Producten
Identificatie van niet-covalente geneesmiddeldoelen voor kleine moleculen op basis van fotoaffiniteitssondes
Technisch platform
Het chemische proteomics-doelidentificatieplatform op basis van fotoaffiniteitssondes omvat verschillende belangrijke stappen, waaronder sondeontwerp, synthese, activiteitsbeoordeling, labeling, eiwitverrijking en gegevensanalyse. Niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen, zoals synthetische verbindingen, kruidenextracten, natuurlijke producten en metabolieten, kunnen worden gemodificeerd tot fotoaffiniteitssondes. Zodra deze probes zich aan hun doelwitten in cellen binden, vormen ze stabiele covalente interacties, waardoor de selectieve verrijking en identificatie van doelwiteiwitten met een lage overvloed mogelijk wordt.
Onze voordelen
1. Technische uitmuntendheid: ervaren team, publicaties in tijdschriften van topniveau en gezaghebbende industriële diensten.
2. Kernoctrooitechnologie: exclusieve patenten en geavanceerde hardware voor ondersteuning in de vroege ontwikkeling van geneesmiddelen.
3. One-stop-service: omvat sondeontwerp, synthese, doeldetectie, bio-informatica-analyse en tijdige voortgangsfeedback voor klanttevredenheid.
4. Rigoureus kwaliteitsmanagement: ISO9001-certificering zorgt voor betrouwbare en authentieke rapporten.
Onze service
| Project | Identificatie van directe doelwitten voor niet-covalente kleine molecuulgeneesmiddelen |
| Steekproef | Recombinant eiwit, cellysaat, levende cellen, ziek weefsel, bloed, bacteriën, plantenweefsel |
| Hardwareplatform | Contactloze ultrasone celvergruizer, ChemiDoc MP Imaging System, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 massaspectrometer |
| Projectduur | 4-8 weken |
| Leveringen | Projectrapport (inclusief experimentele procedures, data-analysegrafieken, bio-informatica-analyseresultaten) |
Casestudy
Tijdens het screeningsproces voor geneesmiddelen, waarbij gebruik werd gemaakt van technologie voor het screenen van de levensvatbaarheid van cellen, bleek verbinding A significante remmende effecten op doelcellen te vertonen. Om de doeleiwitten op moleculair niveau verder te identificeren, het werkingsmechanisme ervan te ontcijferen en potentiële nieuwe doelwitten te onderzoeken, heeft ons bedrijf de fotoreactieve probe Probe A (met fotoreactieve en bioorthogonale groepen) ontworpen en gesynthetiseerd op basis van de structuur- en activiteitskenmerken van verbinding A. Door gebruik te maken van het chemische proteomics-technologieplatform, hebben we fluorescentielabeling en massaspectrometrietechnieken gebruikt voor de identificatie van doeleiwitten in cellijnen die relevant zijn voor de activiteit. Gecombineerd met bio-informatica-analysemethoden zijn we dieper ingegaan op het werkingsmechanisme van verbinding A en de bijbehorende nieuwe doeleiwitten.
Gebaseerd op fluorescentiegelanalyse van het labelingsexperiment, labelt Probe A effectief eiwitten, en kan het labelingssignaal aanzienlijk worden geconcurreerd door verbinding A. Dit geeft aan dat Probe A een vergelijkbare doeldekking heeft als verbinding A, waardoor het een geschikt chemisch probe-instrument is voor daaropvolgende doelontdekking.
De Volcano-grafiek illustreert de resultaten van het Probe A versus DMSO (Direct)-experiment, waarbij 114 eiwitten (rood gemarkeerd in de bovenste grafiek) aanzienlijk werden verrijkt door Probe A. In de Probe A versus (A+Probe A) (competitie) experiment werden 38 eiwitten (rood gemarkeerd in de onderste grafiek) gelabeld door Probe A en concurreerden ze significant met de oorspronkelijke verbinding A. Deze twee experimenten genereerden 32 eiwitten met een hoge betrouwbaarheid binding aan verbinding A (n = 3, verhouding ≥ 2, p-waarde ≤ 0,05). GO Biological Pathway-analyse van de 32 eiwitten met een hoge betrouwbaarheidsbinding aan verbinding A onthulde een significante verrijking in signaalroutes zoals fosfolipide-efflux, negatieve regulatie van lipase-activiteit en regulatie van steroltransport, in lijn met het fenotype.
