-
Identyfikacja regionów interakcji białko-białko, przeciwciało-antygen: sieciowanie chemiczne
Identyfikacja regionów interakcji białko-białko, przeciwciało-antygen: Chemiczne sieciowanie Zrozumienie struktury i interakcji białek jest niezbędne do odkrycia ich funkcji biologicznych. Ze względu na złożoność proteomu żadna pojedyncza technika nie jest w stanie w pełni ujawnić tych aspektów. Biolodzy często stosują kombinację metod, przy czym sieciowana spektrometria mas (XL-MS) wyróżnia się wyjątkowymi zaletami. XL-MS zapewnia precyzyjną informację o odległości przestrzennej pomiędzy re... -
Identyfikacja interakcji białko-białko w żywych komórkach: znakowanie zbliżeniowe
Identyfikacja interakcji białko-białko w żywych komórkach: platforma techniczna znakowania zbliżeniowego Platforma technologiczna TurboID polega na fuzji zmutowanej ligazy biotynowej z C-końcem docelowego białka. W komórkach ulegających nadekspresji dodatek biotyny szybko biotynyluje oddziałujące białka w ciągu 10 minut, nawet w temperaturze pokojowej, przy minimalnym hałasie tła. Ta wszechstronność sprawia, że TurboID nadaje się do szerokiej gamy systemów biologicznych, w tym komórek ssaków,... -
Interakcje białko-białko
Interakcje białko-białko Interakcje białko-białko (PPI) służą jako kamień węgielny aktywności życiowej komórki, odgrywając kluczową rolę w sygnalizacji komórkowej, montażu strukturalnym i kluczowych procesach życiowych, takich jak rozpoznawanie patogenu-żywiciela. Jednak wiele procesów patologicznych jest również spowodowanych nieprawidłowościami w IPP. Dlatego interwencja i regulacja IPP wykazała ogromny potencjał w leczeniu powiązanych chorób. ChomiX integruje szereg najnowocześniejszych platform technologicznych... -
Identyfikacja celu i analiza selektywności docelowych degradatorów białek
Identyfikacja celu i analiza selektywności ukierunkowanych degradatorów białek Lek PROTAC (Proteoliza ukierunkowana na chimery) to dwufunkcyjna cząsteczka, która może wiązać się z docelowym białkiem i rekrutować ligazę E3 ubikwityny do degradacji. Dlatego nowe metody, takie jak PROTAC i klej molekularny, mogą w sposób niezamierzony zmieniać liczebność białek endogennych, co zapewnia nową metodę terapeutyczną w przypadku docelowych białek, zwłaszcza białek, których nie można leczyć. Kompleksowo... -
Ilościowa analiza obłożenia i selektywności kowalencyjnych celów leków drobnocząsteczkowych
Ilościowa analiza zajętości i selektywności kowalencyjnych celów leków o małych cząsteczkach Leki kowalencyjne działają głównie poprzez tworzenie wiązań kowalencyjnych z określonymi resztami aminokwasowymi na białkach docelowych, takich jak cysteina, lizyna i seryna. Aspiryna jest jedną z najwcześniej znanych kowalencyjnych cząsteczek leków. Dodatkowo wiele produktów naturalnych wykazuje właściwości kowalencyjne, np. oridonina, która ma bioaktywność przeciwzapalną. W ostatnich latach leki celowane kowalencyjnie zyskują coraz większą popularność... -
Identyfikacja miejsca wiązania niekowalencyjnych leków małocząsteczkowych w żywych komórkach
Identyfikacja miejsca wiązania niekowalencyjnych leków małocząsteczkowych w żywych komórkach Na poziomie komórkowym bezpośrednie badanie sposobu działania leków i białek docelowych może pomóc uniknąć zmian w strukturze białek podczas oczyszczania i fałszywie dodatnich wyników, które mogą wynikać ze sztucznych systemy buforowe i wysokie stężenia leku i białka. Platforma Techniczna ChomiX świadczy usługi proteomiki chemicznej z wykorzystaniem biologicznie aktywnych fotoreaktywnych sond chemicznych (z... -
Identyfikacja niekowalencyjnych celów leków małocząsteczkowych w oparciu o sondy fotopowinowactwa
Identyfikacja niekowalencyjnych celów leków małocząsteczkowych na podstawie sond fotopowinowactwa Platforma techniczna Platforma identyfikacji celów proteomiki chemicznej oparta na sondach fotopowinowactwa obejmuje kilka kluczowych etapów, w tym projektowanie sondy, syntezę, ocenę aktywności, znakowanie, wzbogacanie białek i analizę danych. Niekowalencyjne leki małocząsteczkowe, takie jak związki syntetyczne, ekstrakty ziołowe, produkty naturalne i metabolity, można modyfikować w sondy fotopowinowactwa. NA... -
Interakcje małych cząsteczek i białek
Interakcje małych cząsteczek i białek Białka, jako bezpośredni uczestnicy i wykonawcy czynności życiowych, stanowią kluczowe cele terapii chorób. Leki małocząsteczkowe (związki organiczne, zazwyczaj o masie cząsteczkowej mniejszej niż 1000 Da) wywierają skuteczne działanie terapeutyczne poprzez precyzyjną modulację aktywności białek, ich liczebności i interakcji. Powszechnie stosowane leki małocząsteczkowe obejmują produkty naturalne i ich pochodne (np. monomery ziołowe), a także leki syntetyzowane chemicznie. Upo... -
Target Discovery Platform: odkrywanie mechanizmów produktów naturalnych
Aaktywny składnikwMedycyna chińska jestseriamieszaninaSto hawedziałanie terapeutyczne lub fizjologicznetj. Leki chińskie charakteryzują się dużą różnorodnością, złożonym składem i szeroką gamą składników aktywnych,stanowiąceważnydroga do nabyciaskładniki aktywne, związki ołowiu i Makingleki.
Naszplatforma chemoproteomicznawyróżnia sięodkryćingcele białkowedla nprodukty naturalne w medycynie chińskiej. To genialnieprzekształcaćto teprodukty naturalne w wielofunkcyjne sondy chemiczne, odzwierciedlając ich biografiędziałalność.Sondy te, zastosowane w żywych komórkach lub chorych tkankach, mogąbezpośrednio uchwycićnaturalne białka wiążące produkty. Za pomocą bioortogonalnych reakcji sprzęgania, precyzyjnie izolujemy i wzbogacamy te białka docelowe. Wykorzystującwidmo masowe o wysokiej rozdzielczościmetry, osiągamy najwyższą dokładność aż do kieszeni wiążących. To nas wyposażabardziej wszechstronne i dokładne informacje, gotowy do odsłonięciathezawiłymechanizmleżące u podstawskładniki aktywne w medycynie chińskiej.
-
Identyfikacja niekowalencyjnych kieszeni wiążących małe cząsteczki w komórkach
Identyfikacja niekowalencyjnych kieszeni wiążących małe cząsteczki w platformach komórkowych. Cechy techniczne platformy komórkowej Określenie sposobu wiązania między lekami małocząsteczkowymi i ich białkami docelowymi ma kluczowe znaczenie dla badań i rozwoju leków. Kompleksowa analiza tych interakcji, zarówno na poziomie strukturalnym, jak i fizykochemicznym, mogłaby znacząco pogłębić naszą wiedzę na temat funkcji białek i ułatwić projektowanie i optymalizację leków. Techniki biologii strukturalnej, w tym promieniowanie rentgenowskie, mikroskopia krioelektronowa… -
Profilowanie całego proteomu dla leków o ukierunkowanej degradacji białek (TPD).
Lek Chimery ukierunkowane na proteolizę (PROTAC) to dwufunkcyjna cząsteczka, która może wiązać się z docelowym białkiem i rekrutować ligazę ubikwitynową E3 do degradacji. Dlatego nowe metody, takie jak PROTAC i klej molekularny, mogą w sposób niezamierzony zmieniać liczebność białek endogennych, co zapewnia nową metodę terapeutyczną w przypadku docelowych białek, zwłaszcza białek, których nie można leczyć. Kompleksowe ilościowe określenie obfitości białek docelowych i poza nimi jest jednym ze standardowych eksperymentów w ramach badań i rozwoju leków TPD.
-
Identyfikacja celów białkowych metodą proteomiki różnicowej
Identyfikacja celów białkowych za pomocą platformy proteomiki różnicowej. Właściwości techniczne Proteomika różnicowa bada zmiany proteomu w różnych stanach fizjologicznych lub patologicznych, takich jak leczenie farmakologiczne lub regulacja genów, poprzez porównanie dwóch lub większej liczby próbek. Podejście to rzuca światło na ważne procesy życiowe lub główne choroby, umożliwiając określenie kluczowych różnych białek, które są uważane za markery analizy jakościowej i funkcjonalnej. Można zidentyfikować tysiące białek...
