Veel actieve kleine molecuulverbindingen, zoals metabolieten, natuurlijke producten en medicijnmoleculen, interageren dynamisch en reversibel met doeleiwitten op een niet-covalente manier. Wanneer eiwitten worden geïnactiveerd tijdens in vitro onderzoeken, kan dit hun bindingsinteracties verstoren. Fotoaffiniteitslabeling (PAL)-technologie wordt veel gebruikt op het gebied van doelidentificatie van kleine moleculen, beeldvorming van cellulaire distributie en eiwitlabeling. PAL is een gebruikelijke methode voor het covalent vastleggen van interacties tussen kleine moleculen en biomoleculen. Onder stimulatie met ultraviolet licht genereren de fotoreactieve groepen op de chemische sondes (classificatie en kenmerken worden weergegeven in de onderstaande tabel) radicalen, nitrenen of carbenen, die aangrenzende biomoleculen snel en covalent kunnen labelen. Onder hen wordt de diazirinestructuur het meest gebruikt in bio-orthogonale sondes met fotoaffiniteit van kleine moleculen vanwege de sterke biocompatibiliteit, de kleine chemische structuur en de snelle reactiesnelheid.

De representatieve producten zijn als volgt: