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화학 프로브를 기반으로 한 단백질 번역 후 변형(PTM) 분석
전통적인 항체 농축 전략 외에도 단백질의 번역 후 변형(PTM)을 농축하고 식별하는 데 화학적, 효소적, 대사적 라벨링 기술이 점진적으로 적용되었습니다. 기본 원리는 화학 반응 또는 효소 촉매 작용을 사용하여 특정 분자 프로브를 표적 변형 또는 변형 잔류물에 공유 결합으로 부착한 후 단백질체학 분석을 수행하는 것입니다. 화학단백체학에서 이러한 새로운 접근 방식은 팔미토일화, 미리스토일화 및 글리코실화와 같은 소량의 단백질 변형 연구에서 중요해지고 있습니다. 특히, 살아있는 세포에 적용할 수 있어 세포 스트레스로 인한 산화와 같은 잠재적인 간섭을 피할 수 있다는 장점이 있습니다.
기술 서비스
1. 시스테인 번역 후 변형
시스테인(Cys)은 단백질의 일반적인 황 함유 아미노산이며, 티올 그룹은 분자 산화환원 항상성을 조절하고, 다양한 번역 후 변형 과정을 통해 효소 반응, 단백질-단백질 상호 작용 및 단백질 안정성에 영향을 미치는 데 중요한 역할을 합니다. 시스테인에 대한 일반적인 번역 후 변형에는 팔미토일화, 니트로실화, 술페닐화 및 술폰화가 포함됩니다. Colosseum Biosciences는 시스테인 잔기를 표적으로 하는 보편적인 프로브 또는 대사 라벨링 전략을 개발했으며 번역 후 변형 식별을 위한 해당 화학 단백질체학 플랫폼을 확립했습니다. 이 플랫폼은 표적 단백질과 번역 후 변형의 변형 부위를 정확하게 식별합니다.
2. 라이신 번역 후 변형
라이신(Lys)은 프로테옴에서 가장 다양한 번역 후 변형(PTM)을 갖는 아미노산 중 하나입니다. 가역적 라이신 번역 후 변형(Lys-PTM)은 수많은 중요한 세포 기능을 조절하는 데 없어서는 안 될 역할을 하는 일반적인 생화학적 과정입니다. 라이신에 대한 번역 후 변형에는 아세틸화, 석시닐화, 프로피오닐화, 부티릴화, 크로토닐화, 말로닐화 및 락틸화가 포함됩니다. Colosseum Biosciences는 표적 단백질과 변형 부위를 정확하게 식별하는 라이신 번역 후 변형을 위한 화학적 프로브를 기반으로 하는 화학적 단백질체학 기술 플랫폼을 개발했습니다.
3. 세린/트레오닌 번역 후 변형
세린(Ser)과 트레오닌(Thr)에 대한 일반적인 번역 후 변형에는 주로 인산화, O-글리코실화 등이 포함됩니다. 이러한 변형은 단백질의 활성 상태 및 다른 분자와의 상호 작용에 큰 영향을 미치며 다양한 주요 생물학적 과정에서 중요한 역할을 합니다. 따라서 이러한 유형의 번역 후 변형에 대한 분석은 단백질 기능 연구에서 중요한 주제입니다. Colosseum Biosciences는 인산화 농축 물질, 비천연 글리칸 화학 프로브 및 기타 도구를 활용하여 이러한 유형의 번역 후 변형에 대한 표적 단백질과 변형 부위를 정확하게 식별합니다.
우리의 장점
01. 고도의 전문성:우리 회사의 수석 과학자인 북경 대학교 왕 추 교수의 연구 그룹이 주도합니다.
02. 원스톱 플랫폼:프로브 설계, 프로브 합성, 표적 발견부터 생물정보학 분석까지 전체 워크플로우를 포괄합니다.
03. 항체가 필요하지 않습니다.특정 화학 프로브 수정,생리적
04. 환경:용해물과 살아있는 세포 모두에 적용 가능합니다.
05. 광범위한 경험:10여종 이상의 PTM에 대한 전문성 축적
06. 고성능 플랫폼:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480,Thermo Fisher Q Exactive HF-X,브루커 팀스TOF
사례 연구
이타코네이션은 번역 후 변형 중에 이타코네이트가 단백질의 특정 부위에 공유 결합하는 과정을 의미합니다. 이러한 변형은 단백질의 구조와 기능을 변경하여 세포 내 역할에 영향을 줄 수 있습니다. 예를 들어 이타코네이션은 효소 활성, 안정성 또는 다른 분자와의 상호 작용을 조절할 수 있습니다. 이타코네이트는 트리카르복실산 회로의 중간체이기 때문에 이러한 변형은 세포의 대사 상태와 밀접하게 연관되어 있습니다. 연구에 따르면 이타코네이션은 특정 질병의 병리학에서 중요한 역할을 하며 이러한 변형 메커니즘을 이해하면 새로운 치료 전략을 개발하는 데 도움이 될 수 있습니다.
살아있는 세포 수준에서 ITalk 프로브로 대사적으로 표지된 세포를 용해시킨 후, 클릭 반응, 농축, 효소 소화 및 기타 단계를 거쳐 이타콘 산성화의 특정 부위를 결정했습니다.
