Lek Chimery ukierunkowane na proteolizę (PROTAC) to dwufunkcyjna cząsteczka, która może wiązać się z docelowym białkiem i rekrutować ligazę ubikwitynową E3 do degradacji. Dlatego nowe metody, takie jak PROTAC i klej molekularny, mogą w sposób niezamierzony zmieniać liczebność białek endogennych, co zapewnia nową metodę terapeutyczną w przypadku docelowych białek, zwłaszcza białek, których nie można leczyć. Kompleksowe ilościowe określenie obfitości białek docelowych i poza docelowych było jednym ze standardowych eksperymentów w ramach prac badawczo-rozwojowych nad lekami TPD.
ChomiX opracował innowacyjne ilościowe platformy chemicznej proteomiki, umożliwiające precyzyjną analizę ponad 5000 białek w pojedynczej linii komórkowej, wspierając kompleksowe badania selektywności docelowej. Na przykład platforma Tandem Mass Tag (TMT) ekstrahuje i przetwarza proteomy z komórek poddanych działaniu degradatorów białek, stosując trawienie enzymatyczne, znakowanie i chromatografię cieczową w celu głębokiego pokrycia proteomu. Następnie spektrometria mas analizuje różnice w liczebności białek, dostarczając kluczowych danych dotyczących celu i selektywności na potrzeby rozwoju substancji degradujących białka. Ponadto platforma Data Independent Acquisition (DIA) firmy ChomiX skutecznie określa ilościowo białka o niskiej liczebności w złożonych próbkach, identyfikując subtelne różnice w proteomie.
1. Doskonałość techniczna: doświadczony zespół, najwyższej klasy publikacje w czasopismach i wiarygodne usługi branżowe.
2. Podstawowa technologia patentowa: ekskluzywne patenty i zaawansowany sprzęt do wspierania wczesnego opracowywania leków.
3. Kompleksowa usługa: obejmująca projektowanie sond, syntezę, odkrywanie celów, analizę bioinformatyczną i terminową informację zwrotną o postępie w celu zadowolenia klienta.
4. Rygorystyczne zarządzanie jakością: Certyfikat ISO9001 zapewnia wiarygodne i autentyczne raporty.
Projekt | Identyfikacja i analiza selektywności docelowych degradatorów białek |
Próbka | Lizat komórkowy, żywe komórki |
Platforma sprzętowa | Bezkontaktowy ultradźwiękowy rozdrabniacz komorowy, system obrazowania ChemiDoc MP, spektrometr mas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
Czas trwania projektu | 3-4 tygodnie |
Elementy dostarczane | Raport z projektu (w tym procedury eksperymentalne, wykresy analizy danych, wyniki analiz bioinformatycznych) |
Cena | Kliknij, aby skonsultować się |
Cel projektu: Zaprojektowano i zsyntetyzowano dwie cząsteczki PROTAC. Należy przeanalizować białka docelowe i pozacelowe w celu porównania selektywności.
Metoda eksperymentalna: Do analizy proteomicznej wykorzystano ilościową metodę MS opartą na TMT.
Wyniki projektu:
Ogółem oznaczono ilościowo 5900 białek w liniach komórek nowotworowych oraz zidentyfikowano cele ON i OFF dla cząsteczek PROTAC1 i 2 (spektrometr mas Orbitrap Exploris 480, TMT10plex i analiza danych za pomocą PD 2.5).