Identificatie van interactiegebieden voor eiwit-eiwit- en antilichaam-antigeen-interacties

Een diepgaand begrip van de eiwitstructuur en de interacties ervan is cruciaal voor het onthullen van hun biologische functies. Vanwege de complexiteit en diversiteit op het gebied van eiwitten heeft één enkele onderzoekstechniek echter vaak moeite om de mysteries ervan volledig op te helderen. Daarom hanteren biologen doorgaans een strategie waarbij meerdere technische benaderingen worden geïntegreerd om gezamenlijk de driedimensionale structuur en het dynamische interactiegedrag van eiwitten te onderzoeken. Hiervan heeft de technologie van cross-linking massaspectrometrie (XL-MS) een uitstekende onderzoekswaarde op dit gebied aangetoond vanwege de unieke voordelen ervan. Het kan nauwkeurig informatie verschaffen over de ruimtelijke afstand tussen aminozuurresiduen en heeft vele voordelen, zoals het vereisen van kleine monsterhoeveelheden, lage milieueisen voor eiwitten, geen beperkingen in het molecuulgewicht, het gemak van in situ verknoping, eenvoud van bediening en het verkrijgen van een grote hoeveelheid informatie.

Na meer dan twintig jaar van voortdurende ontwikkeling en technologische innovatie heeft de XL-MS-technologie aanzienlijke vooruitgang geboekt op het gebied van experimenteel ontwerp, data-analyse en andere aspecten, en is nu een onmisbaar kerninstrument geworden in de geïntegreerde structurele biologie. De XL-MS-technologie die door Coalesce Bio wordt gebruikt, maakt gebruik van verschillende combinaties van chemische verknopingsmiddelen. Deze middelen reageren met verschillende aminozuurresiduen zoals carboxyl-, amino- en sulfhydrylgroepen, waardoor nauwkeurige verknoping van eiwit-eiwit- en antilichaam-antigeen-interacties mogelijk wordt, waardoor interactiegebieden nauwkeurig worden opgelost.

Technisch platform

Gebruikelijke chemische verknopers (zoals weergegeven in de onderstaande figuur) kunnen specifieke aminozuurresiduen covalent verknopen wanneer ze aan eiwitsystemen worden toegevoegd. Na enzymatische vertering worden verknoopte peptiden gegenereerd, die de interactiegebieden tussen eiwitten vertegenwoordigen. Door massaspectrometrie-identificatie en nauwkeurige analyse van de peptidesequenties kan informatie over de interactiegebieden worden verkregen.

Amino-thiol-crosslinker BS3

Amino-sulfhydrylvernettingsmiddel EMCS

Onze voordelen

1. Professionele uitmuntendheid: ons team beschikt over uitgebreide ervaring en publicaties in toptijdschriften en biedt toonaangevende technische diensten.
2. Efficiënte oplossingen: we gebruiken betrouwbare methoden om projecten snel vooruit te helpen en zorgeloze oplossingen te bieden.
3. Rigoureus kwaliteitsmanagement: ons volwassen kwaliteitsmanagementsysteem voldoet aan de ISO 9001-normen en garandeert de authenticiteit en betrouwbaarheid van onze rapporten.
4. Systematisch projectbeheer: van advies tot het opleveren van rapporten, wij zorgen voor tijdige voortgangsupdates, waardoor klanttevredenheid en efficiënte projectuitvoering worden gegarandeerd.
5. Geavanceerde apparatuur: Uitgerust met geavanceerde massaspectrometers zoals de Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 en Bruker timsTOF faciliteren we baanbrekend onderzoek.

Onze service

Project	Identificatie van interactiegebieden voor eiwit-eiwit- en antilichaam-antigeen-interacties
Steekproef	Zuiver eiwit, antilichaam-antigeencomplex
Hardwareplatform	Contactloze ultrasone celvergruizer, ChemiDoc MP Imaging System, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 massaspectrometer
Projectduur	2-4 weken
Leveringen	Projectrapport (inclusief experimentele procedures, data-analysegrafieken, bio-informatica-analyseresultaten)
Prijs	Klik om te raadplegen

Casestudy

In dit geval werd het BSA-serumeiwit verknoopt met behulp van de amine-reactieve verknoper BS3 om een dimere structuur van BSA-serumeiwit te construeren. Massaspectrometrie-analyse van de dimere structuur identificeerde verknoopte peptidesegmenten die overeenkwamen met bestaande literatuurgegevens, waardoor de nauwkeurigheid en betrouwbaarheid van het experiment werd gevalideerd.