광친화성 프로브를 기반으로 하는 화학적 단백질체학 표적 식별 플랫폼에는 프로브 설계, 합성, 활성 평가, 라벨링, 단백질 농축 및 데이터 분석을 포함한 여러 주요 단계가 포함됩니다. 합성 화합물, 허브 추출물, 천연물 및 대사산물과 같은 비공유 결합 소분자 약물은 광친화성 프로브로 변형될 수 있습니다. 이러한 프로브가 세포 내의 표적에 결합하면 안정적인 공유 상호 작용을 형성하여 소량의 표적 단백질을 선택적으로 농축하고 식별할 수 있습니다.
1. 기술적 우수성: 경험이 풍부한 팀, 최고 수준의 저널 간행물 및 권위 있는 업계 서비스.
2. 핵심 특허 기술: 초기 신약 개발 지원을 위한 독점 특허 및 고급 하드웨어.
3. 원스톱 서비스: 프로브 설계, 합성, 표적 발견, 생물정보학 분석 및 고객 만족을 위한 시기적절한 진행 피드백을 포괄합니다.
4. 엄격한 품질 관리: ISO9001 인증은 신뢰할 수 있고 확실한 보고서를 보장합니다.
프로젝트 | 비공유결합 소분자 약물의 직접 표적 식별 |
견본 | 재조합 단백질, 세포 용해물, 살아있는 세포, 질병 조직, 혈액, 박테리아, 식물 조직 |
하드웨어 플랫폼 | 비접촉 초음파 세포 분쇄기, ChemiDoc MP 이미징 시스템, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 질량 분석기 |
프로젝트 기간 | 4~8주 |
결과물 | 프로젝트 보고서(실험 절차, 데이터 분석 차트, 생물정보학 분석 결과 포함) |
세포 생존율 스크리닝 기술을 활용한 약물 스크리닝 과정에서 화합물 A가 표적 세포에 대해 유의미한 억제 효과를 나타내는 것으로 확인되었습니다. 분자 수준에서 표적 단백질을 추가로 식별하고, 작용 메커니즘을 해독하고, 잠재적인 새로운 표적을 탐색하기 위해 당사는 화합물 A의 구조 및 활성 특성을 기반으로 광반응성 프로브 Probe A(광반응성 및 생체직교성 그룹 포함)를 설계하고 합성했습니다. 화학적 단백질체학 기술 플랫폼을 활용하여 우리는 활동과 관련된 세포주에서 표적 단백질 식별을 위해 형광 라벨링 및 질량 분석 기술을 사용했습니다. 생물정보학 분석 방법과 결합하여 화합물 A 및 이와 관련된 새로운 표적 단백질의 작용 메커니즘을 더 깊이 조사했습니다.
라벨링 실험의 형광 젤 분석을 기반으로 프로브 A는 단백질을 효과적으로 라벨링하고 라벨링 신호는 화합물 A와 크게 경쟁할 수 있습니다. 이는 프로브 A가 화합물 A와 유사한 표적 적용 범위를 갖고 있어 다음에 적합한 화학 프로브 도구가 된다는 것을 나타냅니다. 후속 타겟 발견.
Volcano 플롯은 Probe A 대 DMSO(직접) 실험의 결과를 보여줍니다. 여기서 114개의 단백질(상단 플롯에서 빨간색으로 강조 표시됨)이 Probe A에 의해 크게 강화되었습니다. Probe A 대 (A+Probe A)(경쟁) 실험에서 38개의 단백질(하단 플롯에서 빨간색으로 강조 표시됨)이 프로브 A에 의해 표지되었으며 원래 화합물 A와 상당히 경쟁했습니다. 이 두 실험에서는 화합물 A에 대한 높은 신뢰도 결합을 갖는 32개의 단백질이 생성되었습니다(n = 3, 비율 ≥ 2, p-값 ≤ 0.05). 화합물 A에 대한 결합 신뢰도가 높은 32개 단백질에 대한 GO 생물학적 경로 분석에서는 인지질 유출, 리파제 활성의 음성 조절, 스테롤 수송 조절과 같은 신호 전달 경로가 표현형에 맞춰 상당히 강화된 것으로 나타났습니다.