, la piattaforma Tandem Mass Tag (TMT) estrae ed elabora proteomi da cellule trattate con degradatori proteici, utilizzando la digestione enzimatica, l'etichettatura e la cromatografia liquida per una copertura proteica profonda. La spettrometria di massa analizza quindi le differenze nell'abbondanza delle proteine, fornendo dati critici su target e selettività per lo sviluppo del degradatore proteico. Inoltre, la piattaforma Data Independent Acquisition (DIA) di ChomiX quantifica in modo efficiente le proteine a bassa abbondanza in campioni complessi, identificando sottili differenze nel proteoma.
I nostri vantaggi
1. Eccellenza tecnica: team esperto, pubblicazioni su riviste di alto livello e servizi di settore autorevoli.
2. Tecnologia brevettuale di base: brevetti esclusivi e hardware avanzato per il supporto iniziale allo sviluppo di farmaci.
3. Servizio unico: copre la progettazione della sonda, la sintesi, la scoperta del target, l'analisi bioinformatica e il feedback tempestivo sui progressi per la soddisfazione del cliente.
4. Rigorosa gestione della qualità: la certificazione ISO9001 garantisce rapporti affidabili e autentici.
Il nostro servizio
| Progetto | Identificazione e analisi di selettività dei bersagli del degradatore proteico |
| Campione | Lisato cellulare, cellule vive |
| Piattaforma hardware | Polverizzatore di cellule ad ultrasuoni senza contatto, sistema di imaging ChemiDoc MP, spettrometro di massa Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Durata del progetto | 3-4 settimane |
| Risultati finali | Rapporto di progetto (comprese procedure sperimentali, grafici di analisi dei dati, risultati di analisi bioinformatica) |
| Prezzo | Clicca per consultare |
Caso di studio
Scopo del progetto: Sono state progettate e sintetizzate due molecole PROTAC. Le proteine all'interno e all'esterno del bersaglio devono essere analizzate per confrontare la selettività.
Metodo sperimentale: per l'analisi proteomica è stato utilizzato il metodo MS quantitativo basato su TMT.
Risultati del progetto:
Sono state quantificate un totale di 5900 proteine nelle linee cellulari tumorali e sono stati identificati bersagli ON & OFF per le molecole PROTAC1 e 2 (spettrometro di massa Orbitrap Exploris 480, TMT10plex e analisi dei dati mediante PD 2.5)
