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化学プローブに基づくタンパク質の翻訳後修飾 (PTM) 解析
従来の抗体濃縮戦略に加えて、タンパク質の翻訳後修飾 (PTM) の濃縮と同定には、化学的、酵素的、代謝的標識技術が徐々に適用されてきました。基礎となる原理には、化学反応または酵素触媒作用を使用して、特定の分子プローブを標的修飾または修飾残基に共有結合させ、その後プロテオミクス分析を行うことが含まれます。ケモプロテオミクスにおけるこの新たなアプローチは、パルミトイル化、ミリストイル化、グリコシル化などの少量のタンパク質修飾の研究において重要になりつつあります。特に、生細胞に適用できるため、細胞ストレスから生じる酸化などの潜在的な干渉を回避できるという利点があります。
テクニカルサービス
1. システインの翻訳後修飾
システイン (Cys) はタンパク質に含まれる一般的な硫黄含有アミノ酸であり、そのチオール基は分子の酸化還元ホメオスタシスの制御において重要な役割を果たし、さまざまな翻訳後修飾プロセスを通じて酵素反応、タンパク質間相互作用、およびタンパク質の安定性に影響を与えます。システインの一般的な翻訳後修飾には、パルミトイル化、ニトロシル化、スルフェニル化、スルホン化などがあります。 Colosseum Biosciences は、システイン残基をターゲットとするユニバーサル プローブまたは代謝標識戦略を開発し、翻訳後修飾の同定のための対応する化学プロテオミクス プラットフォームを確立しました。このプラットフォームは、標的タンパク質と翻訳後修飾の修飾部位を正確に識別します。
2. リジンの翻訳後修飾
リジン (Lys) は、プロテオーム内で最も多様な翻訳後修飾 (PTM) を持つアミノ酸の 1 つです。可逆的リジン翻訳後修飾 (Lys-PTM) は、多くの重要な細胞機能の調節に不可欠な役割を果たす一般的な生化学プロセスです。リジンの翻訳後修飾には、アセチル化、サクシニル化、プロピオニル化、ブチリル化、クロトニル化、マロニル化、ラクチル化などがあります。 Colosseum Biosciences は、標的タンパク質と修飾部位を正確に特定する、リジンの翻訳後修飾の化学プローブに基づく化学プロテオミクス技術プラットフォームを開発しました。
3. セリン/スレオニンの翻訳後修飾
セリン (Ser) およびスレオニン (Thr) に対する一般的な翻訳後修飾には、主にリン酸化、O-グリコシル化などが含まれます。これらの修飾は、タンパク質の活性状態および他の分子との相互作用に大きな影響を与え、さまざまな重要な生物学的プロセスにおいて重要な役割を果たします。したがって、このタイプの翻訳後修飾の分析は、タンパク質の機能研究における重要なテーマです。 Colosseum Biosciences は、リン酸化濃縮材料、非天然グリカン化学プローブ、その他のツールを利用して、この種の翻訳後修飾の標的タンパク質と修飾部位を正確に特定します。
私たちの利点
01. 高度な専門性:当社の主任科学者である北京大学の王Chu教授の研究グループの支援を受けています。
02. ワンストッププラットフォーム:プローブ設計、プローブ合成、ターゲット発見からバイオインフォマティクス分析までのワークフロー全体を網羅します。
03. 抗体は不要:特定の化学プローブ修飾、生理的
04. 環境:ライセートと生細胞の両方に適用できます。
05. 豊富な経験:10種類以上のPTMに関する蓄積された専門知識
06. 高性能プラットフォーム:サーモフィッシャー オービトラップ エクスプロリス 480、サーモフィッシャー Q エクスアクティブ HF-X、ブルカー・ティムズTOF
ケーススタディ
イタコン化とは、翻訳後修飾中にイタコン酸がタンパク質上の特定の部位に共有結合するプロセスを指します。この修飾によりタンパク質の構造と機能が変化し、細胞内での役割に影響を与える可能性があります。たとえば、イタコン化は酵素の活性、安定性、または他の分子との相互作用を調節できます。イタコン酸はトリカルボン酸回路の中間体であるため、この修飾は細胞の代謝状態と密接に関係しています。研究により、イタコン化が特定の疾患の病理において重要な役割を果たしていることが示されており、この修飾メカニズムを理解することは、新しい治療戦略の開発に役立つ可能性があります。
生細胞レベルでITalkプローブで代謝標識された細胞を溶解し、クリック反応、濃縮、酵素消化などのステップを経て、イタコン酸性化の特異的部位を決定した。
