Produkty
Analiza modyfikacji potranslacyjnych białek (PTM) na podstawie sond chemicznych
Oprócz tradycyjnych strategii wzbogacania przeciwciał, do wzbogacania i identyfikacji modyfikacji potranslacyjnych (PTM) w białkach stopniowo stosowano techniki znakowania chemicznego, enzymatycznego i metabolicznego. Podstawowa zasada obejmuje zastosowanie reakcji chemicznej lub katalizy enzymatycznej w celu kowalencyjnego przyłączenia określonych sond molekularnych do docelowych modyfikacji lub modyfikacji reszt, a następnie analizę proteomiczną. To wyłaniające się podejście w chemoproteomice staje się ważne w badaniu modyfikacji białek o niskiej liczebności, takich jak palmitoilacja, mirystoilacja i glikozylacja. W szczególności ma tę zaletę, że można go zastosować w żywych komórkach, omijając w ten sposób potencjalne zakłócenia, takie jak utlenianie wynikające ze stresu komórkowego.
Serwis Techniczny
1. Modyfikacje potranslacyjne cysteiny
Cysteina (Cys) jest powszechnie występującym aminokwasem zawierającym siarkę w białkach, a jej grupa tiolowa odgrywa kluczową rolę w regulowaniu molekularnej homeostazy redoks, wpływając na reakcje enzymatyczne, interakcje białko-białko i stabilność białka poprzez różnorodne procesy modyfikacji potranslacyjnych. Typowe modyfikacje potranslacyjne cysteiny obejmują palmitoilację, nitrozylację, sulfenylację i sulfonowanie. W firmie Colosseum Biosciences opracowano uniwersalne sondy lub strategie znakowania metabolicznego ukierunkowane na reszty cysteinowe oraz ustanowiono odpowiednie platformy proteomiki chemicznej do identyfikacji modyfikacji potranslacyjnych. Platforma ta dokładnie identyfikuje białka docelowe i miejsca modyfikacji modyfikacji potranslacyjnych.
2. Modyfikacje potranslacyjne lizyny
Lizyna (Lys) to jeden z aminokwasów z najbardziej zróżnicowanymi modyfikacjami potranslacyjnymi (PTM) w proteomie. Odwracalne modyfikacje potranslacyjne lizyny (Lys-PTM) to powszechne procesy biochemiczne, które odgrywają niezastąpioną rolę w regulacji wielu krytycznych funkcji komórkowych. Modyfikacje potranslacyjne lizyny obejmują acetylację, sukcynylację, propionylację, butyrylację, krotonylację, malonylację i laktylację. Firma Colosseum Biosciences opracowała platformę technologiczną proteomiki chemicznej opartą na sondach chemicznych do modyfikacji potranslacyjnych lizyny, która dokładnie identyfikuje docelowe białka i miejsca modyfikacji.
3. Modyfikacje potranslacyjne seryny/treoniny
Typowe modyfikacje potranslacyjne seryny (Ser) i treoniny (Thr) obejmują głównie fosforylację, O-glikozylację itp. Modyfikacje te znacząco wpływają na stan aktywności białek i ich interakcje z innymi cząsteczkami, odgrywając ważną rolę w różnych kluczowych procesach biologicznych. Dlatego analiza tego typu modyfikacji potranslacyjnych jest ważnym tematem w badaniach funkcji białek. Colosseum Biosciences wykorzystuje materiały wzbogacające fosforylację, nienaturalne glikanowe sondy chemiczne i inne narzędzia do dokładnej identyfikacji białek docelowych i miejsc modyfikacji dla tego typu modyfikacji potranslacyjnych.
Nasze zalety
01. Wysoce profesjonalny:Obsługiwane przez grupę badawczą profesora Wang Chu z Uniwersytetu w Pekinie, głównego naukowca naszej firmy.
02. Platforma kompleksowa:Obejmuje cały proces, od projektowania sondy, syntezy sondy, odkrywania celu, po analizę bioinformatyczną.
03. Nie ma potrzeby stosowania przeciwciał:Specyficzna modyfikacja sondy chemicznej,Fizjologiczny
04. Środowisko:Można stosować zarówno w lizatach, jak i w żywych komórkach.
05. Bogate doświadczenie:Zgromadzona wiedza specjalistyczna w zakresie ponad 10 różnych typów PTM
06. Platforma o wysokiej wydajności:Trapka termosorbitowa Thermo Fisher Exploris 480,Thermo Fisher Q Exactive HF-X,Bruker TimsTOF
Studium przypadku
Itakonacja odnosi się do procesu, w którym itakonian kowalencyjnie wiąże się z określonymi miejscami na białkach podczas modyfikacji potranslacyjnej. Modyfikacja ta może zmienić strukturę i funkcję białka, wpływając na jego rolę w komórce. Na przykład itakonacja może regulować aktywność enzymu, stabilność lub interakcje z innymi cząsteczkami. Ponieważ itakonian jest związkiem pośrednim w cyklu kwasu trikarboksylowego, modyfikacja ta jest ściśle powiązana ze stanem metabolicznym komórki. Badania wykazały, że itakonacja odgrywa znaczącą rolę w patologii niektórych chorób, a zrozumienie tego mechanizmu modyfikacji może pomóc w opracowaniu nowych strategii terapeutycznych.
Komórki znakowane metabolicznie sondami ITalk na poziomie żywych komórek poddano lizie, po czym przeprowadzono reakcję kliknięcia, wzbogacenie, trawienie enzymatyczne i inne etapy w celu określenia konkretnego miejsca zakwaszenia itakonowego.
