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I farmaci covalenti funzionano principalmente formando legami covalenti con specifici residui di aminoacidi su proteine ​​bersaglio, come cisteina, lisina e serina. L’aspirina è una delle prime molecole farmacologiche covalenti conosciute. Inoltre, molti prodotti naturali presentano proprietà covalenti, come l’oridonina, che ha una bioattività antinfiammatoria. Negli ultimi anni, i farmaci mirati covalenti hanno guadagnato una crescente attenzione da parte delle aziende farmaceutiche. Ad oggi, la FDA ha approvato almeno sei farmaci covalenti mirati alle chinasi, incluso ibrutinib, che prende di mira la chinasi BTK. 

Nella scoperta di bersagli farmacologici covalenti in cellule o tessuti, una strategia efficace è la modifica chimica di piccole molecole attive introducendo gruppi reporter (come biotina o gruppi bioortogonali). Questa modifica, pur mantenendo l'attività originale della molecola, consente la cattura diretta di bersagli proteici interagenti nelle cellule o nei tessuti vivi. Tuttavia, molte molecole attive sono difficili da modificare chimicamente, oppure i prodotti formati dopo la reazione con residui di amminoacidi sono instabili, il che li rende inadatti al rilevamento tramite spettrometria di massa. Per superare queste sfide, ChomiX offre una soluzione: l’identificazione del sito di modifica utilizzando l’etichettatura competitiva con sonde specifiche per gli aminoacidi.