Ilościowa analiza obłożenia i selektywności kowalencyjnych celów leków drobnocząsteczkowych

Leki kowalencyjne działają przede wszystkim poprzez tworzenie wiązań kowalencyjnych z określonymi resztami aminokwasowymi na białkach docelowych, w tym między innymi cysteinie, lizynie, serynie. Aspiryna była pierwszą odkrytą kowalencyjną cząsteczką leku, a w produktach naturalnych, takich jak artemizyna, istnieje kilka reprezentatywnych leków kowalencyjnych o działaniu przeciwzapalnym. W ostatnich latach kowalencyjne leki celowane cieszą się dużym zainteresowaniem firm farmaceutycznych. Obecnie co najmniej sześć leków kowalencyjnych ukierunkowanych na kinazy zostało zatwierdzonych przez FDA, takich jak ibrutynib ukierunkowany na kinazę BTK.

Skutecznym podejściem do odkrywania kowalencyjnych celów leku w komórkach lub tkankach jest chemiczna modyfikacja aktywnych małych cząsteczek poprzez wprowadzenie grup reporterowych (takich jak biotyna, grupy bioortogonalne itp.). Zachowując pierwotną aktywność małej cząsteczki, modyfikacja ta pozwala na bezpośrednie wychwytywanie oddziałujących z nią celów białkowych w żywych komórkach lub tkankach. Następnie, poprzez wzbogacanie, trawienie enzymatyczne, identyfikację za pomocą spektrometrii mas i analizę danych, można uzyskać informacje omiczne o celach i informacje o resztach aminokwasowych dotyczące działania małych cząsteczek. Jednak w zastosowaniach praktycznych wiele aktywnych cząsteczek nie daje się łatwo zmodyfikować chemicznie lub produkty powstałe w wyniku reakcji z resztami aminokwasów są niestabilne, co czyni je nieodpowiednimi do wykrywania spektrometrią mas. W odpowiedzi na te wyzwania SciCorpBio oferuje skuteczne rozwiązanie – konkurencyjną identyfikację lokalizacji.

Platforma Techniczna

Nasza platforma technologiczna skupia się wokół uniwersalnej sondy chemicznej. Kiedy aktywna mała cząsteczka reaguje z resztą aminokwasu i zajmuje miejsce wiązania, ta uniwersalna sonda chemiczna generuje znaczącą różnicę sygnału dla tego miejsca wiązania w porównaniu ze ślepymi próbkami kontrolnymi. Wykrywając te różnice w sygnałach znakowania, możemy dokładnie uzyskać informacje o białkach docelowych i resztach aminokwasowych aktywnej cząsteczki, w tym zarówno białka oczekiwane (docelowe), jak i potencjalne białka poza celem. Ta platforma technologiczna zapewnia solidne wsparcie w zakresie docelowego odkrywania leków kowalencyjnych i badań nad mechanizmami działania leków.

Nasze zalety

1. Doskonałość techniczna: doświadczony zespół, najwyższej klasy publikacje w czasopismach i wiarygodne usługi branżowe.
2. Podstawowa technologia patentowa: ekskluzywne patenty i zaawansowany sprzęt do wspierania wczesnego opracowywania leków.
3. Kompleksowa usługa: obejmująca projektowanie sond, syntezę, odkrywanie celów, analizę bioinformatyczną i terminową informację zwrotną o postępie w celu zadowolenia klienta.
4. Rygorystyczne zarządzanie jakością: Certyfikat ISO9001 zapewnia wiarygodne i autentyczne raporty.

Nasz serwis

Projekt	Ilościowa analiza obłożenia i selektywności kowalencyjnych celów leków drobnocząsteczkowych
Próbka	Czyste białko, lizat komórkowy, żywe komórki, chora tkanka, krew, bakterie, tkanka roślinna
Platforma sprzętowa	Bezkontaktowy ultradźwiękowy rozdrabniacz komorowy, system obrazowania ChemiDoc MP, spektrometr mas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2
Czas trwania projektu	2-4 tygodnie
Elementy dostarczane	Raport projektu (w tym procedury eksperymentalne, wykresy analizy danych, wyniki analiz bioinformatycznych)
Cena	Kliknij, aby skonsultować się

Studium przypadku

AMG510, opracowany przez firmę Amgen, to pierwszy na świecie lek ukierunkowany na nowotwory z mutacją KRAS-G12C. Celem tego projektu jest weryfikacja docelowej specyficzności i selektywności w odpowiednich zmutowanych komórkach. Korzystając z platformy DIA-ABPP firmy Chomix, kompleksowo zbadaliśmy kowalencyjne cele AMG510 w komórkach aż do poziomu reszt aminokwasowych.
Dane eksperymentalne pokazują, że w czterech powtarzanych eksperymentach na komórkach NCI-H358 systematycznie analizowano łącznie 16 992 reszt cysteiny z 5768 białek. Pod wpływem 1 μM AMG510 miejsce KRAS_C12 wykazywało znaczące zmiany, podczas gdy KRAS_C80 pozostało niezmienione, dostarczając mocnych dowodów na wysoką specyficzność AMG510 w stosunku do miejsca zmutowanego KRAS-G12C (oznaczonego gwiazdką wskazującą docelowe miejsce reszty cysteiny).