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세포 내 단백질-단백질 상호작용 네트워크의 확인
단백질-단백질 상호작용(PPI)은 여러 시간적, 공간적 차원에 걸쳐 세포 주기 조절, 단백질 합성 및 분비, 신호 전달 및 대사와 같은 중요한 세포 과정에 깊은 영향을 미치는 세포 생명 활동의 필수 핵심 구성 요소입니다. 따라서 단백질 상호작용에 대한 심층적인 조사는 분자 조절 네트워크의 신비를 밝히는 데 중추적인 역할을 합니다.
현재 단백질 상호작용을 연구하기 위해 일반적으로 사용되는 기술에는 공동 면역침강, 풀다운 분석, 단백질 마이크로어레이 등이 포함됩니다. 그러나 이러한 방법은 항체에 대한 과도한 의존성, 일시적이거나 약한 상호작용을 효과적으로 포착하는 데 어려움이 있는 등 실제 응용 분야에서 수많은 과제에 직면해 있습니다. 이러한 과제를 해결하기 위해 근접 라벨링 기술이 등장했습니다. 효소는 가까운 거리에서 표적 단백질을 바이오티닐화한 다음 PPI의 친화도 정제 및 질량분석법 특성화를 수행합니다. 이 중 PPI 식별을 위해 APEX(Ascorbate Peroxydase)와 Biotin ligase를 기반으로 한 근접 라벨링 방법이 가장 널리 사용됩니다. 근접 의존형 비오틴 식별(BioID)을 기반으로 개발된 새로운 기술 플랫폼인 TurboID는 돌연변이된 형태의 대장균 비오틴 리가제를 사용합니다. CoLinkBio의 질량분석 기반 근접 라벨링 기술 플랫폼은 BioID, APEX, TurboID 등 다양한 기술을 포괄합니다. 이러한 기술은 살아있는 세포 시스템, 특히 일시적 또는 동적 단백질 상호 작용 이벤트뿐만 아니라 소량의 단백질 또는 소수성 막 단백질과 관련된 상호 작용을 포착하는 데 탁월한 적용 가능성을 보여줍니다.
기술 플랫폼
TurboID 기술 플랫폼을 예로 들면, 이 플랫폼은 돌연변이된 비오틴 리가제를 표적 단백질의 C-말단에 융합시킵니다. 과발현 세포에 비오틴 자극을 첨가하면 10분 이내에 표적 단백질의 상호작용 단백질의 신속한 비오티닐화를 가능하게 합니다. 이 라벨링 프로세스는 빠르고 낮은 배경을 가질 뿐만 아니라 실온에서도 원활하게 수행될 수 있습니다. 결과적으로 TurboID 기술 플랫폼은 포유류 세포 시스템뿐만 아니라 식물, 곤충과 같은 다양한 생물학적 시스템에도 적합하여 적용 가능성을 크게 확장합니다. 그 후, 비오틴으로 표지된 단백질을 분리하고 강화한 후 효소 분해를 통해 질량 분석 분석을 위한 펩타이드 샘플을 쉽게 얻을 수 있으므로 단백질 상호 작용과 그 기능에 대한 심층적인 조사가 가능합니다.
우리의 장점
1. 전문성: 우리 팀은 업계 최고의 기술 서비스를 제공하며 최고의 저널에 대한 광범위한 경험과 출판물을 자랑합니다.
2. 효율적인 솔루션: 우리는 신뢰할 수 있는 방법을 사용하여 프로젝트를 신속하게 진행하고 걱정 없는 솔루션을 제공합니다.
3. 엄격한 품질 관리: ISO 9001 표준을 준수하는 당사의 성숙한 품질 관리 시스템은 보고서의 신뢰성과 신뢰성을 보장합니다.
4. 체계적인 프로젝트 관리: 상담부터 보고서 전달까지 적시에 진행 상황을 업데이트하여 고객 만족과 효율적인 프로젝트 수행을 보장합니다.
5. 최첨단 장비: Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 및 Bruker timsTOF와 같은 고급 질량 분석기를 갖추고 있어 획기적인 연구를 촉진합니다.
우리의 서비스
| 프로젝트 | 세포 내 단백질-단백질 상호작용 네트워크의 확인 |
| 견본 | 세포 용해물, 살아있는 세포 |
| 하드웨어 플랫폼 | 비접촉 초음파 세포 분쇄기, ChemiDoc MP 이미징 시스템, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 질량 분석기 |
| 프로젝트 기간 | 4~6주 |
| 결과물 | 프로젝트 보고서(실험 절차, 데이터 분석 차트, 생물정보학 분석 결과 포함) |
| 가격 | 상담을 원하시면 클릭하세요 |
사례 연구
프로젝트 목표:약물 치료 전후의 세포 내 표적 단백질(POI)의 단백질 상호작용 변화를 분석합니다.
해결책:POI-TurboID 발현 벡터를 구성하고, 이를 세포에서 과발현하고, 바이오티닐화를 위한 약물 처리 및 제어 그룹을 설정하여 근접 라벨링 전략을 활용합니다. POI 상호작용의 변화를 특성화하기 위해 생체틴화된 단백질의 차이에 대한 정성적 및 정량적 분석이 뒤따르는 세포의 단백질 상호작용체를 풍부하게 합니다.
데이터 시각화:
