Leki kowalencyjne działają głównie poprzez tworzenie wiązań kowalencyjnych z określonymi resztami aminokwasów na białkach docelowych, takich jak cysteina, lizyna i seryna. Aspiryna jest jedną z najwcześniej znanych kowalencyjnych cząsteczek leków. Dodatkowo wiele produktów naturalnych wykazuje właściwości kowalencyjne, np. oridonina, która ma bioaktywność przeciwzapalną. W ostatnich latach kowalencyjne leki celowane cieszą się coraz większym zainteresowaniem firm farmaceutycznych. Do chwili obecnej FDA zatwierdziła co najmniej sześć leków kowalencyjnych ukierunkowanych na kinazy, w tym ibrutynib, który jest ukierunkowany na kinazę BTK.
W odkrywaniu kowalencyjnych celów leku w komórkach lub tkankach skuteczną strategią jest chemiczna modyfikacja aktywnych małych cząsteczek poprzez wprowadzenie grup reporterowych (takich jak biotyna lub grupy bioortogonalne). Modyfikacja ta, zachowując pierwotną aktywność cząsteczki, pozwala na bezpośrednie wychwytywanie oddziałujących celów białkowych w żywych komórkach lub tkankach. Jednakże wiele aktywnych cząsteczek trudno jest zmodyfikować chemicznie, a produkty powstałe w wyniku reakcji z resztami aminokwasów są niestabilne, co czyni je nieodpowiednimi do wykrywania za pomocą spektrometrii mas. Aby pokonać te wyzwania, ChomiX oferuje rozwiązanie: identyfikację miejsca modyfikacji za pomocą konkurencyjnego znakowania sondami specyficznymi dla aminokwasów.
Nasza platforma technologiczna skupia się wokół uniwersalnej sondy chemicznej specyficznej dla aminokwasów. Kiedy aktywna mała cząsteczka reaguje z resztą aminokwasu i zajmuje miejsce wiązania, ta uniwersalna sonda chemiczna generuje znaczącą różnicę sygnału dla tego miejsca wiązania w porównaniu ze ślepymi próbkami kontrolnymi. Wykrywając te różnice w sygnałach znakowania, możemy dokładnie uzyskać informacje o białkach docelowych i resztach aminokwasowych aktywnej cząsteczki, w tym zarówno białka oczekiwane (docelowe), jak i potencjalne białka poza celem. Ta platforma technologiczna zapewnia solidne wsparcie w zakresie docelowego odkrywania leków kowalencyjnych i badań nad mechanizmami działania leków.
1. Doskonałość techniczna: doświadczony zespół, najwyższej klasy publikacje w czasopismach i wiarygodne usługi branżowe.
2. Podstawowa technologia patentowa: ekskluzywne patenty i zaawansowany sprzęt do wspierania wczesnego opracowywania leków.
3. Kompleksowa usługa: obejmująca projektowanie sond, syntezę, odkrywanie celów, analizę bioinformatyczną i terminową informację zwrotną o postępie w celu zadowolenia klienta.
4. Rygorystyczne zarządzanie jakością: Certyfikat ISO9001 zapewnia wiarygodne i autentyczne raporty.
Projekt | Ilościowa analiza obłożenia i selektywności kowalencyjnych celów leków drobnocząsteczkowych |
Próbka | Czyste białko, lizat komórkowy, żywe komórki, chora tkanka, krew, bakterie, tkanka roślinna |
Platforma sprzętowa | Bezkontaktowy ultradźwiękowy rozdrabniacz komorowy, system obrazowania ChemiDoc MP, spektrometr mas Orbitrap Fusion Lumos Tribrid/Orbitrap Exploris 480/Q Exactive HF-X/timsTOF Pro 2 |
Czas trwania projektu | 2-4 tygodnie |
Elementy dostarczane | Raport z projektu (w tym procedury eksperymentalne, wykresy analizy danych, wyniki analiz bioinformatycznych) |
Cena | Kliknij, aby skonsultować się |
AMG510, opracowany przez firmę Amgen, to pierwszy na świecie lek ukierunkowany na nowotwory z mutacją KRAS-G12C. Celem tego projektu jest weryfikacja docelowej specyficzności i selektywności w odpowiednich zmutowanych komórkach. Korzystając z platformy DIA-ABPP firmy Chomix, kompleksowo zbadaliśmy kowalencyjne cele AMG510 w komórkach aż do poziomu reszt aminokwasowych.
Dane eksperymentalne pokazują, że w czterech powtarzanych eksperymentach na komórkach NCI-H358 systematycznie analizowano łącznie 16 992 reszt cysteiny z 5768 białek. Pod wpływem 1 μM AMG510 miejsce KRAS_C12 wykazywało znaczące zmiany, podczas gdy KRAS_C80 pozostało niezmienione, dostarczając mocnych dowodów na wysoką specyficzność AMG510 w stosunku do miejsca zmutowanego KRAS-G12C (oznaczonego gwiazdką wskazującą docelowe miejsce reszty cysteiny).