Produkty
Identyfikacja kieszeni wiążących dla niekowalencyjnych leków drobnocząsteczkowych
W procesie opracowywania leków małocząsteczkowych zrozumienie sposobu wiązania leków z białkami docelowymi ma kluczowe znaczenie dla wyjaśnienia mechanizmów działania leku i ukierunkowania późniejszej optymalizacji strukturalnej. Techniki biologii strukturalnej, takie jak krystalografia rentgenowska, mikroskopia krioelektronowa (cryo-EM) i jądrowy rezonans magnetyczny (NMR), stały się kluczowymi narzędziami do określania modeli wiązania leków. W szczególności struktury kokrystaliczne leku i białka o wysokiej rozdzielczości znacznie ułatwiły optymalizację struktury leku.
Jednakże wyjaśnienie struktury białek, zwłaszcza docelowych białek błonowych, takich jak GPCR i kanały jonowe, stanowi zniechęcające wyzwanie w badaniach z zakresu nauk przyrodniczych. Proces ten obejmuje wiele etapów, w tym ekspresję i oczyszczanie białek, badanie przesiewowe warunków krystalizacji leku z białkiem, gromadzenie danych dotyczących kryształów i analizę, które są nie tylko czasochłonne, ale także kosztowne.
Na poziomie komórkowym bezpośrednie badanie sposobu działania leków i białek docelowych może pomóc uniknąć zmian w strukturze białek podczas oczyszczania i fałszywie dodatnich wyników, które mogą wynikać ze sztucznych układów buforowych i wysokich stężeń leku i białka. Chomix dąży do świadczenia kompleksowych usług, wykorzystując zaawansowane technologie do rozwiązywania problemów związanych z określeniem interakcji pomiędzy lekami małocząsteczkowymi a białkami docelowymi z komórek, zapewniając w ten sposób silne wsparcie techniczne dla wysiłków klientów w zakresie opracowywania leków.
Platforma Techniczna
Chomix świadczy usługi proteomiki chemicznej z wykorzystaniem biologicznie aktywnych fotoreaktywnych sond chemicznych (o działaniu zbliżonym do cząsteczek leków). Sondy te inkubuje się z komórkami lub tkankami istotnymi dla choroby w fizjologicznie odpowiednich stężeniach leków, a następnie stosuje się technologię szybkiego fotosieciowania in situ w celu przekształcenia niekowalencyjnych interakcji między sondami cząsteczek leku i docelowymi białkami w interakcje kowalencyjne. Następnie, poprzez etapy takie jak wzbogacanie docelowego białka, trawienie enzymatyczne w celu uwolnienia niezmodyfikowanych segmentów peptydowych oraz selektywne wzbogacanie segmentów peptydowych modyfikowanych sondą cząsteczki leku, w połączeniu z wysokorozdzielczą spektrometrią mas biomolekuł, można szybko określić informacje o sekwencji peptydów. Wreszcie, narzędzia dokowania molekularnego służą do szybkiego uzyskiwania modeli wiązania leków z białkami docelowymi, zapewniając solidne wsparcie dla późniejszych badań w dziedzinie chemii medycznej.
Nasze zalety
1. Doskonałość techniczna: doświadczony zespół, najwyższej klasy publikacje w czasopismach i wiarygodne usługi branżowe.
2. Podstawowa technologia patentowa: ekskluzywne patenty i zaawansowany sprzęt do wspierania wczesnego opracowywania leków.
3. Kompleksowa usługa: obejmująca projektowanie sond, syntezę, odkrywanie celów, analizę bioinformatyczną i terminową informację zwrotną o postępie w celu zadowolenia klienta.
4. Rygorystyczne zarządzanie jakością: Certyfikat ISO9001 zapewnia wiarygodne i autentyczne raporty.
Nasz serwis
| Projekt | Identyfikacja kieszeni wiążących dla niekowalencyjnych leków drobnocząsteczkowych |
| Próbka | Czyste białko, lizat komórkowy, żywe komórki, chora tkanka, krew, bakterie, tkanka roślinna |
| Platforma sprzętowa | Bezkontaktowy ultradźwiękowy rozdrabniacz komorowy, system obrazowania ChemiDoc MP, spektrometr mas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Czas trwania projektu | 2-4 tygodnie |
| Elementy dostarczane | Raport projektu (w tym procedury eksperymentalne, wykresy analizy danych, wyniki analiz bioinformatycznych) |
| Cena | Kliknij, aby skonsultować się |
Studium przypadku
Celem potencjalnej cząsteczki leku B jest białko wielotransbłonowe z wieloma kieszeniami wiążącymi lek. Pomimo wielu prób wykorzystania metod biologii strukturalnej, takich jak promieniowanie rentgenowskie i krio-EM, nie udało się uzyskać modelu wiązania pomiędzy cząsteczką leku a docelowym białkiem.
W oparciu o strukturę i aktywność potencjalnej cząsteczki leku B nasza firma zaprojektowała i zsyntetyzowała fotoreaktywną sondę chemiczną, Probe B, zawierającą grupy fotoreaktywne i bioortogonalne. Wykorzystując wspomnianą powyżej platformę do odkrywania obiektów proteomiki chemicznej, najpierw poddano walidacji białka docelowe w liniach komórkowych istotnych dla aktywności potencjalnej cząsteczki leku B. Następnie, wykorzystując technologię identyfikacji niekowalencyjnych kieszeni wiążących lek opartą na spektrometrii mas, przestrzennie sąsiadujące ze sobą segmenty peptydowe określono kieszenie wiążące lek i dostarczono model wiązania leku z białkiem.
Testy immunoblottingu ujawniły, że cząsteczka B-kandydata leku skutecznie konkuruje z sygnałami znakowania sondy w komórkach, co wskazuje na bezpośrednie wiązanie pomiędzy cząsteczką-kandydatem leku a białkiem docelowym.
Ponieważ sondy chemiczne mogą sieciować jedynie z segmentami peptydowymi znajdującymi się w bliskiej odległości przestrzennej, sekwencję CLPFIIGCNPTILHVHELYIR zidentyfikowano za pomocą tandemowej spektrometrii mas o wysokiej rozdzielczości w celu określenia usieciowanych segmentów peptydowych.
