-
Identyfikacja regionów interakcji dla interakcji białko-białko i przeciwciało-antygen
Identyfikacja regionów interakcji dla interakcji białko-białko i przeciwciało-antygen Dogłębne zrozumienie struktury białek i jej interakcji ma kluczowe znaczenie dla ujawnienia ich funkcji biologicznych. Jednak ze względu na złożoność i różnorodność w dziedzinie białek, pojedyncza technika badawcza często utrudnia pełne wyjaśnienie ich tajemnic. Dlatego biolodzy zazwyczaj przyjmują strategię integrowania wielu podejść technicznych w celu wspólnego badania trójwymiarowości... -
Identyfikacja sieci interakcji białko-białko w komórkach
Identyfikacja sieci interakcji białko-białko w komórkach Interakcje białko-białko (PPI) stanowią niezbędny podstawowy element aktywności życiowej komórki, obejmujący wiele wymiarów czasowych i przestrzennych oraz głęboko wpływający na kluczowe procesy komórkowe, takie jak regulacja cyklu komórkowego, synteza i wydzielanie białek, sygnał transdukcja i metabolizm. Dlatego głębokie badanie interakcji białek odgrywa kluczową rolę w odkrywaniu tajemnic molekularnych ... -
Interakcje białko-białko
Interakcje białko-białko Interakcje białko-białko (PPI) służą jako kamień węgielny aktywności życiowej komórki, odgrywając kluczową rolę w sygnalizacji komórkowej, montażu strukturalnym i kluczowych procesach życiowych, takich jak rozpoznawanie patogenu-żywiciela. Jednak wiele procesów patologicznych jest również spowodowanych nieprawidłowościami w IPP. Dlatego interwencja i regulacja IPP wykazała ogromny potencjał jako sposób leczenia powiązanych chorób. ChomiX integruje szereg najnowocześniejszych platform technologicznych... -
Identyfikacja i analiza selektywności docelowych degradatorów białek
Identyfikacja i analiza selektywności docelowych czynników degradujących białka W ostatnich latach ukierunkowana degradacja białek (TPD) stała się innowacyjną strategią terapeutyczną mającą na celu modulowanie choroby poprzez ingerencję w ekspresję białek przy użyciu cząsteczek leku. Wśród tych podejść duże zainteresowanie wzbudziły chimery ukierunkowane na proteolizę (PROTAC). Koncepcja PROTAC została po raz pierwszy zaproponowana przez Crewsa i in. w 2001 r., a głównym założeniem było wykorzystanie endogennego proteasomu ubikwityny… -
Ilościowa analiza obłożenia i selektywności kowalencyjnych celów leków drobnocząsteczkowych
Ilościowa analiza zajętości i selektywności kowalencyjnych celów leków o małych cząsteczkach Leki kowalencyjne wywierają swoje działanie przede wszystkim poprzez tworzenie wiązań kowalencyjnych ze specyficznymi resztami aminokwasowymi na białkach docelowych, w tym między innymi cysteinie, lizynie i serynie. Aspiryna była pierwszą odkrytą kowalencyjną cząsteczką leku, a w produktach naturalnych, takich jak artemizyna, istnieje kilka reprezentatywnych leków kowalencyjnych o działaniu przeciwzapalnym. W ostatnich latach leki celowane kowalencyjnie zyskały na popularności... -
Identyfikacja kieszeni wiążących dla niekowalencyjnych leków drobnocząsteczkowych
Identyfikacja kieszeni wiążących dla niekowalencyjnych leków drobnocząsteczkowych W procesie opracowywania leków małocząsteczkowych zrozumienie sposobu wiązania między lekami a białkami docelowymi ma kluczowe znaczenie dla wyjaśnienia mechanizmów działania leku i ukierunkowania późniejszej optymalizacji strukturalnej. Techniki biologii strukturalnej, takie jak krystalografia rentgenowska, mikroskopia krioelektronowa (cryo-EM) i jądrowy rezonans magnetyczny (NMR), stały się kluczowymi narzędziami do określania modeli wiązania leków. Szczególnie wysoka rozdzielczość... -
Identyfikacja bezpośrednich celów dla niekowalencyjnych leków drobnocząsteczkowych
Identyfikacja bezpośrednich celów dla niekowalencyjnych leków drobnocząsteczkowych W dziedzinie opracowywania leków na choroby leki małocząsteczkowe niewątpliwie odgrywają kluczową rolę. Według najnowszych statystyk, spośród 854 celów związanych z białkiem ludzkim, na które ukierunkowane są leki zatwierdzone przez FDA, aż 84% odpowiada lekom małocząsteczkowym. Warto zauważyć, że tylko 665 z tych celów udało się opracować w przypadku leków małocząsteczkowych (źródło: https://www.proteinatlas.org/humanproteome/tissue/druggable). Mały m... -
Interakcje małych cząsteczek i białek
Interakcje małych cząsteczek i białek Białka, jako bezpośredni uczestnicy i wykonawcy czynności życiowych, stanowią kluczowe cele terapii chorób. Leki małocząsteczkowe (związki organiczne, zazwyczaj o masie cząsteczkowej mniejszej niż 1000 Da) wywierają skuteczne działanie terapeutyczne poprzez precyzyjną modulację aktywności białek, ich liczebności i interakcji. Powszechnie stosowane leki małocząsteczkowe obejmują produkty naturalne i ich pochodne (np. monomery ziołowe), a także leki syntetyzowane chemicznie. Upo... -
Target Discovery Platform: odkrywanie mechanizmów produktów naturalnych
Aaktywny składnikwMedycyna chińska jestseriamieszaninaSto hawedziałanie terapeutyczne lub fizjologicznetj. Leki chińskie charakteryzują się dużą różnorodnością, złożonym składem i szeroką gamą składników aktywnych,stanowiąceważnydroga do nabyciaskładniki aktywne, związki ołowiu i Makingleki.
Naszplatforma chemoproteomicznawyróżnia sięodkryćingcele białkowedla nprodukty naturalne w medycynie chińskiej. To genialnieprzekształcaćto teprodukty naturalne w wielofunkcyjne sondy chemiczne, odzwierciedlając ich biografiędziałalność.Sondy te, zastosowane w żywych komórkach lub chorych tkankach, mogąbezpośrednio uchwycićnaturalne białka wiążące produkty. Za pomocą bioortogonalnych reakcji sprzęgania, precyzyjnie izolujemy i wzbogacamy te białka docelowe. Wykorzystującwidmo masowe o wysokiej rozdzielczościmetry, osiągamy najwyższą dokładność aż do kieszeni wiążących. To nas wyposażabardziej wszechstronne i dokładne informacje, gotowy do odsłonięciathezawiłymechanizmleżące u podstawskładniki aktywne w medycynie chińskiej.
-
Identyfikacja niekowalencyjnych kieszeni wiążących małe cząsteczki w komórkach
Identyfikacja niekowalencyjnych kieszeni wiążących małe cząsteczki w platformach komórkowych. Cechy techniczne platformy komórkowej Określenie sposobu wiązania między lekami małocząsteczkowymi a ich białkami docelowymi ma kluczowe znaczenie dla badań i rozwoju leków. Kompleksowa analiza tych interakcji, zarówno na poziomie strukturalnym, jak i fizykochemicznym, mogłaby znacząco pogłębić naszą wiedzę na temat funkcji białek i ułatwić projektowanie i optymalizację leków. Techniki biologii strukturalnej, w tym promieniowanie rentgenowskie, mikroskopia krioelektronowa… -
Profilowanie całego proteomu dla leków o ukierunkowanej degradacji białek (TPD).
Lek Chimery ukierunkowane na proteolizę (PROTAC) to dwufunkcyjna cząsteczka, która może wiązać się z docelowym białkiem i rekrutować ligazę ubikwitynową E3 do degradacji. Dlatego nowe metody, takie jak PROTAC i klej molekularny, mogą w sposób niezamierzony zmieniać liczebność endogennych białek, co zapewnia nową metodę terapeutyczną w przypadku docelowych białek, zwłaszcza białek niepodlegających lekowi. Kompleksowe ilościowe określenie obfitości białek docelowych i poza nimi jest jednym ze standardowych eksperymentów w ramach prac badawczo-rozwojowych nad lekami TPD.
-
Identyfikacja celów białkowych metodą proteomiki różnicowej
Identyfikacja celów białkowych za pomocą platformy proteomiki różnicowej. Właściwości techniczne Proteomika różnicowa bada zmiany proteomu w różnych stanach fizjologicznych lub patologicznych, takich jak leczenie farmakologiczne lub regulacja genów, poprzez porównanie dwóch lub więcej próbek. Podejście to rzuca światło na ważne procesy życiowe lub główne choroby, umożliwiając określenie kluczowych różnych białek, które są uważane za markery analizy jakościowej i funkcjonalnej. Można zidentyfikować tysiące białek...
