医薬品開発の分野では、科学者は特定の疾患に対する革新的な治療法の探索に専念してきました。タンパク質の示差分析は、疾患の分子メカニズムについての洞察を得て、効果的な治療標的を特定し、新薬の発見と開発のための重要な手がかりと科学的証拠を提供するための重要なツールとなっています。このテクノロジーにより、研究者はタンパク質発現の変化を体系的に検出し、疾患に関連する標的タンパク質を発見し、新薬開発や個別の治療戦略の設計を導くことができます。
ハイスループットシークエンシングや質量分析などの最先端技術の開発と応用により、タンパク質の示差分析の精度と範囲は大幅に向上しました。この進歩により、研究者は大規模なデータに基づいて、病気の進行における潜在的な薬剤標的を深く掘り下げ、細心の注意を払って評価できるようになります。したがって、現代の生物医学研究において、タンパク質の示差分析は、疾患の複雑な生物学的プロセスを解明するための重要なアプローチであるだけでなく、新薬開発の進歩を推進する重要なエンジンでもあります。
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5. 最先端の機器: Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 や Bruker timsTOF などの高度な質量分析計を備えており、画期的な研究を促進します。
プロジェクト | 定性/定量プロテオミクス解析 |
サンプル | 組織、細胞沈殿物、ライセート、精製タンパク質 |
ハードウェアプラットフォーム | VanquishNeo UPLC と Orbitrap Exploris 480 質量分析計 (Thermo Fisher Scientific) を組み合わせたもの。 EASY-nLC1200 UPLC と Q Exactive HF-X 質量分析計 (Thermo Fisher Scientific) を組み合わせたもの |
プロジェクト期間 | 4~8週間 |
成果物 | プロジェクト報告書(定性・定量的に同定されたタンパク質のリスト、バイオインフォマティクス解析、品質管理解析等を含む) |
価格 | クリックして相談する |
プロジェクト紹介:薬物表現型の分子機構を解明するため、薬物投与群と対照群の全プロテオームレベルの変化を比較解析します。
サンプルの種類:薬物処理および対照処理を施した細胞標本。それぞれ 3 つの生物学的複製で構成されます。
実験方法:TMT ベースの複数同位体標識プロテオミクス手法を使用した、プロテオーム全体レベルでの差次的に発現されたタンパク質の定量的同定。
1. 異なるタンパク質存在量の火山プロットに示されているように、6 つのサンプル グループすべてで合計 5,987 個のタンパク質が定量されました。各タンパク質の比率について統計的検定を実施しました。薬物治療グループでは、560 個のタンパク質がアップレギュレーションを示し、363 個のタンパク質が大量にダウンレギュレーションを示しました。対応する強度情報もヒートマップを使用して視覚化されました。
2. KEGG 経路および遺伝子オントロジー (GO) 分析は、GOTERM_Biological Process、GOTERM_Cellular Component、および GOTERM_Molecular Function を含む、差次的に発現されたタンパク質に対して実行されました。 GO 用語濃縮の有意水準を評価することで、差次的に発現するタンパク質によって大幅に濃縮される機能カテゴリーと経路を特定し、それによって薬物の分子機構の探索に貢献しました。
3. 上の図に例示されているように、核染色体分離、有糸分裂姉妹染色分体分離、姉妹染色分体分離などのシグナル伝達経路において、著しく濃縮された上方制御されたタンパク質が観察されました。これは、薬剤が核内でのクロマチン分離のプロセスに分子レベルで影響を与えていることを示しています。