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非共有結合性小分子薬のタンパク質標的のケモプロテオミクスプロファイリング
水素結合やπ-πスタッキングなどの非共有結合性相互作用は、タンパク質の変性により破壊される可能性があります。この課題に対処するために、ChomiX プラットフォームは、タンパク質の活性部位に「化学標識」を正確に付けるための確立された技術である光親和性標識を採用しています。さらに、ChomiX の革新的な in situ 化学架橋戦略は、一時的な非共有結合によるタンパク質相互作用を共有結合および永久的な化学結合に変換します。 ChomiX のケモプロテオミクス プラットフォームは、光親和性と生体直交性部分の両方で機能化された化学プローブを利用することにより、細胞溶解物、組織、生細胞内のタンパク質標的をうまく見つけ出す有効性を実証しました。このプラットフォームに適用される生理活性小分子薬の範囲には、内因性代謝産物、天然物、非共有結合性合成分子など、さまざまな化合物が含まれます。
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共有結合性小分子薬のタンパク質標的の競合的ケモプロテオミクスプロファイリング
非共有結合性薬剤と同様に、レポーター基で官能化された化学プローブを使用することによるダイレクトプルダウン戦略も、共有結合性小分子薬剤について成功裡に実証されている。ただし、一部の共有結合性薬物は、生物活性の損失や合成不可能なため、化学修飾に耐えられないことは注目に値します。さらに、形成された共有結合は通常、MS 検出中は不安定です。
競合的ケモプロテオミクス戦略は理想的な代替手段であり、タンパク質標識に普遍的な活性ベースのプローブを使用します。システイン、リジン、セリン、ヒスチジン残基と反応する特異的な化学プローブが開発されました。原則として、アミノ酸残基は、共有結合性小分子によって占有されると、プローブによって標識することができなくなります。その結果、この競合戦略によりアミノ酸の分解能によりONターゲットとOFFターゲットを網羅的に同定することができた。
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薬剤不可能な標的に対する新規リード構造の化学プロテオミクス発見
創薬不可能な標的のための新規リード構造の化学プロテオミクス発見 技術的背景 現在、FDA が承認した薬剤の標的となっているタンパク質はわずか 800 個程度であり、疾患関連の標的の多くは「創薬不可能」です。なぜなら、現在、ほとんどのテクノロジーは精製されたタンパク質に依存しているからです。ケムプロテオミクスの出現により、精製タンパク質から生細胞まで創薬に革命が起こりました。低分子と分子間の相互作用を定量的に分析することができます。
