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비공유 소분자 약물에 대한 단백질 표적의 화학단백체 프로파일링
수소 결합 및 π-π 스태킹과 같은 비공유 상호 작용은 단백질 변성으로 인해 중단될 수 있습니다. 이러한 문제를 해결하기 위해 ChomiX 플랫폼은 단백질의 활성 부위에 "화학 라벨"을 정확하게 부착하기 위한 잘 확립된 기술인 광친화성 라벨링을 사용합니다. 또한 ChomiX의 혁신적인 in situ 화학적 가교 전략은 일시적인 비공유 단백질 상호작용을 공유 및 영구 화학 결합으로 변환합니다. 광친화성과 생체직교 부분으로 기능화된 화학 프로브를 활용함으로써 ChomiX의 화학단백체학 플랫폼은 세포 용해물, 조직 및 살아있는 세포 내에서 단백질 표적을 성공적으로 찾아내는 효과를 입증했습니다. 플랫폼에 적용되는 생리활성 소분자 약물의 스펙트럼에는 내인성 대사산물, 천연물, 비공유 합성 분자를 포함한 다양한 화합물이 포함됩니다.
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공유결합 소분자 약물에 대한 단백질 표적의 경쟁적 화학단백체 프로파일링
비공유 약물과 유사하게 리포터 그룹으로 기능화된 화학 프로브를 사용하는 직접 풀다운 전략도 공유 결합 소분자 약물에 대해 성공적으로 입증되었습니다. 그러나 일부 공유결합 약물은 생체 활성 손실이나 합성 불가능성으로 인해 화학적 변형을 견딜 수 없다는 점은 주목할 가치가 있습니다. 또한, 형성된 공유 결합은 일반적으로 MS 검출 중에 불안정합니다.
경쟁적 화학단백체 전략은 단백질 라벨링을 위해 보편적인 활동 기반 프로브를 사용하는 이상적인 대안입니다. 시스테인, 리신, 세린, 히스티딘 잔기와 반응하는 특정 화학 탐침이 개발되었습니다. 원칙적으로, 공유결합 소분자가 일단 점유되면, 아미노산 잔기는 프로브에 의해 표지될 수 없습니다. 결과적으로, 아미노산 분해능을 이용한 경쟁 전략을 통해 ON 및 OFF 타겟을 종합적으로 식별할 수 있었습니다.
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약물 투여가 불가능한 표적을 위한 새로운 납 구조의 화학단백체 발견
약물이 불가능한 표적을 위한 새로운 납 구조의 화학단백체 발견 기술적 배경 현재 FDA 승인 약물의 표적은 ~800개 단백질뿐이며 다수의 질병 관련 표적은 "약물이 없는" 단백질입니다. 왜냐하면 현재 대부분의 기술은 정제된 단백질에 의존하기 때문입니다. 화학단백체학의 출현은 정제된 단백질에서 살아있는 세포에 이르기까지 약물 발견에 혁명을 일으켰습니다. 작은 분자와 분자 사이의 상호작용을 정량적으로 분석할 수 있습니다.
