Produkty
Identyfikacja niekowalencyjnych celów leków małocząsteczkowych w oparciu o sondy fotopowinowactwa
Platforma Techniczna
Platforma identyfikacji celów proteomiki chemicznej oparta na sondach fotopowinowactwa obejmuje kilka kluczowych etapów, w tym projektowanie sondy, syntezę, ocenę aktywności, znakowanie, wzbogacanie białek i analizę danych. Niekowalencyjne leki małocząsteczkowe, takie jak związki syntetyczne, ekstrakty ziołowe, produkty naturalne i metabolity, można modyfikować w sondy fotopowinowactwa. Gdy sondy te zwiążą się ze swoimi celami w komórkach, tworzą stabilne interakcje kowalencyjne, umożliwiając selektywne wzbogacanie i identyfikację białek docelowych o niskiej liczebności.
Nasze zalety
1. Doskonałość techniczna: doświadczony zespół, najwyższej klasy publikacje w czasopismach i wiarygodne usługi branżowe.
2. Podstawowa technologia patentowa: ekskluzywne patenty i zaawansowany sprzęt do wspierania wczesnego opracowywania leków.
3. Kompleksowa usługa: obejmująca projektowanie sond, syntezę, odkrywanie celów, analizę bioinformatyczną i terminową informację zwrotną o postępie w celu zadowolenia klienta.
4. Rygorystyczne zarządzanie jakością: Certyfikat ISO9001 zapewnia wiarygodne i autentyczne raporty.
Nasz serwis
| Projekt | Identyfikacja bezpośrednich celów dla niekowalencyjnych leków drobnocząsteczkowych |
| Próbka | Rekombinowane białko, lizat komórkowy, żywe komórki, chora tkanka, krew, bakterie, tkanka roślinna |
| Platforma sprzętowa | Bezkontaktowy ultradźwiękowy rozdrabniacz komorowy, system obrazowania ChemiDoc MP, spektrometr mas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
| Czas trwania projektu | 4-8 tygodni |
| Elementy dostarczane | Raport z projektu (w tym procedury eksperymentalne, wykresy analizy danych, wyniki analiz bioinformatycznych) |
Studium przypadku
Podczas procesu przeszukiwania leku, z wykorzystaniem technologii przeszukiwania żywotności komórek, stwierdzono, że związek A wykazuje znaczące działanie hamujące na komórki docelowe. Aby dokładniej zidentyfikować docelowe białka na poziomie molekularnym, rozszyfrować jego mechanizm działania i zbadać potencjalne nowe cele, nasza firma zaprojektowała i zsyntetyzowała fotoreaktywną sondę Probe A (zawierającą grupy fotoreaktywne i bioortogonalne) w oparciu o strukturę i charakterystykę aktywności związku A. Wykorzystując platformę technologii proteomiki chemicznej, zastosowaliśmy techniki znakowania fluorescencyjnego i spektrometrii masowej do identyfikacji białek docelowych w liniach komórkowych istotnych dla danej aktywności. W połączeniu z metodami analizy bioinformatycznej zagłębiliśmy się w mechanizm działania związku A i powiązanych z nim nowych białek docelowych.
Na podstawie analizy żelu fluorescencyjnego w eksperymencie ze znakowaniem, Sonda A skutecznie znakuje białka, a sygnał znakowania może w znacznym stopniu konkurować ze związkiem A. Oznacza to, że Sonda A ma podobne pokrycie docelowe jak związek A, co czyni ją odpowiednim narzędziem do sond chemicznych późniejsze odkrycie celu.
Wykres Volcano ilustruje wyniki eksperymentu Sonda A vs DMSO (bezpośrednia), w którym 114 białek (zaznaczonych na czerwono na górnym wykresie) zostało znacząco wzbogaconych przez Sonda A. W sondzie A vs (A+Sonda A) (Konkurencja) W eksperymencie 38 białek (zaznaczonych na czerwono na dolnym wykresie) znakowano za pomocą Sondy A i znacząco konkurowały one z oryginalnym związkiem A. Te dwa eksperymenty wygenerowały 32 białka z dużą pewnością wiązania z związek A (n = 3, stosunek ≥ 2, wartość p ≤ 0,05). Analiza GO Biological Pathway 32 białek o wysokim stopniu pewności wiązania ze związkiem A ujawniła znaczne wzbogacenie szlaków sygnałowych, takich jak wypływ fosfolipidów, negatywna regulacja aktywności lipazy i regulacja transportu steroli, zgodnie z fenotypem.
