Ukierunkowana analiza proteomiczna

Badania proteomiczne można podzielić na dwie gałęzie w zależności od tego, czy skupiają się na określonej klasie białek: proteomika celowana i proteomika nieukierunkowana. Proteomika celowana kładzie nacisk na precyzyjne i dogłębne badanie wcześniej zdefiniowanych białek docelowych, podczas gdy proteomika nieukierunkowana ma na celu kompleksowe wykrycie wszystkich białek w próbce w celu odkrycia nieznanych typów białek i potencjalnych biomarkerów i dlatego często nazywa się ją proteomiką odkrywczą . Rozwój nieukierunkowanej proteomiki poprzedza rozwój proteomiki celowanej i jest szczególnie odpowiedni do wstępnego badania biomarkerów.

Kiedy w nieukierunkowanych badaniach proteomicznych zostaną zidentyfikowane określone białka lub wartościowe biomarkery, badacze będą mogli w dalszym ciągu wykorzystywać technologię ukierunkowanej proteomiki do walidacji i szeroko zakrojonych badań tych białek docelowych na większej populacji próbek. W porównaniu z proteomiką nieukierunkowaną, proteomika celowana charakteryzuje się doskonałą wydajnością pod względem dokładności, czułości i odtwarzalności, zapewniając bardziej precyzyjne i niezawodne narzędzia do dogłębnych badań proteomicznych.

Platforma Techniczna

Świadczymy ukierunkowane i nieukierunkowane usługi analizy proteomicznej w oparciu o technologię spektrometrii mas, mając na celu zapewnienie naszym klientom kompleksowego i dogłębnego wsparcia w badaniach białek.

W dziedzinie proteomiki nieukierunkowanej Chomix oferuje różne metody, w tym proteomikę oznaczania ilościowego bez znaczników, proteomikę oznaczania ilościowego opartą na SILAC i proteomikę oznaczania ilościowego opartą na TMT/IBT, wszystkie mające na celu systematyczne odkrywanie i oznaczanie ilościowe jak największej liczby składników białkowych w próbce .

W dziedzinie ukierunkowanej proteomiki Chomix wykorzystuje monitorowanie reakcji równoległych (PRM) jako podstawową technologię. PRM może z czułością wykrywać fragmenty peptydów o niskiej liczebności, skutecznie eliminować zakłócenia białek tła i osiągać wysoce precyzyjną ocenę ilościową, skutecznie weryfikując i potwierdzając biologicznie zróżnicowane białka ujawnione przez nieukierunkowaną proteomikę.

W porównaniu z tradycyjnymi metodami ukierunkowanego oznaczania ilościowego białek, takimi jak Western blot, metody ukierunkowanej proteomiki nie wymagają opracowywania przeciwciał i umożliwiają jednoczesne wykrywanie wielu białek, z opcją bezwzględnej oceny ilościowej, jeśli to konieczne.

Nasze zalety

1. Doskonałość zawodowa: Nasz zespół może poszczycić się bogatym doświadczeniem i publikacjami w najlepszych czasopismach, oferując wiodące w branży usługi techniczne.

2. Efektywne rozwiązania: Stosujemy niezawodne metody, aby szybko realizować projekty, zapewniając bezproblemowe rozwiązania.

3. Rygorystyczne zarządzanie jakością: Stosując się do norm ISO 9001, nasz dojrzały system zarządzania jakością zapewnia autentyczność i wiarygodność naszych raportów.

4. Systematyczne zarządzanie projektami: Od konsultacji po dostarczenie raportu, zapewniamy terminowe aktualizacje postępów, zapewniając satysfakcję klienta i sprawną realizację projektu.

5. Najnowocześniejszy sprzęt: Wyposażoni w zaawansowane spektrometry mas, takie jak Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 i Bruker timsTOF, ułatwiamy przełomowe badania.

Nasz serwis

Projekt	Ukierunkowany/nieukierunkowany zestaw do ilościowej analizy proteomicznej
Próbka	Tkanka, osady komórkowe, lizaty
Platforma sprzętowa	VanquishNeo UPLC w połączeniu ze spektrometrem mas Orbitrap Exploris 480 (Thermo Fisher Scientific) EASY-nLC1200 UPLC w połączeniu ze spektrometrem mas Q Exactive HF-X (Thermo Fisher Scientific)
Czas trwania projektu	4 tygodnie
Elementy dostarczane	Sprawozdanie z projektu (w tym tabele danych jakościowych i ilościowych dotyczących białek, analizy bioinformatyczne, analizy kontroli jakości itp.)
Cena	Kliknij, aby skonsultować się

Studium przypadku

Aby głębiej zagłębić się w miejsca wiązania niektórych białek docelowych w próbkach komórek traktowanych lekiem w porównaniu z grupą kontrolną, aby ujawnić mechanizmy molekularne związane z fenotypem leku, zastosowaliśmy ukierunkowane ilościowe podejście proteomiczne oparte na PRM (reakcja równoległa Monitoringu) technologii. Każdą grupę poddano obróbce w dwóch replikach biologicznych, co umożliwiło precyzyjną identyfikację i analizę ilościową zróżnicowanych miejsc wiązania.