비공유 소분자 약물의 결합 포켓 식별

저분자 약물 개발 과정에서 약물과 표적 단백질 간의 결합 모드를 이해하는 것은 약물 메커니즘을 밝히고 후속 구조 최적화를 안내하는 데 중요합니다. X선 결정학, 저온전자현미경(cryo-EM), 핵자기공명(NMR)과 같은 구조 생물학 기술은 약물 결합 모델을 결정하는 핵심 도구가 되었습니다. 특히, 고해상도 약물-단백질 공결정 구조는 약물 구조 최적화를 크게 촉진했습니다.

그러나 특히 GPCR 및 이온 채널과 같은 막 단백질 표적에 대한 단백질 구조 규명은 생명 과학 연구에서 어려운 과제였습니다. 이 과정에는 단백질 발현 및 정제, 약물-단백질 결정화 조건 스크리닝, 결정 데이터 수집 및 분석을 포함한 여러 단계가 포함되므로 시간이 많이 걸릴 뿐만 아니라 비용도 많이 듭니다.

세포 수준에서 약물과 표적 단백질 사이의 작용 방식을 직접 연구하면 정제 중 단백질 구조의 변화와 인공 완충 시스템 및 높은 약물-단백질 농도로 인해 발생할 수 있는 위양성 결과를 방지하는 데 도움이 될 수 있습니다. Chomix는 저분자 약물과 세포의 표적 단백질 간의 상호 작용을 결정하는 과제를 해결하기 위해 첨단 기술을 활용하여 원스톱 서비스를 제공함으로써 고객의 약물 개발 노력에 강력한 기술 지원을 제공하기 위해 최선을 다하고 있습니다.

기술 플랫폼

Chomix는 생물학적 활성 광반응성 화학 프로브(약물 분자와 유사한 활성)를 활용하여 화학 단백질체학 서비스를 제공합니다. 이러한 프로브는 생리학적으로 관련된 약물 농도에서 질병 관련 세포 또는 조직과 함께 배양된 후 약물 분자 프로브와 단백질 표적 간의 비공유 상호작용을 공유 상호작용으로 변환하는 현장 신속한 광가교 기술이 뒤따릅니다. 그 후, 표적 단백질 농축, 변형되지 않은 펩타이드 세그먼트를 방출하기 위한 효소 소화, 약물 분자 프로브 변형 펩타이드 세그먼트의 선택적 농축과 같은 단계를 생체 분자의 고해상도 질량 분석법과 결합하여 펩타이드 서열 정보를 신속하게 확인할 수 있습니다. 마지막으로, 분자 도킹 도구를 사용하여 표적 단백질과 약물의 결합 모델을 신속하게 획득하여 후속 의약 화학 연구에 대한 강력한 지원을 제공합니다.

우리의 장점

1. 기술적 우수성: 경험이 풍부한 팀, 최고 수준의 저널 간행물 및 권위 있는 업계 서비스.
2. 핵심 특허 기술: 초기 신약 개발 지원을 위한 독점 특허 및 고급 하드웨어.
3. 원스톱 서비스: 프로브 설계, 합성, 표적 발견, 생물정보학 분석 및 고객 만족을 위한 시기적절한 진행 피드백을 포괄합니다.
4. 엄격한 품질 관리: ISO9001 인증은 신뢰할 수 있고 확실한 보고서를 보장합니다.

우리의 서비스

프로젝트	비공유 소분자 약물의 결합 포켓 식별
견본	순수 단백질, 세포 용해물, 살아있는 세포, 질병 조직, 혈액, 박테리아, 식물 조직
하드웨어 플랫폼	비접촉 초음파 세포 분쇄기, ChemiDoc MP 이미징 시스템, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 질량 분석기
프로젝트 기간	2~4주
결과물	프로젝트 보고서(실험 절차, 데이터 분석 차트, 생물정보학 분석 결과 포함)
가격	상담을 원하시면 클릭하세요

사례 연구

후보 약물 분자 B의 표적은 다중 약물 결합 포켓을 갖는 다중 막관통 단백질입니다. X-ray, cryo-EM 등 구조생물학적 방법을 이용한 여러 시도에도 불구하고 약물분자와 목적 단백질 간의 결합 모델을 얻지 못했습니다.
당사에서는 후보 약물 분자 B의 구조와 활성을 기반으로 광반응성 및 생체직교기로 구성된 광반응성 화학 프로브인 Probe B를 설계 및 합성했습니다. 위에서 언급한 화학적 단백질체학 표적 발견 플랫폼을 활용하여 후보 약물 분자 B의 활성과 관련된 세포주에서 표적 단백질을 먼저 검증했습니다. 이어서 질량 분석 기반 비공유 약물 결합 포켓 식별 기술을 활용하여 공간적으로 인접한 펩타이드 세그먼트를 약물 결합 포켓을 결정하고 약물-단백질 결합 모델을 제공했습니다.