Proteoloss Targeting Chimeras (PROTAC) 薬剤は、標的タンパク質に結合し、分解のためにユビキチン E3 リガーゼを動員できる二機能性分子です。したがって、PROTAC や分子接着剤などの新しい治療法は、内在性タンパク質の存在量を意図せず変化させる能力を備えており、これにより、タンパク質標的、特に薬剤不可能なタンパク質に対する新しい治療法が提供されます。オンターゲットタンパク質とオフターゲットタンパク質の存在量を包括的に定量化することは、TPD 医薬品の研究開発における標準的な実験の 1 つです。
プロジェクトの目的
2 つの PROTAC 分子が設計および合成されました。選択性を比較するには、オンターゲットタンパク質とオフターゲットタンパク質を分析する必要があります。
実験方法
プロテオミクス解析にはTMTベースの定量MS法を使用しました。
腫瘍細胞株で合計 5900 個のタンパク質が定量され、PROTAC1 および 2 分子の ON および OFF ターゲットが同定されました (Orbitrap Exploris 480 質量分析計、TMT10plex、PD 2.5 によるデータ分析)。
•TMT または DIA ベースの定量的化学プロテオミクス分析
•PRMまたはウェスタンブロッティングによるターゲットの検証