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システインの翻訳後修飾オミクス解析

システインは、その優れた反応性により、タンパク質の構造と機能において極めて重要な役割を果たします。求核試薬、酸化還元触媒中心、金属イオンリガンド、および構造変化の重要な部位として機能し、タンパク質の活性および制御機構に広く関与し、深く影響を与えます。システイン残基はさまざまなタイプの翻訳後修飾(PTM)を受ける傾向があり、タンパク質の機能特性を微調整するだけでなく、機能障害を引き起こす可能性があることは注目に値します。このような修飾と多数の主要なヒト疾患との密接な関連性を考慮すると、タンパク質中のシステイン PTM の定性的および定量的分析が最も重要です。これは、関連するタンパク質の生物学的機能と、健康状態および疾患状態におけるそれらの作用機序を深く理解するために不可欠な価値を持っています。

Chomix は、システイン過硫化などのシステイン修飾の同定において豊富な経験を持っています。 -SH と -SSH の pKa の違いに基づいたユニバーサル システイン プローブを革新的に利用することで、pH を調整して -SH からのバックグラウンド干渉を低減し、プローブが主に -SSH を標識できるようにして、スルフェニル化部位を効果的に特定します。

Chomix は、さまざまな種類のタンパク質の翻訳後修飾とその特定の部位を直接かつ正確に解析できる高度な質量分析技術を備えています。分離および濃縮技術と同位体標識やその他の高度な手法を巧みに統合することで、さまざまな修飾の大規模かつハイスループットな定性的および定量的分析が可能になり、タンパク質の翻訳後修飾に関する詳細な研究に強力な技術サポートを提供します。

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私たちの利点

1. 専門的な専門知識: 豊富な経験と主要ジャーナルでの出版実績を活かし、最適な結果を得るためにカスタマイズされたサービスを提供します。

2. 厳格な品質管理: 当社の成熟した品質システムは ISO9001 規格に準拠しており、信頼できるレポートを保証します。

3. 包括的なサービス: プローブの設計からバイオインフォマティクス分析まで、コンサルテーションから納品までオールインワンで提供し、進捗状況をタイムリーに更新します。

4. 高度な機器: Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 や Bruker timsTOF などの最先端の質量分析計を備え、画期的な研究をサポートします。

私たちのサービス

プロジェクト システインの翻訳後修飾オミクス解析
サンプル 純粋なタンパク質、細胞溶解物、生細胞、病変組織、血液、細菌、植物組織
ハードウェアプラットフォーム 非接触超音波細胞粉砕機、ChemiDoc MPイメージングシステム、Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2質量分析計
プロジェクト期間 4~8週間
成果物 プロジェクトレポート(実験手順、データ解析チャート、バイオインフォマティクス解析結果を含む)
価格 クリックして相談する

ケーススタディ

チオール化とは、硫化水素 (H2S) によって媒介される、タンパク質のシステイン残基へのチオール基 (-SSH) の結合を指します。このプロセスをさらに調査するには、細胞または組織サンプルからプロテオーム全体を抽出し、化学プローブ法 (システイン特異的プローブ) を使用して標識します。チオール干渉とは異なり、この方法では pH を正確に調整することでチオール基を効果的に標識できます。その後、高分解能質量分析の助けを借りて、研究者はチオール化部位を正確に特定することができ、それによって生体内でのこの翻訳後修飾の重要な役割をさらに解明することができます。

HeLa 細胞モデルを使用して、最初にプロテオーム全体が抽出されました。その後、NaHS と pH 調整によるモデリングにより、ユニバーサル システイン プローブによるチオール基の正確な標識が可能になりました。濃縮、酵素消化、質量分析検出を含む一連のステップを通じて、報告されているチオール化部位 GAPDH_C152 および C247 を含む 120 の関連タンパク質とともに、-SSH 修飾を含む 180 のペプチドが同定されました。

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-SSH 修飾を含むペプチドの MS/MS スペクトルは次のとおりです。

図5

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