Afbeelding van onderzoeker in het laboratorium

Dienst

  • Identificatie van eiwit-eiwit-, antilichaam-antigeen-interactiegebieden: chemische verknoping

    Identificatie van eiwit-eiwit-, antilichaam-antigeen-interactiegebieden: chemische verknoping

    Identificatie van eiwit-eiwit-, antilichaam-antigeen-interactiegebieden: chemische verknoping Het begrijpen van de eiwitstructuur en interacties is essentieel voor het blootleggen van hun biologische functies. Vanwege de complexiteit van het proteoom kan geen enkele techniek deze aspecten volledig onthullen. Biologen gebruiken vaak een combinatie van methoden, waarbij cross-linking massaspectrometrie (XL-MS) opvalt vanwege zijn unieke voordelen. XL-MS biedt nauwkeurige ruimtelijke afstandsinformatie tussen aminozuurre...
  • Identificatie van eiwit-eiwitinteractie in levende cellen: nabijheidslabeling

    Identificatie van eiwit-eiwitinteractie in levende cellen: nabijheidslabeling

    Identificatie van eiwit-eiwitinteractie in levende cellen: technisch platform voor nabijheidslabeling Het TurboID-technologieplatform omvat het fuseren van een gemuteerde biotineligase aan de C-terminus van een doeleiwit. In tot overexpressie gebrachte cellen biotinyleert de toevoeging van biotine snel interagerende eiwitten binnen 10 minuten, zelfs bij kamertemperatuur, met minimale achtergrondruis. Deze veelzijdigheid maakt TurboID geschikt voor een breed scala aan biologische systemen, waaronder zoogdiercellen, pla...
  • Eiwit-eiwit-interacties

    Eiwit-eiwit-interacties

    Eiwit-eiwitinteracties Eiwit-eiwitinteracties (PPI's) dienen als de hoeksteen van cellulaire levensactiviteiten en spelen een cruciale rol bij celsignalering, structurele assemblage en belangrijke levensprocessen zoals pathogeen-gastheerherkenning. Veel pathologische processen worden echter ook veroorzaakt door afwijkingen in PPI's. Daarom heeft het ingrijpen en reguleren van PPI's een enorm potentieel getoond als middel om gerelateerde ziekten te behandelen. ChomiX integreert een reeks geavanceerde technologieplatforms...
  • Doelidentificatie en selectiviteitsanalyse van gerichte eiwitafbrekers

    Doelidentificatie en selectiviteitsanalyse van gerichte eiwitafbrekers

    Doelidentificatie en selectiviteitsanalyse van gerichte eiwitafbrekers Het Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) medicijn is een bifunctioneel molecuul dat kan binden aan het beoogde eiwit en de ubiquitine E3-ligase kan recruteren voor afbraak. Daarom hebben nieuwe modaliteiten zoals PROTAC en moleculaire lijm het vermogen om onbedoeld de overvloed aan endogene eiwitten te veranderen, wat een nieuwe therapeutische methode biedt voor eiwitdoelen, vooral de niet-druggeerbare eiwitten. Alomvattend...
  • Kwantitatieve analyse van bezetting en selectiviteit van covalente geneesmiddeldoelen voor kleine moleculen

    Kwantitatieve analyse van bezetting en selectiviteit van covalente geneesmiddeldoelen voor kleine moleculen

    Kwantitatieve analyse van de bezetting en selectiviteit van covalente doelwitten voor kleine moleculen Covalente geneesmiddelen werken voornamelijk door het vormen van covalente bindingen met specifieke aminozuurresiduen op doeleiwitten, zoals cysteïne, lysine en serine. Aspirine is een van de vroegst bekende covalente medicijnmoleculen. Bovendien vertonen veel natuurlijke producten covalente eigenschappen, zoals oridonine, dat ontstekingsremmende bioactiviteit heeft. De afgelopen jaren hebben covalente gerichte medicijnen steeds meer aandacht gekregen.
  • Identificatie van de bindingsplaats voor niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen in levende cellen

    Identificatie van de bindingsplaats voor niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen in levende cellen

    Identificatie van de bindingsplaats voor niet-covalente geneesmiddelen uit kleine moleculen in levende cellen. Op cellulair niveau kan het direct bestuderen van de werkingswijze tussen geneesmiddelen en doeleiwitten helpen veranderingen in de eiwitstructuur tijdens de zuivering en vals-positieve resultaten die kunnen voortkomen uit kunstmatige buffersystemen en hoge geneesmiddel-eiwitconcentraties. Technisch platform ChomiX levert diensten op het gebied van chemische proteomics waarbij gebruik wordt gemaakt van biologisch actieve fotoreactieve chemische sondes (met...
  • Identificatie van niet-covalente geneesmiddeldoelen voor kleine moleculen op basis van fotoaffiniteitssondes

    Identificatie van niet-covalente geneesmiddeldoelen voor kleine moleculen op basis van fotoaffiniteitssondes

    Identificatie van niet-covalente geneesmiddeldoelen voor kleine moleculen op basis van fotoaffiniteitssondes Technisch platform Het chemische proteomics doelwitidentificatieplatform op basis van fotoaffiniteitssondes omvat verschillende belangrijke stappen, waaronder sondeontwerp, synthese, activiteitsbeoordeling, labeling, eiwitverrijking en gegevensanalyse. Niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen, zoals synthetische verbindingen, kruidenextracten, natuurlijke producten en metabolieten, kunnen worden gemodificeerd tot fotoaffiniteitssondes. Op...
  • Interacties tussen kleine moleculen en eiwitten

    Interacties tussen kleine moleculen en eiwitten

    Interacties tussen kleine moleculen en eiwitten Eiwitten vertegenwoordigen, als directe deelnemers en uitvoerders van levensactiviteiten, cruciale doelwitten voor ziektetherapie. Geneesmiddelen met kleine moleculen (organische verbindingen die doorgaans een molecuulgewicht van minder dan 1000 Da hebben) oefenen effectieve therapeutische effecten uit door de eiwitactiviteiten, -abundanties en -interacties nauwkeurig te moduleren. Veel voorkomende geneesmiddelen met kleine moleculen omvatten natuurlijke producten en hun derivaten (bijvoorbeeld kruidenmonomeren), maar ook chemisch gesynthetiseerde geneesmiddelen. Op...
  • Target Discovery Platform: het ontrafelen van de mechanismen van natuurlijke producten

    Target Discovery Platform: het ontrafelen van de mechanismen van natuurlijke producten

    De eenactief ingrediëntbinneninChinese geneeskunde is eenserie vanverbindingSdat havetherapeutische of fysiologische activiteitij. Chinese medicijnen zijn rijk aan variatie, complex van samenstelling en hebben een breed scala aan actieve ingrediënten,constituerendeen belangrijkmanier om te verwervenactieve ingrediënten, loodverbindingen en makinggeneesmiddelen.

    Onschemoproteomics-platformblinkt uit inontdekkeningeiwit doelwittenvoor nnatuurlijke producten in de Chinese geneeskunde. Het ingenieustransformerenhet zijn dezenatuurlijke producten in multifunctionele chemische sondes, in navolging van hun biografieactiviteiten.Wanneer deze sondes worden toegepast in levende cellen of zieke weefsels, kunnen dat weldirect vastleggennatuurlijke productbindende eiwitten. Met behulp van bioorthogonale koppelingsreactiesisoleren en verrijken we deze doeleiwitten nauwkeurig. Gebruikmakendmassaspectr. met hoge resolutieometrie bereiken we uiterste nauwkeurigheid tot aan de bindingszakken. Het rust ons uituitgebreidere en nauwkeurigere informatie, klaar om te onthullendeingewikkeldmechanismeten grondslag liggen aan deactieve ingrediënten in de Chinese geneeskunde.

  • Identificatie van niet-covalente bindingszakken voor kleine moleculen in cellen

    Identificatie van niet-covalente bindingszakken voor kleine moleculen in cellen

    Identificatie van niet-covalente bindingsplaatsen van kleine moleculen in cellen Platform Technische kenmerken Het is van cruciaal belang om de bindingsmodus tussen kleine molecuulgeneesmiddelen en hun eiwitdoelen voor geneesmiddelenonderzoek en -ontwikkeling te bepalen. Een uitgebreide analyse van deze interacties op zowel structureel als fysisch-chemisch niveau zou ons begrip van eiwitfuncties aanzienlijk kunnen verdiepen en het ontwerp en de optimalisatie van geneesmiddelen kunnen vergemakkelijken. Structurele biologietechnieken, waaronder röntgenstraling, cryo-elektronenmicroscopie ...
  • Proteoombrede profilering voor geneesmiddelen voor gerichte eiwitdegradatie (TPD).

    Proteoombrede profilering voor geneesmiddelen voor gerichte eiwitdegradatie (TPD).

    Het Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) medicijn is een bifunctioneel molecuul dat kan binden aan het beoogde eiwit en de ubiquitine E3-ligase kan recruteren voor afbraak. Daarom hebben nieuwe modaliteiten zoals PROTAC en moleculaire lijm het vermogen om onbedoeld de overvloed aan endogene eiwitten te veranderen, wat een nieuwe therapeutische methode biedt voor eiwitdoelen, vooral de niet-druggeerbare eiwitten. Het alomvattend kwantificeren van de overvloed aan on- en off-target-eiwitten is een van de standaardexperimenten voor R&D op het gebied van TPD-geneesmiddelen.

  • Identificatie van eiwitdoelen door differentiële proteomics

    Identificatie van eiwitdoelen door differentiële proteomics

    Identificatie van eiwitdoelen door differentieel proteomicsplatform Technische kenmerken Differentiële proteomics bestudeert de veranderingen van het proteoom onder verschillende fysiologische of pathologische toestanden, zoals medicijnbehandelingen of genregulatie, door twee of meer monsters te vergelijken. Deze aanpak werpt licht op belangrijke levensprocessen of belangrijke ziekten om de belangrijkste verschillende eiwitten te achterhalen die worden beschouwd als markers voor kwalitatieve en functionele analyse. Duizenden eiwitten kunnen worden geïdentificeerd...