Badania proteomiczne można podzielić na proteomiki celowane i nieukierunkowane w zależności od tego, czy badanie koncentruje się na określonych typach białek. Ukierunkowana proteomika to metoda badawcza skupiająca się na określonych białkach lub grupach białek. Selektywnie wykrywa i określa ilościowo białka docelowe, zapewniając bardzo czułe i specyficzne wyniki, które wykorzystuje się do zagłębiania się w funkcje białek i mechanizmy chorobowe. W porównaniu z proteomiką nieukierunkowaną, proteomika celowana charakteryzuje się doskonałą dokładnością, czułością i powtarzalnością, oferując bardziej precyzyjne i niezawodne narzędzia do dogłębnych badań proteomicznych.
Świadczymy ukierunkowane i nieukierunkowane usługi analizy proteomicznej w oparciu o technologię spektrometrii mas, mając na celu zapewnienie naszym klientom kompleksowego i dogłębnego wsparcia w badaniach białek.
W dziedzinie ukierunkowanej proteomiki ChomiX wykorzystuje monitorowanie reakcji równoległych (PRM) jako podstawową technologię. PRM może z czułością wykrywać fragmenty peptydów o niskiej liczebności, skutecznie eliminować zakłócenia białek tła i osiągać wysoce precyzyjną ocenę ilościową, skutecznie weryfikując i potwierdzając biologicznie zróżnicowane białka ujawnione przez nieukierunkowaną proteomikę.
W porównaniu z tradycyjnymi metodami ukierunkowanego oznaczania ilościowego białek, takimi jak Western blot, metody ukierunkowanej proteomiki nie wymagają opracowywania przeciwciał i umożliwiają jednoczesne wykrywanie wielu białek, z opcją bezwzględnej oceny ilościowej, jeśli to konieczne.
1. Doskonałość zawodowa: Nasz zespół może poszczycić się bogatym doświadczeniem i publikacjami w najlepszych czasopismach, oferując wiodące w branży usługi techniczne.
2. Efektywne rozwiązania: Stosujemy niezawodne metody, aby szybko realizować projekty, zapewniając bezproblemowe rozwiązania.
3. Rygorystyczne zarządzanie jakością: Stosując się do norm ISO 9001, nasz dojrzały system zarządzania jakością zapewnia autentyczność i wiarygodność naszych raportów.
4. Systematyczne zarządzanie projektami: Od konsultacji po dostarczenie raportu, zapewniamy terminowe aktualizacje postępów, zapewniając satysfakcję klienta i sprawną realizację projektu.
5. Najnowocześniejszy sprzęt: Wyposażoni w zaawansowane spektrometry mas, takie jak Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 i Bruker timsTOF, ułatwiamy przełomowe badania.
Projekt | Ukierunkowany/nieukierunkowany zestaw do ilościowej analizy proteomicznej |
Próbka | Tkanka, osady komórkowe, lizaty |
Platforma sprzętowa | VanquishNeo UPLC w połączeniu ze spektrometrem mas Orbitrap Exploris 480 (Thermo Fisher Scientific) EASY-nLC1200 UPLC w połączeniu ze spektrometrem mas Q Exactive HF-X (Thermo Fisher Scientific) |
Czas trwania projektu | 4 tygodnie |
Elementy dostarczane | Sprawozdanie z projektu (w tym tabele danych jakościowych i ilościowych dotyczących białek, analizy bioinformatyczne, analizy kontroli jakości itp.) |
Cena | Kliknij, aby skonsultować się |
Aby głębiej zagłębić się w miejsca wiązania niektórych białek docelowych w próbkach komórek traktowanych lekiem w porównaniu z grupą kontrolną, aby ujawnić mechanizmy molekularne związane z fenotypem leku, zastosowaliśmy ukierunkowane ilościowe podejście proteomiczne oparte na PRM (reakcja równoległa Monitoringu) technologii. Każdą grupę poddano obróbce w dwóch replikach biologicznych, co umożliwiło precyzyjną identyfikację i analizę ilościową zróżnicowanych miejsc wiązania.
Selinexor (KPT330) leczy szpiczaka mnogiego i chłoniaka rozlanego z dużych komórek B poprzez kowalencyjne wiązanie się z białkiem eksportującym jądro 1 (XPO1_C528_LVVVGACGVGK) i hamowanie jego aktywności. Traktowaliśmy komórki HCT116 różnymi stężeniami KPT330 i odkryliśmy, że stopień obłożenia miejsca XPO1_C528 przez KPT330 może osiągnąć 100% przy 1 μM. Dodatkowo określono, że EC50 dla wiązania miejsca wewnątrzkomórkowego wynosi 241 nM, co jest porównywalne z IC50 dla aktywności hamującej komórki KPT330 (150-500 nM), jak wskazano dopasowaną krzywą.