Naast traditionele antilichaamverrijkingsstrategieën zijn chemische, enzymatische en metabolische labelingstechnieken geleidelijk toegepast bij de verrijking en identificatie van post-translationele modificaties (PTM) in eiwitten. Het onderliggende principe omvat het gebruik van chemische reacties of enzymkatalyse om specifieke moleculaire probes covalent te hechten aan doelmodificaties of modificerende residuen, gevolgd door proteomische analyse. Deze opkomende benadering in chemoproteomics wordt belangrijk in de studie van eiwitmodificaties met een lage overvloed, zoals palmitoylatie, myristoylatie en glycosylatie. Het biedt met name het voordeel dat het toepasbaar is in levende cellen, waardoor potentiële interferentie, zoals oxidatie als gevolg van celstress, wordt omzeild.
Cysteïne (Cys) is een veel voorkomend zwavelhoudend aminozuur in eiwitten, en de thiolgroep ervan speelt een cruciale rol bij het reguleren van moleculaire redoxhomeostase, het beïnvloeden van enzymatische reacties, eiwit-eiwitinteracties en eiwitstabiliteit via diverse post-translationele modificatieprocessen. Veel voorkomende post-translationele modificaties van cysteïne zijn onder meer palmitoylatie, nitrosylatie, sulfenylatie en sulfonering. Colosseum Biosciences heeft universele probes of metabolische labelingsstrategieën ontwikkeld die zich richten op cysteïneresiduen en heeft overeenkomstige chemische proteomicsplatforms opgezet voor post-translationele modificatie-identificatie. Dit platform identificeert nauwkeurig doeleiwitten en modificatieplaatsen van post-translationele modificaties.
Lysine (Lys) is een van de aminozuren met de meest uiteenlopende post-translationele modificaties (PTM's) in het proteoom. Omkeerbare lysine post-translationele modificaties (Lys-PTM's) zijn veel voorkomende biochemische processen die een onmisbare rol spelen bij het reguleren van talrijke kritische cellulaire functies. Post-translationele modificaties op lysine omvatten acetylering, succinylatie, propionylatie, butyrylatie, crotonylatie, malonylering en lactylatie. Colosseum Biosciences heeft een technologieplatform voor chemische proteomics ontwikkeld, gebaseerd op chemische probes voor post-translationele modificaties van lysine, dat doeleiwitten en modificatieplaatsen nauwkeurig identificeert.
Veel voorkomende post-translationele modificaties op serine (Ser) en threonine (Thr) omvatten voornamelijk fosforylatie, O-glycosylatie, enz. Deze modificaties hebben een aanzienlijke invloed op de activiteitstoestand van eiwitten en hun interacties met andere moleculen, en spelen een belangrijke rol in verschillende belangrijke biologische processen. Daarom is de analyse van dit soort post-translationele modificatie een belangrijk onderwerp in het onderzoek naar de eiwitfunctie. Colosseum Biosciences maakt gebruik van fosforyleringsverrijkingsmaterialen, niet-natuurlijke chemische glycansondes en andere hulpmiddelen om doeleiwitten en modificatieplaatsen voor dit soort post-translationele modificatie nauwkeurig te identificeren.
Onze voordelen
01. Zeer professioneel:Mogelijk gemaakt door de onderzoeksgroep van professor Wang Chu van de Universiteit van Peking, de hoofdwetenschapper van ons bedrijf.
02. One-stop-platform:Omvat de volledige workflow, van probe-ontwerp, probe-synthese, doeldetectie tot bio-informatica-analyse.
03. Geen behoefte aan antilichamen:Specifieke chemische sondemodificatie,Fysiologisch
04. Milieu:Toepasbaar in zowel lysaten als levende cellen.
05. Uitgebreide ervaring:Geaccumuleerde expertise in meer dan 10 verschillende soorten PTM's
06. Krachtig platform:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480,Thermo Fisher Q Exactieve HF-X,Bruker timsTOF
Casestudy
Itaconatie verwijst naar het proces waarbij itaconaat covalent bindt aan specifieke plaatsen op eiwitten tijdens post-translationele modificatie. Deze wijziging kan de structuur en functie van het eiwit veranderen, waardoor de rol ervan in de cel wordt beïnvloed. Itaconatie kan bijvoorbeeld de enzymactiviteit, stabiliteit of interacties met andere moleculen reguleren. Omdat itaconaat een tussenproduct is in de tricarbonzuurcyclus, is deze wijziging nauw verbonden met de metabolische toestand van de cel. Onderzoek heeft aangetoond dat itaconatie een belangrijke rol speelt in de pathologie van bepaalde ziekten, en het begrijpen van dit modificatiemechanisme zou kunnen helpen bij het ontwikkelen van nieuwe therapeutische strategieën.
De cellen die metabolisch gelabeld waren met ITalk-sondes op levend celniveau werden gelyseerd, gevolgd door klikreactie, verrijking, enzymvertering en andere stappen om de specifieke plaats van itaconverzuring te bepalen.