-
Identificatie van interactiegebieden voor eiwit-eiwit- en antilichaam-antigeen-interacties
Identificatie van interactiegebieden voor eiwit-eiwit- en antilichaam-antigeen-interacties Een diepgaand begrip van de eiwitstructuur en de interacties ervan is cruciaal voor het onthullen van hun biologische functies. Vanwege de complexiteit en diversiteit op het gebied van eiwitten heeft één enkele onderzoekstechniek echter vaak moeite om de mysteries ervan volledig op te helderen. Daarom hanteren biologen doorgaans een strategie waarbij meerdere technische benaderingen worden geïntegreerd om gezamenlijk de drie dimensies te onderzoeken... -
Identificatie van eiwit-eiwit-interactienetwerken in cellen
Identificatie van eiwit-eiwit-interactienetwerken in cellen Eiwit-eiwit-interacties (PPI's) vormen een onmisbare kerncomponent van cellulaire levensactiviteiten, die meerdere temporele en ruimtelijke dimensies omspannen en een diepgaande invloed hebben op cruciale cellulaire processen zoals de regulering van de celcyclus, eiwitsynthese en -secretie, signaaloverdracht en -uitscheiding. transductie en metabolisme. Daarom speelt een diepgaand onderzoek naar eiwitinteracties een cruciale rol bij het ontrafelen van de mysteries van moleculaire... -
Eiwit-eiwit-interacties
Eiwit-eiwitinteracties Eiwit-eiwitinteracties (PPI's) dienen als de hoeksteen van cellulaire levensactiviteiten en spelen een cruciale rol bij celsignalering, structurele assemblage en belangrijke levensprocessen zoals pathogeen-gastheerherkenning. Veel pathologische processen worden echter ook veroorzaakt door afwijkingen in PPI's. Daarom heeft het ingrijpen en reguleren van PPI's een enorm potentieel getoond als middel om gerelateerde ziekten te behandelen. ChomiX integreert een reeks geavanceerde technologieplatforms... -
Identificatie en selectiviteitsanalyse van doelwitten voor eiwitafbraak
Identificatie en selectiviteitsanalyse van doelwitten voor eiwitafbraak De afgelopen jaren is gerichte eiwitafbraak (TPD) naar voren gekomen als een innovatieve therapeutische strategie die erop gericht is ziekten te moduleren door in te grijpen in de eiwitexpressie met behulp van medicijnmoleculen. Van deze benaderingen heeft proteolyse gericht op chimeren (PROTAC's) veel aandacht gekregen. Het concept van PROTAC werd voor het eerst voorgesteld door Crews et al. in 2001, met als kernidee het benutten van het endogene ubiquitine-proteasoom... -
Kwantitatieve analyse van bezetting en selectiviteit van covalente geneesmiddeldoelen voor kleine moleculen
Kwantitatieve analyse van de bezetting en selectiviteit van covalente doelwitten voor kleine moleculen Covalente geneesmiddelen oefenen hun effecten voornamelijk uit door covalente bindingen te vormen met specifieke aminozuurresiduen op doeleiwitten, waaronder onder meer cysteïne, lysine en serine. Aspirine was het eerste covalente medicijnmolecuul dat werd ontdekt, en er bestaan verschillende representatieve covalente medicijnen met ontstekingsremmende bioactiviteit in natuurlijke producten, zoals artemisinine. In de afgelopen jaren zijn covalente gerichte medicijnen in opkomst gekomen... -
Identificatie van bindingszakken voor niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen
Identificatie van bindingsplaatsen voor niet-covalente geneesmiddelen met kleine moleculen In het proces van de ontwikkeling van geneesmiddelen met kleine moleculen is het begrijpen van de bindingsmodus tussen geneesmiddelen en doeleiwitten cruciaal voor het ophelderen van geneesmiddelmechanismen en het begeleiden van daaropvolgende structurele optimalisatie. Structurele biologische technieken zoals röntgenkristallografie, cryo-elektronenmicroscopie (cryo-EM) en nucleaire magnetische resonantie (NMR) zijn belangrijke hulpmiddelen geworden voor het bepalen van geneesmiddelbindingsmodellen. Vooral hoge resolutie... -
Identificatie van directe doelwitten voor niet-covalente kleine molecuulgeneesmiddelen
Identificatie van directe doelwitten voor niet-covalente kleinmoleculaire geneesmiddelen Op het gebied van de ontwikkeling van geneesmiddelen voor ziekten spelen kleinmoleculaire geneesmiddelen ongetwijfeld een cruciale rol. Volgens recente statistieken komt maar liefst 84% van de 854 menselijke eiwitdoelen waarop door de FDA goedgekeurde geneesmiddelen zijn gericht, overeen met kleine molecuulgeneesmiddelen. Opvallend is dat slechts 665 van deze doelwitten met succes zijn ontwikkeld met geneesmiddelen uit kleine moleculen (bron: https://www.proteïneatlas.org/humanproteome/tissue/druggable). Kleine m... -
Interacties tussen kleine moleculen en eiwitten
Interacties tussen kleine moleculen en eiwitten Eiwitten vertegenwoordigen, als directe deelnemers en uitvoerders van levensactiviteiten, cruciale doelwitten voor ziektetherapie. Geneesmiddelen met kleine moleculen (organische verbindingen die doorgaans een molecuulgewicht van minder dan 1000 Da hebben) oefenen effectieve therapeutische effecten uit door de eiwitactiviteiten, -abundanties en -interacties nauwkeurig te moduleren. Veel voorkomende geneesmiddelen met kleine moleculen omvatten natuurlijke producten en hun derivaten (bijvoorbeeld kruidenmonomeren), maar ook chemisch gesynthetiseerde geneesmiddelen. Op... -
Target Discovery Platform: het ontrafelen van de mechanismen van natuurlijke producten
De eenactief ingrediëntbinneninChinese geneeskunde is eenserie vanverbindingSdat havetherapeutische of fysiologische activiteitij. Chinese medicijnen zijn rijk aan variatie, complex van samenstelling en hebben een breed scala aan actieve ingrediënten,constituerendeen belangrijkmanier om te verwervenactieve ingrediënten, loodverbindingen en makinggeneesmiddelen.
Onschemoproteomics-platformblinkt uit inontdekkeningeiwit doelwittenvoor nnatuurlijke producten in de Chinese geneeskunde. Het ingenieustransformerenhet zijn dezenatuurlijke producten in multifunctionele chemische sondes, in navolging van hun biografieactiviteiten.Wanneer deze sondes worden toegepast in levende cellen of zieke weefsels, kunnen dat weldirect vastleggennatuurlijke productbindende eiwitten. Met behulp van bioorthogonale koppelingsreactiesisoleren en verrijken we deze doeleiwitten nauwkeurig. Gebruikmakendmassaspectr. met hoge resolutieometrie bereiken we uiterste nauwkeurigheid tot aan de bindingszakken. Het rust ons uituitgebreidere en nauwkeurigere informatie, klaar om te onthullendeingewikkeldmechanismeten grondslag liggen aan deactieve ingrediënten in de Chinese geneeskunde.
-
Identificatie van niet-covalente bindingszakken voor kleine moleculen in cellen
Identificatie van niet-covalente bindingsplaatsen van kleine moleculen in cellen Platform Technische kenmerken Het is van cruciaal belang om de bindingsmodus tussen kleine molecuulgeneesmiddelen en hun eiwitdoelen voor geneesmiddelenonderzoek en -ontwikkeling te bepalen. Een uitgebreide analyse van deze interacties op zowel structureel als fysisch-chemisch niveau zou ons begrip van eiwitfuncties aanzienlijk kunnen verdiepen en het ontwerp en de optimalisatie van geneesmiddelen kunnen vergemakkelijken. Structurele biologietechnieken, waaronder röntgenstraling, cryo-elektronenmicroscopie ... -
Proteoombrede profilering voor geneesmiddelen voor gerichte eiwitdegradatie (TPD).
Het Proteolysis Targeting Chimeras (PROTAC) medicijn is een bifunctioneel molecuul dat kan binden aan het beoogde eiwit en de ubiquitine E3-ligase kan recruteren voor afbraak. Daarom hebben nieuwe modaliteiten zoals PROTAC en moleculaire lijm het vermogen om onbedoeld de overvloed aan endogene eiwitten te veranderen, wat een nieuwe therapeutische methode biedt voor eiwitdoelen, vooral de niet-druggeerbare eiwitten. Het alomvattend kwantificeren van de overvloed aan on- en off-target-eiwitten is een van de standaardexperimenten voor R&D op het gebied van TPD-geneesmiddelen.
-
Identificatie van eiwitdoelen door differentiële proteomics
Identificatie van eiwitdoelen door differentieel proteomicsplatform Technische kenmerken Differentiële proteomics bestudeert de veranderingen van het proteoom onder verschillende fysiologische of pathologische toestanden, zoals medicijnbehandelingen of genregulatie, door twee of meer monsters te vergelijken. Deze aanpak werpt licht op belangrijke levensprocessen of belangrijke ziekten om de belangrijkste verschillende eiwitten te achterhalen die worden beschouwd als markers voor kwalitatieve en functionele analyse. Duizenden eiwitten kunnen worden geïdentificeerd...
