Producten
Identificatie van eiwit-eiwit-, antilichaam-antigeen-interactiegebieden: chemische verknoping
Het begrijpen van de eiwitstructuur en interacties is essentieel voor het blootleggen van hun biologische functies. Vanwege de complexiteit van het proteoom kan geen enkele techniek deze aspecten volledig onthullen. Biologen gebruiken vaak een combinatie van methoden, waarbij cross-linking massaspectrometrie (XL-MS) opvalt vanwege zijn unieke voordelen.
XL-MS biedt nauwkeurige informatie over de ruimtelijke afstand tussen aminozuurresiduen en biedt talloze voordelen: minimale monsterbehoefte, lage omgevingseisen, geen beperkingen op het molecuulgewicht, in situ verknoping, gebruiksgemak en uitgebreide gegevensuitvoer.
De XL-MS-technologie van ChomiX maakt gebruik van verschillende chemische cross-linkers om specifieke aminozuurresiduen te targeten, waardoor de eiwit-eiwit- en antilichaam-antigeen-interacties nauwkeurig worden gecrosslinkt en geanalyseerd.
Technisch platform
Gebruikelijke chemische verknopers (zoals weergegeven in de onderstaande figuur) kunnen specifieke aminozuurresiduen covalent verknopen wanneer ze aan eiwitsystemen worden toegevoegd. Na enzymatische vertering worden verknoopte peptiden gegenereerd, die de interactiegebieden tussen eiwitten vertegenwoordigen. Door massaspectrometrie-identificatie en nauwkeurige analyse van de peptidesequenties kan informatie over de interactiegebieden worden verkregen.
Amino-thiol-crosslinker BS3
Amino-sulfhydrylvernettingsmiddel EMCS
Onze voordelen
1. Professionele uitmuntendheid: ons team beschikt over uitgebreide ervaring en publicaties in toptijdschriften en biedt toonaangevende technische diensten.
2. Efficiënte oplossingen: we gebruiken betrouwbare methoden om projecten snel vooruit te helpen en zorgeloze oplossingen te bieden.
3. Rigoureus kwaliteitsmanagement: ons volwassen kwaliteitsmanagementsysteem voldoet aan de ISO 9001-normen en garandeert de authenticiteit en betrouwbaarheid van onze rapporten.
4. Systematisch projectbeheer: van advies tot het opleveren van rapporten, wij zorgen voor tijdige voortgangsupdates, waardoor klanttevredenheid en efficiënte projectuitvoering worden gegarandeerd.
5. Geavanceerde apparatuur: Uitgerust met geavanceerde massaspectrometers zoals de Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 en Bruker timsTOF faciliteren we baanbrekend onderzoek.
Onze service
| Project | Identificatie van interactiegebieden voor eiwit-eiwit- en antilichaam-antigeen-interacties |
| Steekproef | Zuiver eiwit, antilichaam-antigeencomplex |
| Hardwareplatform | Contactloze ultrasone celvergruizer, ChemiDoc MP Imaging System, Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 massaspectrometer |
| Projectduur | 2-4 weken |
| Leveringen | Projectrapport (inclusief experimentele procedures, data-analysegrafieken, bio-informatica-analyseresultaten) |
| Prijs | Klik om te raadplegen |
Casestudy
In dit geval werd het BSA-serumeiwit verknoopt met behulp van de amine-reactieve verknoper BS3 om een dimere structuur van BSA-serumeiwit te construeren. Massaspectrometrie-analyse van de dimere structuur identificeerde verknoopte peptidesegmenten die overeenkwamen met bestaande literatuurgegevens, waardoor de nauwkeurigheid en betrouwbaarheid van het experiment werd gevalideerd.
De feitelijk gedetecteerde verknoopte peptiden komen overeen met de verknoopte peptiden die in de volgende literatuur worden gepresenteerd:Karakterisering van de ontvouwing van eiwitten door middel van snelle vernettingsmassaspectrometrie met behulp van di-ortho-ftaalaldehyde verknopers. Natuurcommunicatie, 13(1), 1468.
