-
Profilowanie chemoproteomiczne celów białkowych dla niekowalencyjnych leków małocząsteczkowych
Oddziaływania niekowalencyjne, takie jak wiązania wodorowe i układanie π-π, mogą zostać zakłócone w wyniku denaturacji białek. Aby sprostać temu wyzwaniu, platforma ChomiX wykorzystuje znakowanie fotopowinowactwa, dobrze ugruntowaną technikę precyzyjnego przyłączania „znaczników chemicznych” do miejsca aktywnego białka. Co więcej, innowacyjna strategia sieciowania chemicznego in situ firmy ChomiX przekształca przejściowe niekowalencyjne interakcje białek w kowalencyjne i trwałe wiązania chemiczne. Wykorzystując sondę chemiczną funkcjonalizowaną zarówno fotopowinowactwem, jak i ugrupowaniami bioortogonalnymi, platforma chemoproteomiczna ChomiX wykazała swoją skuteczność w skutecznym wykrywaniu celów białkowych w lizatach komórkowych, tkankach i żywych komórkach. Spektrum bioaktywnych leków małocząsteczkowych stosowanych na platformie obejmuje różnorodne związki, w tym endogenne metabolity, produkty naturalne i niekowalencyjne cząsteczki syntetyczne.
-
Konkurencyjne profilowanie chemoproteomiczne celów białkowych dla kowalencyjnych leków małocząsteczkowych
Podobnie jak w przypadku leków niekowalencyjnych, w przypadku kowalencyjnych leków małocząsteczkowych z powodzeniem zademonstrowano także strategię bezpośredniego ściągania z wykorzystaniem sond chemicznych funkcjonalizowanych grupami reporterowymi. Warto jednak zauważyć, że niektóre leki kowalencyjne nie tolerują modyfikacji chemicznych ze względu na utratę bioaktywności lub niedostępność materiałów syntetycznych. Ponadto utworzone wiązanie kowalencyjne jest zwykle niestabilne podczas wykrywania MS.
Konkurencyjna strategia chemoproteomiczna jest idealną alternatywą, która wykorzystuje uniwersalną sondę opartą na aktywności do znakowania białek. Opracowano specjalne sondy chemiczne reagujące z resztami cysteiny, lizyny, seryny i histydyny. W zasadzie, gdy jest zajęta przez kowalencyjną małą cząsteczkę, reszta aminokwasowa nie może być znakowana przez sondę. W rezultacie cele ON i OFF mogą być kompleksowo identyfikowane za pomocą tej strategii konkurencyjnej z rozdzielczością aminokwasów.
-
Chemoproteomiczne odkrycie nowych struktur wiodących dla celów, których nie da się pokonać
Chemoproteomiczne odkrycie nowych struktur wiodących dla celów, których nie można leczyć. Tło techniczne Obecnie leki zatwierdzone przez FDA są celem leków zatwierdzonych przez FDA, a duża liczba celów związanych z chorobami jest „niepodatna na leczenie”. Ponieważ obecnie większość technologii opiera się na oczyszczonych białkach. Pojawienie się chemproteomiki zrewolucjonizowało odkrywanie leków – od oczyszczonych białek po żywe komórki. Jest w stanie ilościowo analizować interakcje pomiędzy małymi cząsteczkami i...
