Gerichte Proteomics-analyse

Proteomics-onderzoek kan in twee takken worden ingedeeld op basis van de vraag of de focus specifiek is op een bepaalde klasse eiwitten: gerichte proteomics en ongerichte proteomics. Gerichte proteomics leggen de nadruk op een nauwkeurige en diepgaande studie van vooraf gedefinieerde doeleiwitten, terwijl ongerichte proteomics tot doel hebben alle eiwitten in het monster volledig te detecteren, met als doel onbekende eiwittypen en potentiële biomarkers te ontdekken, en wordt daarom vaak ontdekkingsproteomics genoemd. . De ontwikkeling van niet-gerichte proteomics dateert van vóór die van gerichte proteomics en is bijzonder geschikt voor de eerste verkenning van biomarkers.

Wanneer specifieke eiwitten of waardevolle biomarkers worden geïdentificeerd in ongericht proteomics-onderzoek, kunnen onderzoekers gerichte proteomics-technologie verder gebruiken om deze doeleiwitten in een grotere steekproefpopulatie te valideren en uitgebreid te bestuderen. Vergeleken met ongerichte proteomics vertoont gerichte proteomics superieure prestaties op het gebied van nauwkeurigheid, gevoeligheid en reproduceerbaarheid, waardoor nauwkeurigere en betrouwbaardere hulpmiddelen worden geboden voor diepgaand proteomisch onderzoek.

Technisch platform

Wij bieden gerichte en ongerichte proteomics-analysediensten op basis van massaspectrometrietechnologie, met als doel onze klanten uitgebreide en diepgaande ondersteuning te bieden voor eiwitonderzoek.

Op het gebied van ongerichte proteomics biedt Chomix verschillende methoden, waaronder labelvrije kwantificeringsproteomics, op SILAC gebaseerde kwantificeringsproteomics en op TMT/IBT gebaseerde kwantificeringsproteomics, allemaal gericht op het systematisch onthullen en kwantificeren van zoveel mogelijk eiwitcomponenten in het monster. .

Op het gebied van gerichte proteomics maakt Chomix gebruik van parallelle reactiemonitoring (PRM) als kerntechnologie. PRM kan op gevoelige wijze peptidefragmenten met een lage overvloed detecteren, achtergrondeiwitinterferentie effectief elimineren en zeer nauwkeurige kwantificering bereiken, waardoor de biologisch differentiële eiwitten die door ongerichte proteomics worden onthuld, efficiënt worden gevalideerd en bevestigd.

Vergeleken met traditionele methoden voor gerichte eiwitkwantificatie, zoals Western blot, vereisen gerichte proteomics-benaderingen niet de ontwikkeling van antilichamen en kunnen ze tegelijkertijd meerdere eiwitten detecteren, met de optie voor absolute kwantificering wanneer dat nodig is.

Onze voordelen

1. Professionele uitmuntendheid: ons team beschikt over uitgebreide ervaring en publicaties in toptijdschriften en biedt toonaangevende technische diensten.

2. Efficiënte oplossingen: we gebruiken betrouwbare methoden om projecten snel vooruit te helpen en zorgeloze oplossingen te bieden.

3. Rigoureus kwaliteitsmanagement: ons volwassen kwaliteitsmanagementsysteem voldoet aan de ISO 9001-normen en garandeert de authenticiteit en betrouwbaarheid van onze rapporten.

4. Systematisch projectbeheer: van advies tot het opleveren van rapporten, wij zorgen voor tijdige voortgangsupdates, waardoor klanttevredenheid en efficiënte projectuitvoering worden gegarandeerd.

5. Geavanceerde apparatuur: Uitgerust met geavanceerde massaspectrometers zoals de Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 en Bruker timsTOF faciliteren we baanbrekend onderzoek.

Onze service

Project	Gerichte/ongerichte kwantitatieve proteomics-analyseset
Steekproef	Weefsel, celpellets, lysaten
Hardwareplatform	VanquishNeo UPLC gekoppeld aan Orbitrap Exploris 480 massaspectrometer (Thermo Fisher Scientific) EASY-nLC1200 UPLC gekoppeld aan Q Exactive HF-X massaspectrometer (Thermo Fisher Scientific)
Projectduur	4 weken
Leveringen	Projectrapport (inclusief kwalitatieve/kwantitatieve eiwitgegevenstabellen, bio-informatica-analyse, kwaliteitscontroleanalyse, enz.)
Prijs	Klik om te raadplegen

Casestudy

Om dieper in te gaan op de bindingsplaatsen van bepaalde doeleiwitten in celmonsters die met het medicijn zijn behandeld in vergelijking met de controlegroep, om de moleculaire mechanismen gerelateerd aan het medicijnfenotype te onthullen, hebben we een gerichte kwantitatieve proteomics-benadering gebruikt, gebaseerd op PRM (Parallel Reaction Monitoring) technologie. Elke groep werd verwerkt met twee biologische replicaten, waardoor nauwkeurige identificatie en kwantitatieve analyse van verschillende bindingsplaatsen mogelijk was.