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非共有結合性低分子医薬品の直接標的の同定
疾患の治療薬開発の分野において、低分子医薬品が重要な役割を果たすことは間違いありません。最近の統計によると、FDA が承認した医薬品の対象となる 854 のヒトタンパク質標的のうち、驚くべきことに 84% が低分子医薬品に相当します。注目すべきことに、これらの標的のうち小分子薬の開発に成功したのは 665 個だけです (出典: https://www.proteinatlas.org/humanproteome/tissue/druggable)。小分子薬は、非共有結合および共有結合のメカニズムを通じて標的タンパク質と相互作用することができます。小分子薬剤と標的タンパク質の間の相互作用の大部分は非共有結合で起こり、水素結合、π-πスタッキング、疎水性相互作用などの機構を通じて結合ポケット内のアミノ酸残基と動的かつ可逆的な相互作用を形成します。したがって、複雑なプロテオームから非共有結合性小分子薬剤が結合したタンパク質の濃縮と単離を安定化することは、非常に困難な課題となります。
この課題に対処するために、Chomix はフォトプローブに基づいた化学プロテオミクス ターゲット識別技術プラットフォームを開発しました。このプラットフォームは、生細胞内の小分子とタンパク質間の動的な結合を正確に捕捉し、分離と濃縮を実現し、非共有結合性小分子薬の直接標的をプロテオームレベルで包括的に同定します。
技術プラットフォーム
フォトプローブに基づく化学プロテオミクスターゲット同定プラットフォームには、プローブ設計、合成、活性評価、標識、タンパク質濃縮、データ分析などの重要なステップが含まれます。合成物質、ハーブ化合物、天然物質、代謝産物などの非共有結合性小分子薬物は、光反応性プローブに修飾できます。これらのプローブは、細胞内の標的に結合すると安定した共有結合相互作用を形成し、低存在量の標的タンパク質の選択的な濃縮と同定を可能にします。さまざまな実験設定と組み合わせたこのアプローチは、標的タンパク質の包括的な定量化を提供し、メカニズムを解明し、新しい標的を発見し、より豊富な洞察によって医薬品開発を強化します。
私たちの利点
1. 優れた技術: 経験豊富なチーム、一流の雑誌出版物、権威ある業界サービス。
2. コア特許技術: 初期の医薬品開発をサポートするための独占的な特許と高度なハードウェア。
3. ワンストップサービス: プローブの設計、合成、ターゲットの発見、バイオインフォマティクス分析、および顧客満足のためのタイムリーな進捗フィードバックをカバーします。
4. 厳格な品質管理: ISO9001 認証により、信頼できる本物のレポートが保証されます。
私たちのサービス
| プロジェクト | 非共有結合性低分子医薬品の直接標的の同定 |
| サンプル | 純粋なタンパク質、細胞溶解物、生細胞、病変組織、血液、細菌、植物組織 |
| ハードウェアプラットフォーム | 非接触超音波細胞粉砕機、ChemiDoc MPイメージングシステム、Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2質量分析計 |
| プロジェクト期間 | 4～8週間 |
| 成果物 | プロジェクトレポート（実験手順、データ解析チャート、バイオインフォマティクス解析結果を含む） |
| 価格 | クリックして相談する |
ケーススタディ
細胞生存率スクリーニング技術を利用した薬剤スクリーニングプロセス中に、化合物 A が標的細胞に対して顕著な阻害効果を示すことが判明しました。標的タンパク質を分子レベルでさらに同定し、その作用機序を解読し、潜在的な新しい標的を探索するために、当社は、化合物Aの構造と活性特性に基づいて、光反応性プローブであるプローブA（光反応性基と生体直交性基を組み込んだもの）を設計および合成しました。化学プロテオミクス技術プラットフォームを活用して、活性に関連する細胞株の標的タンパク質を同定するために蛍光標識および質量分析技術を採用しました。バイオインフォマティクス分析手法と組み合わせて、化合物 A とそれに関連する新規標的タンパク質の作用機序をさらに深く掘り下げました。
標識実験の蛍光ゲル分析に基づくと、プローブ A はタンパク質を効果的に標識し、標識シグナルは化合物 A と大幅に競合する可能性があります。これは、プローブ A が化合物 A と同様の標的範囲を有し、プローブ A が次の用途に適した化学プローブツールであることを示しています。その後のターゲット発見。
ボルケーノ プロットは、プローブ A 対 DMSO (直接) 実験の結果を示しており、114 個のタンパク質 (上のプロットで赤色で強調表示) がプローブ A によって大幅に濃縮されました。 プローブ A 対 (A+プローブ A) (競合)実験では、38 個のタンパク質 (下のプロットで赤色で強調表示) がプローブ A で標識され、元の化合物 A と有意に競合しました。これら 2 つの実験により、化合物 A に高い信頼度で結合する 32 個のタンパク質が生成されました (n = 3、比 ≥ 2、p) -値 ≤ 0.05)。化合物 A に高い信頼性で結合する 32 種類のタンパク質の GO 生物学的経路解析により、表現型と一致して、リン脂質流出、リパーゼ活性の負の制御、ステロール輸送の制御などのシグナル伝達経路が大幅に強化されていることが明らかになりました。
