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시스테인 번역 후 변형 오믹스 분석

놀라운 반응성을 지닌 시스테인은 단백질 구조와 기능에 중추적인 역할을 합니다. 친핵성 시약, 산화환원 촉매 센터, 금속 이온 리간드 및 형태 변화의 핵심 부위 역할을 하며 단백질 활동 및 조절 메커니즘에 광범위하게 참여하고 심대한 영향을 미칩니다. 시스테인 잔기는 다양한 유형의 번역 후 변형(PTM)을 겪는 경향이 있으며, 이는 단백질의 기능적 특성을 미세하게 조정할 뿐만 아니라 기능적 손상을 초래할 수도 있다는 점은 주목할 가치가 있습니다. 이러한 변형과 ​​수많은 주요 인간 질병의 밀접한 연관성을 고려할 때, 단백질의 시스테인 PTM에 대한 정성적 및 정량적 분석이 가장 중요합니다. 이는 관련 단백질의 생물학적 기능과 건강 및 질병 상태에서의 작용 메커니즘을 심층적으로 이해하는 데 없어서는 안 될 가치가 있습니다.

Chomix는 시스테인 과황화와 같은 시스테인 변형 식별에 풍부한 경험을 보유하고 있습니다. -SH와 -SSH 사이의 pKa 차이를 기반으로 하는 보편적인 시스테인 프로브를 혁신적으로 활용하여 pH를 조정하여 -SH의 배경 간섭을 줄임으로써 프로브가 주로 -SSH를 라벨링하여 설페닐화 부위를 효과적으로 식별할 수 있습니다.

Chomix는 다양한 유형의 단백질 번역 후 변형 및 특정 부위를 직접적이고 정확하게 분석할 수 있는 첨단 질량분석 기술을 보유하고 있습니다. 분리 및 농축 기술과 동위원소 라벨링 및 기타 고급 방법의 영리한 통합을 통해 다양한 변형에 대한 대규모, 높은 처리량의 정성 및 정량 분석이 가능하며, 단백질 번역 후 변형에 대한 심층 연구를 위한 강력한 기술 지원을 제공합니다.

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우리의 장점

1. 전문적 전문성: 광범위한 경험과 주요 저널의 출판물을 통해 최적의 결과를 위한 맞춤형 서비스를 제공합니다.

2. 엄격한 품질 관리: 당사의 성숙한 품질 시스템은 ISO9001 표준을 준수하여 신뢰할 수 있는 보고서를 보장합니다.

3. 종합 서비스: 프로브 설계부터 생물정보학 분석까지 적시에 진행 상황을 업데이트하여 배송까지 올인원 상담을 제공합니다.

4. 첨단 장비: Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 및 Bruker timsTOF와 같은 최첨단 질량 분석기를 갖추고 획기적인 연구를 지원합니다.

우리의 서비스

프로젝트 시스테인 번역 후 변형 오믹스 분석
견본 순수 단백질, 세포 용해물, 살아있는 세포, 질병 조직, 혈액, 박테리아, 식물 조직
하드웨어 플랫폼 비접촉 초음파 세포 분쇄기, ChemiDoc MP 이미징 시스템, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 질량 분석기
프로젝트 기간 4~8주
결과물 프로젝트 보고서(실험 절차, 데이터 분석 차트, 생물정보학 분석 결과 포함)
가격 상담을 원하시면 클릭하세요

사례 연구

티올화는 황화수소(H2S)에 의해 매개되는 단백질의 시스테인 잔기에 티올기(-SSH)가 결합되는 것을 의미합니다. 이 과정을 더 조사하기 위해 세포 또는 조직 샘플에서 전체 프로테옴을 추출하고 화학적 프로브 방법(시스테인 특이적 프로브)을 사용하여 라벨을 붙일 수 있습니다. 티올 간섭과 달리 이 방법은 pH를 정밀하게 조정하여 티올 그룹의 효과적인 표지가 가능합니다. 그 후, 고해상도 질량 분석법의 도움으로 연구자들은 티올화 부위를 정확하게 식별할 수 있으며, 이를 통해 생체 내에서 번역 후 변형의 중요한 역할을 더욱 명확하게 밝힐 수 있습니다.

HeLa 세포 모델을 사용하여 전체 프로테옴을 먼저 추출했습니다. 그 후, NaHS 및 pH 조정을 사용한 모델링을 통해 범용 시스테인 프로브에 의한 티올 그룹의 정확한 라벨링이 가능해졌습니다. 농축, 효소 소화 및 질량 분석 검출을 포함한 일련의 단계를 통해 보고된 티올화 부위 GAPDH_C152 및 C247을 포함하여 120개의 관련 단백질과 함께 -SSH 변형을 포함하는 180개의 펩타이드가 확인되었습니다.

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다음은 -SSH 변형이 적용된 펩타이드의 MS/MS 스펙트럼입니다.

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