제품
비공유결합 소분자 약물의 직접 표적 식별
질병에 대한 약물 개발 분야에서 소분자 약물은 의심할 여지 없이 중요한 역할을 합니다. 최근 통계에 따르면 FDA 승인 약물의 표적이 되는 854개의 인간 단백질 표적 중 무려 84%가 소분자 약물에 해당합니다. 특히, 이러한 표적 중 665개만이 소분자 약물로 성공적으로 개발되었습니다(출처: https://www.단백질atlas.org/humanproteome/tissue/druggable). 소분자 약물은 비공유 및 공유 메커니즘을 통해 표적 단백질과 상호작용할 수 있습니다. 소분자 약물과 표적 단백질 사이의 상호 작용의 대부분은 비공유 방식으로 발생하며, 수소 결합, π-π 스태킹 및 소수성 상호 작용과 같은 메커니즘을 통해 결합 포켓의 아미노산 잔기와 역동적이고 가역적인 상호 작용을 형성합니다. 따라서 복잡한 프로테옴에서 비공유 소분자 약물에 의해 결합된 단백질의 농축 및 분리를 안정화하는 것은 매우 어려운 작업입니다.
이러한 과제를 해결하기 위해 Chomix는 포토프로브를 기반으로 하는 화학적 단백질체학 표적 식별 기술 플랫폼을 개발했습니다. 이 플랫폼은 살아있는 세포에서 소분자와 단백질 사이의 동적 결합을 정확하게 포착하고 분리 및 농축을 달성하여 단백질체 수준에서 비공유 소분자 약물에 대한 직접 표적을 포괄적으로 식별합니다.
기술 플랫폼
포토프로브를 기반으로 하는 화학적 단백질체학 표적 식별 플랫폼에는 프로브 설계, 합성, 활성 평가, 라벨링, 단백질 농축 및 데이터 분석과 같은 주요 단계가 포함됩니다. 합성물, 약초 화합물, 천연물, 대사물을 포함한 비공유 소분자 약물은 광반응성 프로브로 변형될 수 있습니다. 이러한 프로브는 세포 내의 표적에 결합하면 안정적인 공유 상호 작용을 형성하여 소량의 표적 단백질을 선택적으로 농축하고 식별할 수 있습니다. 다양한 실험 설정과 결합된 이 접근 방식은 표적 단백질의 포괄적인 정량화를 제공하고, 메커니즘을 밝히고, 새로운 표적을 발견하고, 더 풍부한 통찰력으로 약물 개발을 향상시킵니다.
우리의 장점
1. 기술적 우수성: 경험이 풍부한 팀, 최고 수준의 저널 간행물 및 권위 있는 업계 서비스.
2. 핵심 특허 기술: 초기 신약 개발 지원을 위한 독점 특허 및 고급 하드웨어.
3. 원스톱 서비스: 프로브 설계, 합성, 표적 발견, 생물정보학 분석 및 고객 만족을 위한 시기적절한 진행 피드백을 포괄합니다.
4. 엄격한 품질 관리: ISO9001 인증은 신뢰할 수 있고 확실한 보고서를 보장합니다.
우리의 서비스
| 프로젝트 | 비공유결합 소분자 약물의 직접 표적 식별 |
| 견본 | 순수 단백질, 세포 용해물, 살아있는 세포, 질병 조직, 혈액, 박테리아, 식물 조직 |
| 하드웨어 플랫폼 | 비접촉 초음파 세포 분쇄기, ChemiDoc MP 이미징 시스템, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 질량 분석기 |
| 프로젝트 기간 | 4~8주 |
| 결과물 | 프로젝트 보고서(실험 절차, 데이터 분석 차트, 생물정보학 분석 결과 포함) |
| 가격 | 상담을 원하시면 클릭하세요 |
사례 연구
세포 생존율 스크리닝 기술을 활용한 약물 스크리닝 과정에서 화합물 A가 표적 세포에 대해 유의미한 억제 효과를 나타내는 것으로 확인되었습니다. 분자 수준에서 표적 단백질을 추가로 식별하고, 작용 메커니즘을 해독하고, 잠재적인 새로운 표적을 탐색하기 위해 당사는 화합물 A의 구조 및 활성 특성을 기반으로 광반응성 프로브 Probe A(광반응성 및 생체직교성 그룹 포함)를 설계하고 합성했습니다. 화학적 단백질체학 기술 플랫폼을 활용하여 우리는 활동과 관련된 세포주에서 표적 단백질 식별을 위해 형광 라벨링 및 질량 분석 기술을 사용했습니다. 생물정보학 분석 방법과 결합하여 화합물 A 및 이와 관련된 새로운 표적 단백질의 작용 메커니즘을 더 깊이 조사했습니다.
라벨링 실험의 형광 젤 분석을 기반으로 프로브 A는 단백질을 효과적으로 라벨링하고 라벨링 신호는 화합물 A와 크게 경쟁할 수 있습니다. 이는 프로브 A가 화합물 A와 유사한 표적 적용 범위를 갖고 있어 다음에 적합한 화학 프로브 도구가 된다는 것을 나타냅니다. 후속 타겟 발견.
Volcano 플롯은 Probe A 대 DMSO(직접) 실험의 결과를 보여줍니다. 여기서 114개의 단백질(상단 플롯에서 빨간색으로 강조 표시됨)이 Probe A에 의해 크게 강화되었습니다. Probe A 대 (A+Probe A)(경쟁) 실험에서 38개의 단백질(하단 플롯에서 빨간색으로 강조 표시됨)이 프로브 A에 의해 표지되었으며 원래 화합물 A와 상당히 경쟁했습니다. 이 두 실험에서는 화합물 A에 대한 높은 신뢰도 결합을 갖는 32개의 단백질이 생성되었습니다(n = 3, 비율 ≥ 2, p -값 ≤ 0.05). 화합물 A에 대한 결합 신뢰도가 높은 32개 단백질에 대한 GO 생물학적 경로 분석에서는 인지질 유출, 리파제 활성의 음성 조절, 스테롤 수송 조절과 같은 신호 전달 경로가 표현형에 맞춰 상당히 강화된 것으로 나타났습니다.
