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Identificazione delle regioni di interazione per le interazioni proteina-proteina e anticorpo-antigene
Identificazione delle regioni di interazione per le interazioni proteina-proteina e anticorpo-antigene Una profonda comprensione della struttura delle proteine e delle sue interazioni è cruciale per rivelare le loro funzioni biologiche. Tuttavia, a causa della complessità e della diversità nel campo delle proteine, una singola tecnica di ricerca spesso fatica a chiarirne completamente i misteri. Pertanto, i biologi adottano tipicamente una strategia di integrazione di più approcci tecnici per esplorare collettivamente le tre dimensioni... -
Identificazione delle reti di interazione proteina-proteina nelle cellule
Identificazione delle reti di interazione proteina-proteina nelle cellule Le interazioni proteina-proteina (PPI) costituiscono una componente fondamentale indispensabile delle attività della vita cellulare, abbracciando molteplici dimensioni temporali e spaziali e influenzando profondamente processi cellulari cruciali come la regolazione del ciclo cellulare, la sintesi e la secrezione proteica, il segnale trasduzione e metabolismo. Pertanto, un'indagine approfondita sulle interazioni proteiche gioca un ruolo fondamentale nello svelare i misteri della biologia molecolare. -
Interazioni proteina-proteina
Interazioni proteina-proteina Le interazioni proteina-proteina (PPI) costituiscono la pietra angolare delle attività della vita cellulare, svolgendo ruoli cruciali nella segnalazione cellulare, nell'assemblaggio strutturale e nei processi vitali chiave come il riconoscimento dell'agente patogeno-ospite. Tuttavia, molti processi patologici sono causati anche da anomalie dei PPI. Pertanto, l’intervento e la regolamentazione degli IPP hanno mostrato un enorme potenziale come mezzo per trattare le malattie correlate. ChomiX integra una serie di piattaforme tecnologiche all'avanguardia... -
Identificazione e analisi di selettività dei bersagli del degradatore proteico
Identificazione e analisi di selettività dei bersagli dei degradatori proteici Negli ultimi anni, la degradazione proteica mirata (TPD) è emersa come una strategia terapeutica innovativa che mira a modulare la malattia intervenendo nell'espressione proteica utilizzando molecole di farmaci. Tra questi approcci, la proteolisi mirata alle chimere (PROTAC) ha raccolto un'attenzione significativa. Il concetto di PROTAC è stato proposto per la prima volta da Crews et al. nel 2001, con l'idea centrale di sfruttare l'ubiquitina-proteasoma endogeno... -
Analisi quantitativa dell'occupazione e della selettività dei bersagli farmacologici a piccole molecole covalenti
Analisi quantitativa dell'occupazione e della selettività dei bersagli farmacologici a piccole molecole covalenti I farmaci covalenti esercitano i loro effetti principalmente formando legami covalenti con specifici residui aminoacidici sulle proteine bersaglio, tra cui cisteina, lisina, serina, tra le altre. L’aspirina è stata la prima molecola farmacologica covalente scoperta e diversi farmaci covalenti rappresentativi con bioattività antinfiammatoria esistono in prodotti naturali, come l’artemisinina. Negli ultimi anni, i farmaci mirati covalenti hanno guadagnato... -
Identificazione delle tasche di legame per farmaci a piccole molecole non covalenti
Identificazione di tasche di legame per farmaci a piccole molecole non covalenti Nel processo di sviluppo di farmaci a piccole molecole, comprendere la modalità di legame tra farmaci e proteine bersaglio è fondamentale per chiarire i meccanismi dei farmaci e guidare la successiva ottimizzazione strutturale. Le tecniche di biologia strutturale come la cristallografia a raggi X, la microscopia crioelettronica (crio-EM) e la risonanza magnetica nucleare (NMR) sono diventate strumenti chiave per determinare i modelli di legame dei farmaci. In particolare, l'alta risoluzione... -
Identificazione di bersagli diretti per farmaci a piccole molecole non covalenti
Identificazione di bersagli diretti per farmaci a piccole molecole non covalenti Nel campo dello sviluppo di farmaci per le malattie, i farmaci a piccole molecole svolgono senza dubbio un ruolo cruciale. Secondo recenti statistiche, tra gli 854 bersagli proteici umani presi di mira dai farmaci approvati dalla FDA, uno sbalorditivo 84% corrisponde a farmaci a piccole molecole. In particolare, solo 665 di questi obiettivi sono stati sviluppati con successo con farmaci a piccole molecole (fonte: https://www.proteinatlas.org/humanproteome/tissue/druggable). Piccolo m... -
Interazioni tra piccole molecole e proteine
Interazioni tra piccole molecole e proteine Le proteine, in quanto partecipanti diretti ed esecutori delle attività della vita, rappresentano obiettivi cruciali per la terapia delle malattie. I farmaci a piccole molecole (composti organici tipicamente con un peso molecolare inferiore a 1000 Da) esercitano effetti terapeutici efficaci modulando finemente le attività, le abbondanze e le interazioni delle proteine. I comuni farmaci a piccole molecole comprendono prodotti naturali e loro derivati (ad esempio, monomeri vegetali) nonché farmaci sintetizzati chimicamente. Su... -
Piattaforma di scoperta degli obiettivi: svelare i meccanismi dei prodotti naturali
L'aingrediente attivoentroLa medicina cinese è unaserie dicompostoSquello ahveattività terapeutica o fisiologicasì. Le medicine cinesi sono ricche di varietà, complesse nella composizione e hanno una vasta gamma di principi attivi,costituenteun importantevia per l'acquisizioneingredienti attivi, composti di piombo e makingmedicinali.
Nostropiattaforma di chemioproteomicaeccelle inscoprireingbersagli proteiciper nprodotti naturali nella medicina cinese. È ingegnosamentetrasformaresono questiprodotti naturali in sonde chimiche multifunzionali, rispecchiando la loro biografiaattività.Queste sonde, se applicate all'interno di cellule vive o tessuti malati, possonocatturare direttamenteproteine naturali che legano il prodotto. Con l'ausilio di reazioni di accoppiamento bioortogonale, isoliamo e arricchiamo con precisione queste proteine bersaglio. Utilizzandospettro di massa ad alta risoluzioneometria, otteniamo una precisione millimetrica fino alle tasche degli attacchi. Ci fornisceinformazioni più complete e precise, pronto a svelareILintricatomeccanismosottostante ilprincipi attivi della medicina cinese.
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Identificazione di tasche di legame di piccole molecole non covalenti nelle cellule
Identificazione di tasche di legame di piccole molecole non covalenti nella piattaforma cellulare Caratteristiche tecniche È fondamentale determinare la modalità di legame tra i farmaci di piccole molecole e i loro bersagli proteici per la ricerca e sviluppo di farmaci. Un'analisi completa di queste interazioni sia a livello strutturale che fisico-chimico potrebbe approfondire in modo significativo la nostra comprensione delle funzioni delle proteine e facilitare la progettazione e l'ottimizzazione dei farmaci. Tecniche di biologia strutturale, tra cui raggi X, microscopia crioelettronica... -
Profilazione dell'intero proteoma per farmaci di degradazione proteica mirata (TPD).
Il farmaco Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) è una molecola bifunzionale che può legarsi alla proteina bersaglio e reclutare l'ubiquitina E3 ligasi per la degradazione. Pertanto, nuove modalità come PROTAC e la colla molecolare hanno la capacità di alterare inavvertitamente l'abbondanza di proteine endogene, il che fornisce un nuovo metodo terapeutico per i bersagli proteici, in particolare le proteine non drogabili. La quantificazione completa dell'abbondanza di proteine all'interno e all'esterno del bersaglio è stato uno degli esperimenti standard per la ricerca e lo sviluppo di farmaci TPD.
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Identificazione dei target proteici mediante proteomica differenziale
Identificazione dei bersagli proteici mediante piattaforma di proteomica differenziale Caratteristiche tecniche La proteomica differenziale studia i cambiamenti del proteoma in diversi stati fisiologici o patologici, come trattamenti farmacologici o regolazione genetica, confrontando due o più campioni. Questo approccio fa luce su importanti processi vitali o sulle principali malattie al fine di individuare le diverse proteine chiave considerate marcatori per l'analisi qualitativa e funzionale. Migliaia di proteine possono essere identificate...
