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Identificazione delle regioni di interazione proteina-proteina, anticorpo-antigene: reticolazione chimica
Identificazione delle regioni di interazione proteina-proteina e anticorpo-antigene: reticolazione chimica Comprendere la struttura e le interazioni delle proteine è essenziale per scoprire le loro funzioni biologiche. A causa della complessità del proteoma, nessuna singola tecnica può rivelare completamente questi aspetti. I biologi utilizzano spesso una combinazione di metodi, tra cui la spettrometria di massa con reticolazione (XL-MS) che si distingue per i suoi vantaggi unici. XL-MS fornisce informazioni precise sulla distanza spaziale tra gli aminoacidi... -
Identificazione dell'interazione proteina-proteina nelle cellule viventi: etichettatura di prossimità
Identificazione dell'interazione proteina-proteina nelle cellule viventi: piattaforma tecnica di etichettatura di prossimità La piattaforma tecnologica TurboID prevede la fusione di una biotina ligasi mutata al C-terminale di una proteina bersaglio. Nelle cellule sovraespresse, l'aggiunta di biotina biotinila rapidamente le proteine interagenti entro 10 minuti, anche a temperatura ambiente, con un rumore di fondo minimo. Questa versatilità rende TurboID adatto a un'ampia gamma di sistemi biologici, comprese cellule di mammiferi, pla... -
Interazioni proteina-proteina
Interazioni proteina-proteina Le interazioni proteina-proteina (PPI) costituiscono la pietra angolare delle attività della vita cellulare, svolgendo ruoli cruciali nella segnalazione cellulare, nell'assemblaggio strutturale e nei processi vitali chiave come il riconoscimento dell'agente patogeno-ospite. Tuttavia, molti processi patologici sono causati anche da anomalie dei PPI. Pertanto, l’intervento e la regolamentazione degli IPP hanno mostrato un enorme potenziale come mezzo per trattare le malattie correlate. ChomiX integra una serie di piattaforme tecnologiche all'avanguardia... -
Identificazione del target e analisi della selettività dei degradatori proteici mirati
Identificazione del target e analisi della selettività dei degradatori proteici target Il farmaco PROTAC (Proteolysis Targeting Chimeras) è una molecola bifunzionale che può legarsi alla proteina target e reclutare l'ubiquitina E3 ligasi per la degradazione. Pertanto, nuove modalità come PROTAC e la colla molecolare hanno la capacità di alterare inavvertitamente l'abbondanza di proteine endogene, il che fornisce un nuovo metodo terapeutico per i bersagli proteici, in particolare le proteine non drogabili. In modo completo... -
Analisi quantitativa dell'occupazione e della selettività dei bersagli farmacologici a piccole molecole covalenti
Analisi quantitativa dell'occupazione e della selettività dei bersagli farmacologici costituiti da piccole molecole covalenti I farmaci covalenti funzionano principalmente formando legami covalenti con specifici residui aminoacidici sulle proteine bersaglio, come cisteina, lisina e serina. L’aspirina è una delle prime molecole farmacologiche covalenti conosciute. Inoltre, molti prodotti naturali presentano proprietà covalenti, come l’oridonina, che ha una bioattività antinfiammatoria. Negli ultimi anni, i farmaci a bersaglio covalente hanno guadagnato crescente attenzione... -
Identificazione del sito di legame per farmaci a piccole molecole non covalenti nelle cellule viventi
Identificazione del sito di legame per farmaci a piccole molecole non covalenti nelle cellule viventi A livello cellulare, lo studio diretto della modalità di azione tra farmaci e proteine bersaglio può aiutare a evitare cambiamenti nella struttura proteica durante la purificazione e risultati falsi positivi che potrebbero derivare da farmaci artificiali sistemi tampone e alte concentrazioni di farmaco-proteine. La piattaforma tecnica ChomiX fornisce servizi di proteomica chimica utilizzando sonde chimiche fotoreattive biologicamente attive (con... -
Identificazione di bersagli farmacologici di piccole molecole non covalenti basati su sonde di fotoaffinità
Identificazione di bersagli farmacologici di piccole molecole non covalenti basati su sonde di fotoaffinità Piattaforma tecnica La piattaforma di identificazione di bersagli di proteomica chimica basata su sonde di fotoaffinità prevede diversi passaggi chiave, tra cui progettazione della sonda, sintesi, valutazione dell'attività, etichettatura, arricchimento proteico e analisi dei dati. I farmaci non covalenti a piccole molecole, come composti sintetici, estratti di erbe, prodotti naturali e metaboliti, possono essere modificati in sonde di fotoaffinità. SU... -
Interazioni tra piccole molecole e proteine
Interazioni tra piccole molecole e proteine Le proteine, in quanto partecipanti diretti ed esecutori delle attività della vita, rappresentano obiettivi cruciali per la terapia delle malattie. I farmaci a piccole molecole (composti organici tipicamente con un peso molecolare inferiore a 1000 Da) esercitano effetti terapeutici efficaci modulando finemente le attività, le abbondanze e le interazioni delle proteine. I comuni farmaci a piccole molecole comprendono prodotti naturali e loro derivati (ad esempio, monomeri vegetali) nonché farmaci sintetizzati chimicamente. Su... -
Piattaforma di scoperta degli obiettivi: svelare i meccanismi dei prodotti naturali
L'aingrediente attivoentroLa medicina cinese è unaserie dicompostoSquello ahveattività terapeutica o fisiologicasì. Le medicine cinesi sono ricche di varietà, complesse nella composizione e hanno una vasta gamma di principi attivi,costituenteun importantevia per l'acquisizioneingredienti attivi, composti di piombo e makingmedicinali.
Nostropiattaforma di chemioproteomicaeccelle inscoprireingbersagli proteiciper nprodotti naturali nella medicina cinese. È ingegnosamentetrasformaresono questiprodotti naturali in sonde chimiche multifunzionali, rispecchiando la loro biografiaattività.Queste sonde, se applicate all'interno di cellule vive o tessuti malati, possonocatturare direttamenteproteine naturali che legano il prodotto. Con l'ausilio di reazioni di accoppiamento bioortogonale, isoliamo e arricchiamo con precisione queste proteine bersaglio. Utilizzandospettro di massa ad alta risoluzioneometria, otteniamo una precisione millimetrica fino alle tasche degli attacchi. Ci fornisceinformazioni più complete e precise, pronto a svelareILintricatomeccanismosottostante ilprincipi attivi della medicina cinese.
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Identificazione di tasche di legame di piccole molecole non covalenti nelle cellule
Identificazione di tasche di legame di piccole molecole non covalenti nella piattaforma cellulare Caratteristiche tecniche È fondamentale determinare la modalità di legame tra i farmaci di piccole molecole e i loro bersagli proteici per la ricerca e sviluppo di farmaci. Un'analisi completa di queste interazioni sia a livello strutturale che fisico-chimico potrebbe approfondire in modo significativo la nostra comprensione delle funzioni delle proteine e facilitare la progettazione e l'ottimizzazione dei farmaci. Tecniche di biologia strutturale, tra cui raggi X, microscopia crioelettronica... -
Profilazione dell'intero proteoma per farmaci di degradazione proteica mirata (TPD).
Il farmaco Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) è una molecola bifunzionale che può legarsi alla proteina bersaglio e reclutare l'ubiquitina E3 ligasi per la degradazione. Pertanto, nuove modalità come PROTAC e la colla molecolare hanno la capacità di alterare inavvertitamente l'abbondanza di proteine endogene, il che fornisce un nuovo metodo terapeutico per i bersagli proteici, in particolare le proteine non drogabili. La quantificazione completa dell'abbondanza di proteine all'interno e all'esterno del bersaglio è stato uno degli esperimenti standard per la ricerca e lo sviluppo di farmaci TPD.
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Identificazione dei target proteici mediante proteomica differenziale
Identificazione dei bersagli proteici mediante piattaforma di proteomica differenziale Caratteristiche tecniche La proteomica differenziale studia i cambiamenti del proteoma in diversi stati fisiologici o patologici, come trattamenti farmacologici o regolazione genetica, confrontando due o più campioni. Questo approccio fa luce su importanti processi vitali o sulle principali malattie al fine di individuare le diverse proteine chiave considerate marcatori per l'analisi qualitativa e funzionale. Migliaia di proteine possono essere identificate...
