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Piattaforma di scoperta degli obiettivi: svelare i meccanismi dei prodotti naturali
L'aingrediente attivoentroLa medicina cinese è unaserie dicompostoSquello ahveattività terapeutica o fisiologicasì.Le medicine cinesi sono ricche di varietà, complesse nella composizione e hanno una vasta gamma di principi attivi,costituenteun importantevia per l'acquisizioneingredienti attivi, composti di piombo e makingmedicinali.
Nostropiattaforma di chemioproteomicaeccelle inscoprireingbersagli proteiciper nprodotti naturali nella medicina cinese.È ingegnosamentetrasformaresono questiprodotti naturali in sonde chimiche multifunzionali, rispecchiando la loro biografiaattività.Queste sonde, se applicate all'interno di cellule vive o tessuti malati, possonocatturare direttamenteproteine naturali che legano il prodotto.Con l'ausilio di reazioni di accoppiamento bioortogonale, isoliamo e arricchiamo con precisione queste proteine bersaglio. Utilizzandospettro di massa ad alta risoluzioneometria, otteniamo una precisione millimetrica fino alle tasche degli attacchi.Ci fornisceinformazioni più complete e precise, pronto a svelareILintricatomeccanismosottostante ilprincipi attivi della medicina cinese.
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Identificazione di tasche di legame di piccole molecole non covalenti nelle cellule
Identificazione di tasche di legame di piccole molecole non covalenti nella piattaforma cellulare Caratteristiche tecniche È fondamentale determinare la modalità di legame tra i farmaci di piccole molecole e i loro bersagli proteici per la ricerca e sviluppo di farmaci.Un'analisi completa di queste interazioni sia a livello strutturale che fisico-chimico potrebbe approfondire in modo significativo la nostra comprensione delle funzioni delle proteine e facilitare la progettazione e l'ottimizzazione dei farmaci.Tecniche di biologia strutturale, tra cui raggi X, crioelettroni... -
Profilazione dell'intero proteoma per farmaci di degradazione proteica mirata (TPD).
Il farmaco Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) è una molecola bifunzionale che può legarsi alla proteina bersaglio e reclutare l'ubiquitina E3 ligasi per la degradazione.Pertanto, nuove modalità come PROTAC e la colla molecolare hanno la capacità di alterare inavvertitamente l'abbondanza di proteine endogene, il che fornisce un nuovo metodo terapeutico per i bersagli proteici, in particolare le proteine non drogabili.La quantificazione completa dell'abbondanza di proteine all'interno e all'esterno del bersaglio è stato uno degli esperimenti standard per la ricerca e lo sviluppo di farmaci TPD.
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Identificazione dei target proteici mediante proteomica differenziale
Identificazione dei bersagli proteici mediante piattaforma di proteomica differenziale Caratteristiche tecniche La proteomica differenziale studia i cambiamenti del proteoma in diversi stati fisiologici o patologici, come trattamenti farmacologici o regolazione genetica, confrontando due o più campioni.Questo approccio fa luce su importanti processi vitali o sulle principali malattie al fine di individuare le diverse proteine chiave considerate marcatori per l'analisi qualitativa e funzionale.Migliaia di proteine... -
Profili chemioproteomici di bersagli proteici per farmaci a piccole molecole non covalenti
Le interazioni non covalenti, come i legami idrogeno e l'impilamento π-π, possono essere interrotte a causa della denaturazione delle proteine.Per affrontare questa sfida, la piattaforma ChomiX utilizza l'etichettatura per fotoaffinità, una tecnica consolidata per attaccare con precisione “etichette chimiche” al sito attivo di una proteina.Inoltre, l'innovativa strategia di reticolazione chimica in situ di ChomiX trasforma le interazioni proteiche transitorie non covalenti in legami chimici covalenti e permanenti.Utilizzando una sonda chimica funzionalizzata sia con fotoaffinità che con porzioni bioortogonali, la piattaforma chemioproteomica di ChomiX ha dimostrato la sua efficacia nell'individuare con successo bersagli proteici all'interno di lisati cellulari, tessuti e cellule viventi.Lo spettro di farmaci bioattivi a piccole molecole applicati nella piattaforma comprende una varietà di composti, inclusi metaboliti endogeni, prodotti naturali e molecole sintetiche non covalenti.
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Profili chemioproteomici competitivi di bersagli proteici per farmaci covalenti a piccole molecole
Similmente ai farmaci non covalenti, la strategia di pulldown diretto utilizzando sonde chimiche funzionalizzate con gruppi reporter è stata dimostrata con successo anche per i farmaci covalenti a piccole molecole.Tuttavia, vale la pena notare che alcuni farmaci covalenti sono intolleranti alle modifiche chimiche dovute alla perdita di bioattività o all’inaccessibilità sintetica.Inoltre, il legame covalente formato è solitamente instabile durante il rilevamento della MS.
La strategia chemioproteomica competitiva è un'alternativa ideale, che utilizza una sonda universale basata sull'attività per l'etichettatura delle proteine.Sono state sviluppate sonde chimiche specifiche per reagire con residui di cisteina, lisina, serina e istidina.In linea di principio, una volta occupato da una piccola molecola covalente, il residuo amminoacidico non può essere marcato dalla sonda.Di conseguenza, gli obiettivi ON e OFF potrebbero essere identificati in modo completo da questa strategia competitiva con la risoluzione dell'amminoacido.
