Identyfikacja regionów interakcji dla interakcji białko-białko i przeciwciało-antygen

Dogłębne zrozumienie struktury białek i ich interakcji ma kluczowe znaczenie dla ujawnienia ich funkcji biologicznych. Jednak ze względu na złożoność i różnorodność w dziedzinie białek, pojedyncza technika badawcza często utrudnia pełne wyjaśnienie ich tajemnic. Dlatego biolodzy zazwyczaj przyjmują strategię integrowania wielu podejść technicznych w celu wspólnego badania trójwymiarowej struktury i dynamicznych zachowań interakcji białek. Wśród nich technologia sieciowanej spektrometrii mas (XL-MS) ze względu na swoje unikalne zalety wykazała wyjątkową wartość badawczą w tej dziedzinie. Może precyzyjnie dostarczać informacji o odległości przestrzennej pomiędzy resztami aminokwasów i ma wiele zalet, takich jak wymaganie małych ilości próbek, niskie wymagania środowiskowe dla białek, brak ograniczeń masy cząsteczkowej, łatwość sieciowania in situ, prostota obsługi i uzyskiwanie dużej ilość informacji.

Po ponad dwudziestu latach ciągłego rozwoju i innowacji technologicznych, technologia XL-MS poczyniła znaczne postępy w projektowaniu eksperymentów, analizie danych i innych aspektach, stając się obecnie niezbędnym podstawowym narzędziem w zintegrowanej biologii strukturalnej. Technologia XL-MS stosowana przez Coalesce Bio wykorzystuje różne kombinacje chemicznych środków sieciujących. Środki te reagują z różnymi resztami aminokwasowymi, takimi jak grupy karboksylowe, aminowe i sulfhydrylowe, umożliwiając precyzyjne sieciowanie interakcji białko-białko i przeciwciało-antygen, dokładnie rozdzielając w ten sposób obszary interakcji.

Platforma Techniczna

Typowe chemiczne środki sieciujące (jak pokazano na rysunku poniżej) mogą kowalencyjnie sieciować określone reszty aminokwasowe po dodaniu do układów białkowych. Po trawieniu enzymatycznym powstają usieciowane peptydy reprezentujące regiony interakcji między białkami. Dzięki identyfikacji za pomocą spektrometrii mas i precyzyjnej analizie sekwencji peptydów można uzyskać informacje o obszarach interakcji.

Środek sieciujący amino-tiol BS3

Aminosulfhydrylowy środek sieciujący EMCS

Nasze zalety

1. Doskonałość zawodowa: Nasz zespół może poszczycić się bogatym doświadczeniem i publikacjami w najlepszych czasopismach, oferując wiodące w branży usługi techniczne.
2. Efektywne rozwiązania: Stosujemy niezawodne metody, aby szybko realizować projekty, zapewniając bezproblemowe rozwiązania.
3. Rygorystyczne zarządzanie jakością: Stosując się do norm ISO 9001, nasz dojrzały system zarządzania jakością zapewnia autentyczność i wiarygodność naszych raportów.
4. Systematyczne zarządzanie projektami: Od konsultacji po dostarczenie raportu, zapewniamy terminowe aktualizacje postępów, zapewniając satysfakcję klienta i sprawną realizację projektu.
5. Najnowocześniejszy sprzęt: Wyposażoni w zaawansowane spektrometry mas, takie jak Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 i Bruker timsTOF, ułatwiamy przełomowe badania.

Nasz serwis

Projekt	Identyfikacja regionów interakcji dla interakcji białko-białko i przeciwciało-antygen
Próbka	Czyste białko, kompleks przeciwciało-antygen
Platforma sprzętowa	Bezkontaktowy ultradźwiękowy rozdrabniacz komorowy, system obrazowania ChemiDoc MP, spektrometr mas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2
Czas trwania projektu	2-4 tygodnie
Elementy dostarczane	Raport projektu (w tym procedury eksperymentalne, wykresy analizy danych, wyniki analiz bioinformatycznych)
Cena	Kliknij, aby skonsultować się

Studium przypadku

W tym przypadku białko surowicy BSA zostało usieciowane przy użyciu reaktywnego z aminą środka sieciującego BS3 w celu skonstruowania dimerycznej struktury białka surowicy BSA. Analiza spektrometrii mas struktury dimerycznej pozwoliła zidentyfikować usieciowane segmenty peptydowe, które odpowiadały istniejącym danym literaturowym, potwierdzając w ten sposób dokładność i wiarygodność eksperymentu.