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소분자-단백질 상호작용
단백질은 생명 활동의 직접적인 참가자이자 실행자로서 질병 치료의 중요한 표적입니다. 소분자 약물(일반적으로 분자량이 1000 Da 미만인 유기 화합물)은 단백질 활성, 존재비 및 상호 작용을 미세하게 조절하여 효과적인 치료 효과를 발휘합니다. 일반적인 소분자 약물에는 천연물과 그 파생물(예: 허브 단량체)뿐만 아니라 화학적으로 합성된 약물도 포함됩니다. 이들 약물은 인체에 유입되면 세포 내 또는 외부의 표적 단백질과 결합해 치료 효과를 발휘한다. 따라서 저분자 약물이 표적 단백질에 어떻게 결합하는지 이해하는 것은 약물 개발, 특히 살아있는 세포, 혈액 및 질병 조직과 같은 복잡한 생리적 환경에서 특히 중요합니다. 저분자 약물과 단백질 사이의 상호 작용에 대한 심층 분석을 통해 약물 표적을 정확하게 식별할 수 있을 뿐만 아니라 약물 작용의 분자 메커니즘과 잠재적인 표적 외 효과를 밝힐 수 있습니다. 또한, 새로운 치료 표적을 발견하여 질병 치료를 위한 보다 풍부한 전략을 제공할 가능성이 있습니다.
소분자 약물 외에도 ATP, 콜레스테롤, 담즙산, 아라키돈산, 레티노산과 같은 유기체 내 내인성 소분자 대사산물은 수송 단백질, 막, 세포막 등의 단백질과 상호작용하여 많은 중요한 신호 전달 경로와 단백질 활동을 조절하는 데 참여합니다. 수용체, 전사 인자 및 대사 효소. 최근 몇 년 동안 장내 미생물총 대사산물과 숙주 세포 사이의 상호 작용이 연구 핫스팟으로 떠올랐습니다. 따라서 세포 환경, 특히 질병 상태에서 대사물질과 단백질 사이의 상호작용 네트워크에 대한 철저한 조사와 매핑은 생명 과정을 이해하고 질병을 치료하는 데 매우 중요합니다.
화학 생물학의 중요한 분야인 화학 단백질체학은 이제 단백질 기능 연구, 소분자 약물 표적 식별 및 신약 구조 스크리닝에 널리 사용되어 왔습니다. 이 기술 플랫폼은 생리학적 조건(예: 살아있는 세포, 혈액, 조직 등)에서 작은 분자와 단백질 간의 상호 작용 메커니즘을 밝히는 것을 목표로 단백질체학과 결합된 다양한 기능적으로 다양한 화학 프로브를 활용합니다. 정제된 단백질 시스템과 비교하여 살아있는 세포 시스템을 사용하는 것이 화학적 단백질체학의 주요 특징이라는 점은 언급할 가치가 있습니다. 이를 통해 복잡한 프로테옴 내에서 소분자 약물, 내인성 대사산물 등의 표적 분포를 아미노산 잔기 부위 수준까지 현실적으로 묘사할 수 있습니다.
Chomix는 소분자-단백질 상호작용에 대한 전문적인 분석 서비스를 제공하여 잠재적인 약물 표적을 더 깊이 조사하고 약물 분자 메커니즘과 잠재적인 부작용에 대한 이해를 높일 수 있도록 지원합니다. 우리 전문가 팀은 화학 단백질체학 연구에 대한 광범위한 경험을 보유하고 있으며 귀하에게 가장 적합하고 신뢰할 수 있는 방법을 선택하여 기술적 문제에 대한 우려를 없애고 귀하의 연구 발전을 쉽게 촉진할 것입니다.
기술 서비스
1. 비공유결합 저분자 약물의 직접 표적 확인
대부분의 소분자 약물은 비공유결합을 통해 표적 단백질과 상호작용하여 수소결합, π-π 스태킹, 소수성 상호작용 등을 통해 결합 포켓의 아미노산 잔기와 역동적이고 가역적인 상호작용을 형성합니다. 따라서 결합된 단백질의 안정적인 농축 및 분리가 가능합니다. 복잡한 프로테옴의 비공유 소분자 약물은 심각한 문제를 야기합니다. 이를 해결하기 위해 Chomix는 포토프로브 기반의 화학적 단백질체학 표적 식별 플랫폼을 개발했습니다. 이 플랫폼은 살아있는 세포에서 소분자와 단백질 사이의 동적 결합을 정확하게 포착하고 분리 및 농축을 달성함으로써 단백질체 수준에서 비공유 소분자 약물에 대한 직접 표적을 포괄적으로 식별합니다.
2. 비공유결합 소분자 약물의 결합 포켓 확인
저분자 신약 개발 과정에서는 먼저 약물과 단백질 사이의 결합 정보를 파악한 후, 단백질 표면의 어느 특정 포켓에 약물이 결합하는지, 어떻게 결합하는지를 특정하는 것이 중요합니다. 이 정보는 후속 약물 구조 최적화에 필수적입니다. Chomix는 고전적인 구조 생물학 접근 방식 외에도 고해상도 질량 분석법을 기반으로 하는 고급 화학 단백질체학 기술 플랫폼을 개발했습니다. 이 플랫폼은 단백질 및 세포 수준에서 비공유 소분자 약물에 대한 결합 펩타이드를 식별할 수 있으므로 초기 약물 개발에서 이러한 중요한 문제를 해결하는 데 도움이 됩니다.
3. 공유결합성 저분자 약물 표적의 점유율 및 선택성에 대한 정량 분석
공유결합 약물은 시스테인, 라이신, 세린 등과 결합하는 표적 단백질의 결합 포켓에서 아미노산 잔기와 안정적인 공유 결합을 형성하는 약물을 의미합니다. 일반적인 공유 결합 약물로는 아스피린, 오시머티닙, 제불라린 및 천연물 등이 있습니다. 아르테미시닌과 아르테수네이트. 살아있는 세포에서 공유결합 약물은 표적 단백질의 특정 아미노산 잔기에 안정적으로 결합하여 점유할 수 있습니다. 이러한 특성을 활용하여 Chomix는 범용 프로브 기반의 화학 단백질체학 플랫폼을 성공적으로 개발했습니다. 이 플랫폼을 사용하면 공유결합 소분자 약물의 표적 부위 점유율을 아미노산 잔기 수준까지 정량 분석할 수 있습니다. 또한 10,000개 이상의 아미노산 잔기 위치에 대한 점유 정보를 분석하여 다양한 약물 농도에서 표적 선택성을 결정할 수 있어 초기 약물 개발에 대한 강력한 지침을 제공합니다.
4. 단백질 분해 표적의 식별 및 선택성 분석
새로운 유형의 약물인 PROTAC(단백질 분해 표적화 키메라)는 기존의 소분자 억제제 또는 활성화제와 다릅니다. 그들은 내인성 유비퀴틴-프로테아좀 시스템(UPS)을 활용하여 질병을 유발하는 단백질, 특히 "약물이 없는" 표적으로 간주되는 단백질을 특이적으로 분해함으로써 의약 화학의 기존 "점유 중심" 개발 개념을 전복합니다. 따라서 단백질 분해제 약물 표적의 정량적 식별과 전체 프로테옴 수준에서의 선택성은 이러한 약물의 조기 개발에 중요합니다. Chomix는 개별 세포주에서 5,000개 이상의 단백질을 정성 및 정량 분석할 수 있는 다양한 정량 화학 단백질체학 기술 플랫폼을 성공적으로 개발하여 표적 선택성에 대한 포괄적이고 심층적인 분석을 제공합니다.
