Producten
Identificatie van de bindingsplaats voor niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen in levende cellen
Op cellulair niveau kan het rechtstreeks bestuderen van het werkingsmechanisme tussen geneesmiddelen en doeleiwitten helpen veranderingen in de eiwitstructuur tijdens zuivering en vals-positieve resultaten die kunnen voortkomen uit kunstmatige buffersystemen en hoge geneesmiddel-eiwitconcentraties te voorkomen.
Technisch platform
ChomiX levert diensten op het gebied van chemische proteomics waarbij gebruik wordt gemaakt van biologisch actieve fotoreactieve chemische sondes (met een activiteit die vergelijkbaar is met medicijnmoleculen). Deze probes worden geïncubeerd met ziekterelevante cellen of weefsels in fysiologisch relevante concentraties van medicijnen, gevolgd door in situ snelle foto-crosslinkingtechnologie om niet-covalente interacties tussen probes van medicijnmoleculen en eiwitdoelen om te zetten in covalente interacties. Vervolgens kan door middel van stappen zoals verrijking van doeleiwitten, enzymatische vertering om ongemodificeerde peptidesegmenten vrij te geven, en selectieve verrijking van door geneesmiddelmoleculen probe-gemodificeerde peptidesegmenten, gecombineerd met massaspectrometrie met hoge resolutie van biomoleculen, snel peptidesequentie-informatie worden bepaald. Ten slotte worden moleculaire koppelingsinstrumenten gebruikt om snel bindingsmodellen van geneesmiddelen met doeleiwitten te verkrijgen, wat robuuste ondersteuning biedt voor daaropvolgend medisch-chemisch onderzoek.
Onze voordelen
1. Technische uitmuntendheid: ervaren team, publicaties in tijdschriften van topniveau en gezaghebbende industriële diensten.
2. Kernoctrooitechnologie: exclusieve patenten en geavanceerde hardware voor ondersteuning in de vroege ontwikkeling van geneesmiddelen.
3. One-stop-service: omvat sondeontwerp, synthese, doeldetectie, bio-informatica-analyse en tijdige voortgangsfeedback voor klanttevredenheid.
4. Rigoureus kwaliteitsmanagement: ISO9001-certificering zorgt voor betrouwbare en authentieke rapporten.
Onze service
| Project | Identificatie van bindingszakken voor niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen |
| Steekproef | Zuiver eiwit, cellysaat, levende cellen, ziek weefsel, bloed, bacteriën, plantenweefsel |
| Hardwareplatform | Contactloze ultrasone celvergruizer, ChemiDoc MP Imaging System, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 massaspectrometer |
| Projectduur | 2-4 weken |
| Leveringen | Projectrapport (inclusief experimentele procedures, data-analysegrafieken, bio-informatica-analyseresultaten) |
| Prijs | Klik om te raadplegen |
Casestudy
Het doelwit van kandidaat-medicijnmolecuul B is een multi-transmembraaneiwit met meerdere medicijnbindingsholtes. Ondanks meerdere pogingen met behulp van structurele biologische methoden zoals röntgenstraling en cryo-EM, kon er geen bindingsmodel tussen het medicijnmolecuul en het doeleiwit worden verkregen.
Gebaseerd op de structuur en activiteit van kandidaat-geneesmiddelmolecuul B, ontwierp en synthetiseerde ons bedrijf een fotoreactieve chemische sonde, Probe B, bestaande uit fotoreactieve en bioorthogonale groepen. Door gebruik te maken van het hierboven genoemde chemische proteomics platform voor het ontdekken van doelwitten, werden doeleiwitten eerst gevalideerd in cellijnen die relevant zijn voor de activiteit van kandidaat-geneesmiddelmolecuul B. Vervolgens, door gebruik te maken van op massaspectrometrie gebaseerde, niet-covalente geneesmiddelbindende pocket-identificatietechnologie, konden de ruimtelijk aangrenzende peptidesegmenten worden de medicijnbindingsholten werden bepaald en er werd een medicijn-eiwitbindingsmodel verschaft.
Immunoblotting-testen onthulden dat kandidaat-geneesmiddelmolecuul B effectief concurreert met probe-labelingsignalen in cellen, wat wijst op directe binding tussen het kandidaat-geneesmiddelmolecuul en het doeleiwit.
Omdat chemische probes alleen kunnen verknopen met peptidesegmenten die zich dicht in de ruimte bevinden, werd de sequentie CLPFIIGCNPTILHVHELYIR geïdentificeerd door middel van tandem massaspectrometrie met hoge resolutie om de verknoopte peptidesegmenten te bepalen.
