Platforma technologiczna TurboID obejmuje fuzję zmutowanej ligazy biotynowej z C-końcem docelowego białka. W komórkach ulegających nadekspresji dodatek biotyny szybko biotynyluje oddziałujące białka w ciągu 10 minut, nawet w temperaturze pokojowej, przy minimalnym hałasie tła. Ta wszechstronność sprawia, że TurboID nadaje się do szerokiej gamy systemów biologicznych, w tym komórek ssaków, roślin i owadów. Następnie białka znakowane biotyną izoluje się, wzbogaca i trawi w celu wytworzenia próbek peptydów do spektrometrii masowej, co umożliwia szczegółową analizę interakcji i funkcji białek.
01. Wysoka wydajność katalityczna
02. Nie uszkadza żywych komórek
03. Wysoka wydajność i stabilność biotynylacji
04.Efektywna biotynylacja w temperaturze pokojowej (25°C)
Projekt | Identyfikacja sieci interakcji białko-białko w komórkach |
Próbka | Lizat komórkowy, żywe komórki |
Platforma sprzętowa | Bezkontaktowy ultradźwiękowy rozdrabniacz komorowy, system obrazowania ChemiDoc MP, spektrometr mas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
Czas trwania projektu | 4-6 tygodni |
Elementy dostarczane | Raport z projektu (w tym procedury eksperymentalne, wykresy analizy danych, wyniki analiz bioinformatycznych) |
Cena | Kliknij, aby skonsultować się |
Cel projektu:Analizuj zmiany w interakcji białka docelowego (POI) w komórkach przed i po leczeniu lekiem.
Rozwiązanie:Wykorzystaj strategię znakowania bliskości, konstruując wektor ekspresyjny POI-TurboID, nadeksprymując go w komórkach i tworząc grupy leczone lekiem i grupy kontrolne do biotynylacji. Wzbogać interaktom białkowy w komórkach, a następnie przeprowadź jakościową i ilościową analizę różnic w biotynylowanych białkach, aby scharakteryzować zmiany w interaktomie POI.
Wizualizacja danych: