-
Target Discovery Platform: het ontrafelen van de mechanismen van natuurlijke producten
De Aactief ingrediëntbinneninChinese geneeskunde is eenserie vanverbindingSdat havetherapeutische of fysiologische activiteitij.Chinese medicijnen zijn rijk aan variatie, complex van samenstelling en hebben een breed scala aan actieve ingrediënten,constituerendeen belangrijkemanier om te verwervenactieve ingrediënten, loodverbindingen en makinggeneesmiddelen.
Onschemoproteomics-platformblinkt uit inontdekkeningeiwit doelwittenvoor nnatuurlijke producten in de Chinese geneeskunde.Het ingenieustransformerenhet zijn dezenatuurlijke producten in multifunctionele chemische sondes, in navolging van hun biografieactiviteiten.Wanneer deze sondes worden toegepast in levende cellen of zieke weefsels, kunnen dat weldirect vastleggennatuurlijke productbindende eiwitten.Met behulp van bioorthogonale koppelingsreactiesisoleren en verrijken we deze doeleiwitten nauwkeurig. Gebruikmakendmassaspectr. met hoge resolutieometrie bereiken we uiterste nauwkeurigheid tot aan de bindingszakken.Het rust ons uituitgebreidere en nauwkeurigere informatie, klaar om te onthullendeingewikkeldmechanismeten grondslag liggen aan deactieve ingrediënten in de Chinese geneeskunde.
-
Identificatie van niet-covalente bindingszakken voor kleine moleculen in cellen
Identificatie van niet-covalente bindingsplaatsen van kleine moleculen in cellen Platform Technische kenmerken Het is van cruciaal belang om de bindingsmodus tussen kleine molecuulgeneesmiddelen en hun eiwitdoelen voor geneesmiddelenonderzoek en -ontwikkeling te bepalen.Een uitgebreide analyse van deze interacties op zowel structureel als fysisch-chemisch niveau zou ons begrip van eiwitfuncties aanzienlijk kunnen verdiepen en het ontwerp en de optimalisatie van geneesmiddelen kunnen vergemakkelijken.Structurele biologietechnieken, waaronder röntgenstraling, cryo-elektronenm... -
Proteoombrede profilering voor geneesmiddelen voor gerichte eiwitdegradatie (TPD).
Het Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) medicijn is een bifunctioneel molecuul dat kan binden aan het beoogde eiwit en de ubiquitine E3-ligase kan recruteren voor afbraak.Daarom hebben nieuwe modaliteiten zoals PROTAC en moleculaire lijm het vermogen om onbedoeld de overvloed aan endogene eiwitten te veranderen, wat een nieuwe therapeutische methode biedt voor eiwitdoelen, vooral de niet-druggeerbare eiwitten.Het alomvattend kwantificeren van de overvloed aan on- en off-target-eiwitten is een van de standaardexperimenten voor R&D op het gebied van TPD-geneesmiddelen.
-
Identificatie van eiwitdoelen door differentiële proteomics
Identificatie van eiwitdoelen door differentieel proteomicsplatform Technische kenmerken Differentiële proteomics bestudeert de veranderingen van het proteoom onder verschillende fysiologische of pathologische toestanden, zoals medicijnbehandelingen of genregulatie, door twee of meer monsters te vergelijken.Deze aanpak werpt licht op belangrijke levensprocessen of belangrijke ziekten om de belangrijkste verschillende eiwitten te achterhalen die worden beschouwd als markers voor kwalitatieve en functionele analyse.Duizenden eiwitten... -
Chemoproteomische profilering van eiwitdoelen voor niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen
Niet-covalente interacties, zoals waterstofbruggen en π-π-stapeling, kunnen worden verstoord als gevolg van eiwitdenaturatie.Om deze uitdaging aan te gaan, maakt het ChomiX-platform gebruik van fotoaffiniteitslabeling, een beproefde techniek voor het nauwkeurig bevestigen van “chemische labels” aan de actieve plaats van een eiwit.Bovendien transformeert ChomiX's innovatieve in situ chemische crosslinkingstrategie voorbijgaande niet-covalente eiwitinteracties in covalente en permanente chemische bindingen.Door gebruik te maken van een chemische sonde die is gefunctionaliseerd met zowel fotoaffiniteit als bioorthogonale groepen, heeft het chemoproteomics-platform van ChomiX zijn effectiviteit aangetoond bij het succesvol uitvissen van eiwitdoelen in cellysaten, weefsels en levende cellen.Het spectrum van bioactieve geneesmiddelen met kleine moleculen die op het platform worden toegepast, omvat een verscheidenheid aan verbindingen, waaronder endogene metabolieten, natuurlijke producten en niet-covalente synthetische moleculen.
-
Competitieve chemoproteomische profilering van eiwitdoelen voor covalente geneesmiddelen met kleine moleculen
Net als bij niet-covalente geneesmiddelen is de directe pulldown-strategie door gebruik te maken van chemische probes gefunctionaliseerd met reportergroepen ook met succes aangetoond voor covalente geneesmiddelen met kleine moleculen.Het is echter vermeldenswaard dat sommige covalente geneesmiddelen intolerant zijn voor chemische modificaties als gevolg van verlies aan bioactiviteit of synthetische ontoegankelijkheid.Bovendien is de gevormde covalente binding gewoonlijk onstabiel tijdens MS-detectie.
Competitieve chemoproteomische strategie is een ideaal alternatief, dat gebruik maakt van een universele, op activiteit gebaseerde probe voor eiwitlabeling.Er zijn specifieke chemische probes ontwikkeld om te reageren met cysteïne-, lysine-, serine- en histidineresiduen.In principe kan het aminozuurresidu, als het eenmaal is ingenomen door een covalent klein molecuul, niet door de probe worden gemerkt.Als gevolg hiervan konden de ON- en OFF-doelen uitgebreid worden geïdentificeerd door deze competitieve strategie met de resolutie van aminozuren.
